97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_R0011 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_R0011  tRNA-Thr  100 
 
 		 73 bp  145  2e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0012  tRNA-Thr  94.52 
 
 		 76 bp  113  6e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.337917 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25010  tRNA-Thr  93.15 
 
 		 76 bp  105  1e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14039  tRNA-Thr  93.15 
 
 		 76 bp  105  1e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.672342  normal  0.0461777 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0049  tRNA-Thr  93.15 
 
 		 73 bp  105  1e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0574229 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0056  tRNA-Thr  93.15 
 
 		 76 bp  105  1e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0218675 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0051  tRNA-Thr  93.15 
 
 		 73 bp  105  1e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.536452  normal  0.0513822 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0053  tRNA-Thr  93.15 
 
 		 73 bp  105  1e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0050  tRNA-Thr  90.41 
 
 		 76 bp  89.7  8e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.573198  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0011  tRNA-Thr  92.06 
 
 		 76 bp  85.7  0.000000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.186323  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_R0051  tRNA-Thr  91.94 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0071  tRNA-Thr  91.94 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_R0064  tRNA-Thr  90.32 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.333908 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0064  tRNA-Thr  90.16 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0082  tRNA-Thr  90.91 
 
 		 73 bp  69.9  0.00000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000900182  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0085  tRNA-Thr  87.84 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.611313 
 
 
-
 
NC_002950  PGt27  tRNA-Thr  95.12 
 
 		 73 bp  65.9  0.000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.938992 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0008  tRNA-Thr  86.3 
 
 		 73 bp  65.9  0.000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.443897  hitchhiker  0.0012739 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0052  tRNA-Thr  90.2 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58710  tRNA-Thr  89.09 
 
 		 73 bp  61.9  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0410722  normal  0.504047 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5158  tRNA-Thr  89.09 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.65124  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0041  tRNA-Thr  89.09 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0015  tRNA-Thr  92.86 
 
 		 73 bp  60  0.00000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0051  tRNA-Thr  87.93 
 
 		 73 bp  60  0.00000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0014  tRNA-Thr  92.86 
 
 		 73 bp  60  0.00000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.133787 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0003  tRNA-Ala  87.93 
 
 		 73 bp  60  0.00000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.10591  normal  0.264536 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0013  tRNA-Thr  87.1 
 
 		 76 bp  60  0.00000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.137492  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0011  tRNA-Thr  87.72 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0056  tRNA-Thr  84.93 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.74619  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0035  tRNA-Thr  88.24 
 
 		 73 bp  54  0.000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0451303  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_R0047  tRNA-Thr  88.24 
 
 		 73 bp  54  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t0158  tRNA-Thr  87.27 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0016  tRNA-Thr  87.3 
 
 		 74 bp  54  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.121936  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_R0021  tRNA-Thr  87.04 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.139674  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19780  tRNA-Ala  86.21 
 
 		 73 bp  52  0.00002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_R0036  tRNA-Thr  87.04 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_R0016  tRNA-Thr  87.04 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.192488  normal  0.776815 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_R0015  tRNA-Thr  87.04 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_R0033  tRNA-Thr  87.04 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0011  tRNA-Thr  85.48 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0024  tRNA-Thr  94.12 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000548413  normal  0.0750081 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0011  tRNA-Thr  85.25 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32560  tRNA-Thr  90.24 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0404  tRNA-Thr  90.24 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.440416  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mflt014  tRNA-Thr  90.24 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.0018476  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_R0052  tRNA-Ser  93.94 
 
 		 71 bp  50.1  0.00007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_60150  tRNA-Thr  85.45 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0042  tRNA-Thr  85.45 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.577114  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_R07  tRNA-Thr  86.27 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0019  tRNA-Ala  100 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt14  tRNA-Thr  86.27 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0023  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.265478  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt03  tRNA-Thr  85.45 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0012  tRNA-Thr  100 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lppt14  tRNA-Thr  86.27 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lppt03  tRNA-Thr  85.45 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0045  tRNA-Ala  100 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0019  tRNA-Thr  86.27 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.000000126539  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0027  tRNA-Thr  85.45 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_R0028  tRNA-Thr  85.45 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0418849 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0028  tRNA-Thr  85.45 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00544508  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0042  tRNA-Ala  100 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.23769  normal  0.415289 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0019  tRNA-Thr  86.27 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0050  tRNA-Thr  85.45 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.130847  hitchhiker  0.00000000426742 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0042  tRNA-Ala  100 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0049  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0254858  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0012  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.453962  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0051  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0870511  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0019  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.23026 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0013  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.298294  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0068  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.781599  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1198  tRNA-Thr  91.18 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_R0041  tRNA-Thr  91.18 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.259143  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0047  tRNA-Ala  100 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.875026  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_R0027  tRNA-Thr  84.48 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0060  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0043  tRNA-Ala  100 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0010  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0964882  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0062  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.170997  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_t0023  tRNA-Thr  91.18 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0046  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.137197 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_R0054  tRNA-Lys  84.48 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0038  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.559626  normal  0.321441 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0057  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0066  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_R0045  tRNA-Thr  91.18 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.579908  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0054  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0032  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.201714 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0038  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.59206  normal  0.592226 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0061  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.284612  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0011  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0002  tRNA-Thr  91.18 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.397812 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00140  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.110426 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32630  tRNA-Ala  100 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.319038  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35760  tRNA-Thr  83.78 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.575984  normal  0.377782 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_R0005  tRNA-Lys  100 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0063  tRNA-Thr  91.18 
 
 		 71 bp  44.1  0.004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.701304 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>