More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_3838 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_3838  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 		 334 aa  669    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4180  NAD-dependent epimerase/dehydratase  55.08 
 
 		 336 aa  337  1.9999999999999998e-91  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10140  oxidoreductase  52.91 
 
 		 340 aa  334  2e-90  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0039  NAD-dependent epimerase/dehydratase  55.08 
 
 		 335 aa  324  1e-87  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4271  NAD-dependent epimerase/dehydratase  51.22 
 
 		 337 aa  325  1e-87  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.874043 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2375  NAD-dependent epimerase/dehydratase  51.65 
 
 		 338 aa  320  1.9999999999999998e-86  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0048  NAD-dependent epimerase/dehydratase  55.38 
 
 		 335 aa  315  9e-85  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0854575 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0029  NAD-dependent epimerase/dehydratase  55.69 
 
 		 335 aa  315  9e-85  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.384866 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5468  NAD-dependent epimerase/dehydratase  50.45 
 
 		 336 aa  312  4.999999999999999e-84  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1108  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.77 
 
 		 343 aa  302  6.000000000000001e-81  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5089  NAD-dependent epimerase/dehydratase  50.45 
 
 		 336 aa  301  1e-80  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5177  NAD-dependent epimerase/dehydratase  50.45 
 
 		 336 aa  301  1e-80  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5705  NAD-dependent epimerase/dehydratase  49.24 
 
 		 339 aa  298  9e-80  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.249261  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1514  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.65 
 
 		 349 aa  287  2e-76  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000791042 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1770  NAD-dependent epimerase/dehydratase  50 
 
 		 342 aa  285  7e-76  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.759605  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1789  NAD-dependent epimerase/dehydratase  49.69 
 
 		 346 aa  283  2.0000000000000002e-75  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0412358  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1836  NAD-dependent epimerase/dehydratase  49.69 
 
 		 346 aa  283  2.0000000000000002e-75  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.311828  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0338  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.08 
 
 		 325 aa  239  5e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0367  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48.68 
 
 		 264 aa  219  5e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.025164 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3152  hopanoid-associated sugar epimerase  36.22 
 
 		 340 aa  187  3e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4170  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.73 
 
 		 358 aa  183  3e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.117289  normal  0.322206 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20730  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase, RmlD  37.99 
 
 		 340 aa  177  3e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.989981  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1830  hopanoid-associated sugar epimerase  36.25 
 
 		 363 aa  175  9.999999999999999e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4897  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.78 
 
 		 333 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7040  hopanoid-associated sugar epimerase  35.44 
 
 		 336 aa  172  5e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000519767 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0022  hypothetical protein  34.27 
 
 		 336 aa  171  2e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0058  dihydrokaempferol 4-reductase  37.12 
 
 		 333 aa  170  4e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3239  hopanoid-associated sugar epimerase  35.26 
 
 		 332 aa  170  4e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.109011 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1280  dihydroflavonol-4-reductase family protein  36.31 
 
 		 338 aa  169  6e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2924  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  36.31 
 
 		 335 aa  169  7e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0488644  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0976  dihydroflavonol-4-reductase family protein  36.31 
 
 		 338 aa  169  8e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1263  dihydroflavonol-4-reductase family protein  36.31 
 
 		 338 aa  169  8e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2241  dihydroflavonol-4-reductase family protein  35.67 
 
 		 338 aa  169  9e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3049  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  36.31 
 
 		 335 aa  169  9e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.138998  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2237  dihydroflavonol-4-reductase family protein  36.31 
 
 		 335 aa  168  9e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2122  hypothetical protein  35.17 
 
 		 329 aa  166  5e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.744824  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4084  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.35 
 
 		 355 aa  166  5e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.129655 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1781  hopanoid-associated sugar epimerase  35.17 
 
 		 329 aa  166  5e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.889296  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0999  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.75 
 
 		 329 aa  162  1e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.170606  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3257  hopanoid-associated sugar epimerase  34.71 
 
 		 335 aa  160  4e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.273856  normal  0.115519 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1741  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.23 
 
 		 328 aa  159  8e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0109  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.39 
 
 		 335 aa  157  2e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5311  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.39 
 
 		 335 aa  157  2e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.114305  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4873  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.39 
 
 		 335 aa  157  2e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5549  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.39 
 
 		 335 aa  157  2e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.482021  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4723  hopanoid-associated sugar epimerase  34.39 
 
 		 335 aa  157  2e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5422  hopanoid-associated sugar epimerase  34.91 
 
