More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_0367 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_0367  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
264 aa  536  1e-151  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.025164 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0338  NAD-dependent epimerase/dehydratase  89.31 
 
 
325 aa  483  1e-135  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1789  NAD-dependent epimerase/dehydratase  64.37 
 
 
346 aa  343  2e-93  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0412358  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1836  NAD-dependent epimerase/dehydratase  64.37 
 
 
346 aa  343  2e-93  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.311828  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1770  NAD-dependent epimerase/dehydratase  64.37 
 
 
342 aa  342  2.9999999999999997e-93  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.759605  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4180  NAD-dependent epimerase/dehydratase  53.46 
 
 
336 aa  270  2e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1514  NAD-dependent epimerase/dehydratase  53.08 
 
 
349 aa  266  2.9999999999999995e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000791042 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4271  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48.09 
 
 
337 aa  244  6.999999999999999e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.874043 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0039  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48.85 
 
 
335 aa  234  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0048  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48.85 
 
 
335 aa  233  3e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0854575 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0029  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48.85 
 
 
335 aa  231  7.000000000000001e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.384866 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2375  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.01 
 
 
338 aa  224  1e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10140  oxidoreductase  42.91 
 
 
340 aa  201  9e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5468  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.41 
 
 
336 aa  199  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1108  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.49 
 
 
343 aa  195  5.000000000000001e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3838  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48.68 
 
 
334 aa  194  1e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5089  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.02 
 
 
336 aa  190  2e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5177  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.02 
 
 
336 aa  190  2e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5705  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.98 
 
 
339 aa  176  3e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.249261  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1830  hopanoid-associated sugar epimerase  36.07 
 
 
363 aa  152  4e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20730  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase, RmlD  37.05 
 
 
340 aa  135  6.0000000000000005e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.989981  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0058  dihydrokaempferol 4-reductase  33.33 
 
 
333 aa  126  3e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3152  hopanoid-associated sugar epimerase  31.98 
 
 
340 aa  124  2e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2122  hypothetical protein  33.33 
 
 
329 aa  124  2e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.744824  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1781  hopanoid-associated sugar epimerase  33.33 
 
 
329 aa  124  2e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.889296  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4897  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.97 
 
 
333 aa  122  4e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4084  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.65 
 
 
355 aa  122  4e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.129655 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3361  hopanoid-associated sugar epimerase  30.08 
 
 
329 aa  119  3e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0322515  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2821  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.55 
 
 
328 aa  118  7.999999999999999e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0273473  normal  0.296393 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7040  hopanoid-associated sugar epimerase  29.43 
 
 
336 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000519767 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0687  dihydroflavonol 4-reductase, putative  30.3 
 
 
328 aa  116  3e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0174586  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4170  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.6 
 
 
358 aa  115  5e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.117289  normal  0.322206 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5422  hopanoid-associated sugar epimerase  34.13 
 
 
328 aa  115  6e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.969886  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2444  hopanoid-associated sugar epimerase  32.84 
 
 
329 aa  115  7.999999999999999e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0022  hypothetical protein  29.43 
 
 
336 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0884  hopanoid-associated sugar epimerase  29.69 
 
 
329 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000222195 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1280  dihydroflavonol-4-reductase family protein  32.82 
 
 
338 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3049  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  32.44 
 
 
335 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.138998  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1958  dihydroflavonol-4-reductase family protein  32.82 
 
 
335 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.169655  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2237  dihydroflavonol-4-reductase family protein  32.82 
 
 
335 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0976  dihydroflavonol-4-reductase family protein  32.82 
 
 
338 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2924  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  32.82 
 
 
335 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0488644  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1263  dihydroflavonol-4-reductase family protein  32.82 
 
 
338 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4126  hopanoid-associated sugar epimerase  30.68 
 
 
336 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6351  hopanoid-associated sugar epimerase  34.26 
 
 
345 aa  112  6e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.184602 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1019  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.41 
 
 
328 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4873  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.26 
 
 
335 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5420  hopanoid-associated sugar epimerase  32.26 
 
 
335 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7142  hopanoid-associated sugar epimerase  32.27 
 
 
347 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.516154  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0109  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.26 
 
 
335 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4723  hopanoid-associated sugar epimerase  32.26 
 
 
335 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5311  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.26 
 
 
335 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.114305  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3257  hopanoid-associated sugar epimerase  32.26 
 
 
335 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.273856  normal  0.115519 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5549  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.26 
 
 
335 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.482021  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3239  hopanoid-associated sugar epimerase  30.74 
 
 
332 aa  108  7.000000000000001e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.109011 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2281  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.74 
 
 
330 aa  108  9.000000000000001e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1940  hopanoid-associated sugar epimerase  32.13 
 
 
341 aa  108  1e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1831  hopanoid-associated sugar epimerase  32.13 
 
 
341 aa  107  1e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0999  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.64 
 
 
329 aa  107  2e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.170606  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2216  hopanoid-associated sugar epimerase  31.73 
 
 
341 aa  105  5e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.313238  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0864  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29 
 
 
328 aa  105  5e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2241  dihydroflavonol-4-reductase family protein  29.43 
 
 
338 aa  105  8e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1190  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.63 
 
 
355 aa  104  1e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.407115  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1741  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.68 
 
 
328 aa  102  5e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1353  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.26 
 
 
331 aa  102  8e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0793  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase family protein  29.53 
 
 
331 aa  101  1e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5260  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.65 
 
 
324 aa  101  1e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.552356  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0121  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.34 
 
 
361 aa  100  2e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2234  hopanoid-associated sugar epimerase  26.34 
 
 
329 aa  99.4  5e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00968457  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1303  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.69 
 
 
333 aa  98.2  1e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.956027  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1008  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase family protein  29.69 
 
 
338 aa  97.8  2e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.720845  normal  0.076451 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2372  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.04 
 
 
339 aa  95.5  7e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2985  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.91 
 
 
319 aa  94.4  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2441  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.09 
 
 
333 aa  91.7  1e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.989614  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1339  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.85 
 
 
331 aa  90.5  2e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3021  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.79 
 
 
349 aa  87.8  1e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1033  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.92 
 
 
332 aa  87.4  2e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.19855 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5153  hopanoid-associated sugar epimerase  28.98 
 
 
342 aa  87  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2029  hopanoid-associated sugar epimerase  26.48 
 
 
329 aa  83.2  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2055  hopanoid-associated sugar epimerase  26.48 
 
 
329 aa  83.2  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3275  hopanoid-associated sugar epimerase  31.17 
 
 
328 aa  82.8  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1267  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.2 
 
 
330 aa  80.9  0.00000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3823  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.48 
 
 
329 aa  80.1  0.00000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2986  oxidoreductase, putative  29.71 
 
 
349 aa  77  0.0000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0471013 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2707  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.71 
 
 
342 aa  77  0.0000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.529174  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3939  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.05 
 
 
352 aa  76.6  0.0000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.0000297127  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3249  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.74 
 
 
339 aa  74.7  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0678518 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2599  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.28 
 
 
324 aa  75.1  0.000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1833  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.24 
 
 
335 aa  74.3  0.000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1218  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  28.35 
 
 
327 aa  74.3  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0274  dihydroflavonol 4-reductase family protein  29.51 
 
 
354 aa  73.6  0.000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.522156 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1207  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.09 
 
 
339 aa  72.4  0.000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0228638  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2562  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.68 
 
 
392 aa  71.6  0.00000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3280  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.07 
 
 
322 aa  71.2  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.733793  normal  0.122087 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0433  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.5 
 
 
333 aa  70.1  0.00000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1952  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.46 
 
 
341 aa  70.1  0.00000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.755227  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1328  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.27 
 
 
329 aa  70.1  0.00000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0300237  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8881  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.56 
 
 
341 aa  69.3  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.282171  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2547  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  26.79 
 
 
334 aa  69.3  0.00000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000238477  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1211  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.81 
 
 
347 aa  69.3  0.00000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>