 		 328 aa  156  4e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.969886  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4126  hopanoid-associated sugar epimerase  34.08 
 
 		 336 aa  155  6e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5420  hopanoid-associated sugar epimerase  34.08 
 
 		 335 aa  155  6e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7142  hopanoid-associated sugar epimerase  35.4 
 
 		 347 aa  155  1e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.516154  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1958  dihydroflavonol-4-reductase family protein  36.62 
 
 		 335 aa  153  4e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.169655  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1019  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.77 
 
 		 328 aa  152  1e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0121  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.39 
 
 		 361 aa  150  3e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0687  dihydroflavonol 4-reductase, putative  31.76 
 
 		 328 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0174586  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0884  hopanoid-associated sugar epimerase  31.45 
 
 		 329 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000222195 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6351  hopanoid-associated sugar epimerase  34.48 
 
 		 345 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.184602 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3939  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.62 
 
 		 352 aa  147  3e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.0000297127  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2821  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.46 
 
 		 328 aa  147  4.0000000000000006e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0273473  normal  0.296393 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3361  hopanoid-associated sugar epimerase  31.25 
 
 		 329 aa  147  4.0000000000000006e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0322515  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1190  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.5 
 
 		 355 aa  146  6e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.407115  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2234  hopanoid-associated sugar epimerase  30.82 
 
 		 329 aa  142  6e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00968457  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2372  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.08 
 
 		 339 aa  141  9.999999999999999e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1940  hopanoid-associated sugar epimerase  33.54 
 
 		 341 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1207  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.76 
 
 		 339 aa  140  1.9999999999999998e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0228638  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2444  hopanoid-associated sugar epimerase  34.58 
 
 		 329 aa  141  1.9999999999999998e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0864  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.76 
 
 		 328 aa  140  3.9999999999999997e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2216  hopanoid-associated sugar epimerase  33.23 
 
 		 341 aa  139  7.999999999999999e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.313238  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1900  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.4 
 
 		 358 aa  137  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0547255  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2985  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.25 
 
 		 319 aa  137  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2281  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.68 
 
 		 330 aa  137  3.0000000000000003e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1831  hopanoid-associated sugar epimerase  33.23 
 
 		 341 aa  136  4e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2029  hopanoid-associated sugar epimerase  29.88 
 
 		 329 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2055  hopanoid-associated sugar epimerase  29.88 
 
 		 329 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2547  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  29.87 
 
 		 334 aa  134  3e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000238477  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2986  oxidoreductase, putative  32.43 
 
 		 349 aa  132  6.999999999999999e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0471013 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2707  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.14 
 
 		 342 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.529174  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5153  hopanoid-associated sugar epimerase  30.34 
 
 		 342 aa  131  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1218  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  30.58 
 
 		 327 aa  124  2e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1008  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase family protein  31.61 
 
 		 338 aa  122  6e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.720845  normal  0.076451 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1339  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.4 
 
 		 331 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1328  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.41 
 
 		 329 aa  116  6.9999999999999995e-25  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0300237  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1353  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.79 
 
 		 331 aa  116  6.9999999999999995e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1833  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.94 
 
 		 335 aa  115  7.999999999999999e-25  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0898  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.31 
 
 		 342 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.793849  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3275  hopanoid-associated sugar epimerase  30.62 
 
 		 328 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3280  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.67 
 
 		 322 aa  115  1.0000000000000001e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.733793  normal  0.122087 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0793  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase family protein  28.31 
 
 		 331 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2599  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.4 
 
 		 324 aa  113  5e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1267  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.07 
 
 		 330 aa  110  4.0000000000000004e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1458  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  28 
 
 		 329 aa  108  1e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000901734  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0690  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.79 
 
 		 326 aa  108  1e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2441  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.77 
 
 		 333 aa  108  2e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.989614  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1017  nucleoside diphosphate sugar epimerase family protein  27.74 
 
 		 328 aa  103  3e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.582194  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2604  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.03 
 
 		 324 aa  103  3e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.118857 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5260  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.48 
 
 		 324 aa  103  3e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.552356  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3249  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.67 
 
 		 339 aa  102  1e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0678518 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0825  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.14 
 
 		 347 aa  102  1e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.862979  normal  0.686614 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1952  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.65 
 
 		 341 aa  101  2e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.755227  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2099  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  31.87 
 
 		 330 aa  101  2e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0931539  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0180  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.36 
 
 		 333 aa  99.8  6e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.094979  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>