73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_2290 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_2290  lipid A biosynthesis acyltransferase  100 
 
 		 319 aa  646    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.146974  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2284  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  60.74 
 
 		 307 aa  344  1e-93  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2292  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  60.74 
 
 		 307 aa  344  1e-93  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.218665  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2245  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  60.74 
 
 		 307 aa  344  1e-93  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1922  lipid A biosynthesis acyltransferase  58.94 
 
 		 303 aa  339  4e-92  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2561  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  55.97 
 
 		 314 aa  323  2e-87  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.995658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12630  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  54.67 
 
 		 316 aa  313  2.9999999999999996e-84  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3835  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  54.64 
 
 		 317 aa  312  4.999999999999999e-84  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0338781 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2093  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  54.36 
 
 		 310 aa  289  6e-77  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.124836  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14960  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  52.07 
 
 		 307 aa  269  5e-71  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3419  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  46.8 
 
 		 342 aa  234  1.0000000000000001e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000119507  hitchhiker  0.000028719 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5153  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  49.46 
 
 		 286 aa  233  3e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0563647  decreased coverage  0.000104531 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2073  lipid A biosynthesis acyltransferase  47.37 
 
 		 320 aa  229  5e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.343733  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0820  lipid A biosynthesis acyltransferase  45.02 
 
 		 404 aa  228  1e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.539919  normal  0.0772166 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2101  lipid A biosynthesis acyltransferase  45.82 
 
 		 304 aa  228  1e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00461081  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3185  lipid A biosynthesis acyltransferase  47.06 
 
 		 335 aa  224  2e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6125  Lauroyl/myristoyl acyltransferase-like protein  44.55 
 
 		 304 aa  223  4.9999999999999996e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.226979  normal  0.687421 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1774  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  44.52 
 
 		 310 aa  221  9.999999999999999e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0198812 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2344  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  43.23 
 
 		 355 aa  217  2e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1363  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  46.78 
 
 		 292 aa  216  2.9999999999999998e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.698598  normal  0.399263 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1787  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  44.18 
 
 		 310 aa  216  4e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2102  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  47.93 
 
 		 307 aa  201  9.999999999999999e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.995802  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1354  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  46.32 
 
 		 328 aa  197  3e-49  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.499374  normal  0.216227 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2406  lipid A biosynthesis acyltransferase  42.81 
 
 		 300 aa  190  2e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.315761  normal  0.0298748 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3063  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  37.26 
 
 		 311 aa  161  2e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0505202  normal  0.2304 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1786  lipid A biosynthesis acyltransferase  37.25 
 
 		 337 aa  156  4e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.175818  normal  0.0660981 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17440  Lauroyl/myristoyl acyltransferase  37.68 
 
 		 317 aa  145  6e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0985707 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1375  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  33.46 
 
 		 318 aa  117  3e-25  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.015073  normal  0.0495173 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1982  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  33.33 
 
 		 328 aa  116  5e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.859869  hitchhiker  0.00608029 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1659  lipid A biosynthesis acyltransferase  31.58 
 
 		 326 aa  104  2e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.168332  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1224  lipid A biosynthesis acyltransferase  32.88 
 
 		 234 aa  92.4  8e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0999  lipid A biosynthesis acyltransferase  28.92 
 
 		 290 aa  79.3  0.00000000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2207  lipid A biosynthesis acyltransferase  26.36 
 
 		 302 aa  69.3  0.00000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3613  lipid A biosynthesis acyltransferase  24.81 
 
 		 300 aa  64.7  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3368  lipid A biosynthesis acyltransferase  26.63 
 
 		 288 aa  60.8  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00130747  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0243  hypothetical protein  25.77 
 
 		 299 aa  60.1  0.00000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.185931  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0207  lipid A biosynthesis acyltransferase  25.48 
 
 		 331 aa  59.7  0.00000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000206716 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1688  hypothetical protein  25.27 
 
 		 297 aa  58.2  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.426385  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3026  lipid A biosynthesis acyltransferase  27.23 
 
 		 316 aa  56.6  0.0000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1810  lipid A biosynthesis acyltransferase  23.86 
 
 		 306 aa  56.2  0.0000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2698  lipid A biosynthesis acyltransferase  26.56 
 
 		 295 aa  56.2  0.0000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.011241  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0091  lipid A biosynthesis acyltransferase  28.34 
 
 		 324 aa  54.7  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  3.20125e-16  hitchhiker  0.00000076375 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0224  lipid A biosynthesis acyltransferase  23.16 
 
 		 331 aa  53.9  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2793  lipid A biosynthesis acyltransferase  26.04 
 
 		 295 aa  53.9  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0376  lipid A biosynthesis acyltransferase  23.72 
 
 		 299 aa  53.5  0.000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.625905 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3420  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase, putative  28.18 
 
 		 307 aa  52  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3534  lipid A biosynthesis acyltransferase  28.81 
 
 		 308 aa  52.4  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0623  lipid A biosynthesis acyltransferase  23.05 
 
 		 319 aa  52  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.791174  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2612  lipid A biosynthesis acyltransferase  25.52 
 
 		 295 aa  51.6  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0125544  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0631  lipid A biosynthesis acyltransferase  24.47 
 
 		 306 aa  50.1  0.00005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0577087 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0343  lipid A biosynthesis acyltransferase  24 
 
 		 301 aa  49.7  0.00006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.725626 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0495  lipid A biosynthesis acyltransferase  21.39 
 
 		 294 aa  48.5  0.0001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4217  lipid A biosynthesis acyltransferase  23.6 
 
 		 284 aa  48.9  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.557701  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2280  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase (heat shock protein)  24.57 
 
 		 307 aa  48.9  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.56438 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3056  lipid A biosynthesis acyltransferase  25.11 
 
 		 315 aa  48.1  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.605153 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1181  hypothetical protein  25.54 
 
 		 273 aa  47.8  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.523374  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1222  lipid A biosynthesis acyltransferase  25.56 
 
 		 308 aa  48.5  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.413151  normal  0.21215 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5430  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  27.88 
 
 		 309 aa  47.4  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0271  lipid A biosynthesis acyltransferase  23.72 
 
 		 307 aa  47  0.0004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1946  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  26.67 
 
 		 300 aa  47  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.296103  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0661  lipid A biosynthesis acyltransferase  26.95 
 
 		 282 aa  46.2  0.0008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0888578  hitchhiker  0.00380684 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1276  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  20.47 
 
 		 295 aa  45.8  0.001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.180229  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3251  putative acyltransferase  30.61 
 
 		 291 aa  45.4  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1563  lipid A biosynthesis acyltransferase  21.6 
 
 		 281 aa  45.4  0.001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1008  lipid A biosynthesis acyltransferase  23.83 
 
 		 306 aa  45.8  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3230  lipid A biosynthesis acyltransferase  23.32 
 
 		 318 aa  44.7  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4383  lipid A biosynthesis acyltransferase  23.26 
 
 		 343 aa  44.7  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0399697  normal  0.120258 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0587  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  20.47 
 
 		 295 aa  44.7  0.002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4089  lipid A biosynthesis acyltransferase  26.32 
 
 		 326 aa  44.3  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.230005 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2620  lipid A biosynthesis acyltransferase  28.57 
 
 		 308 aa  43.5  0.005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.4407 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5098  hypothetical protein  30.58 
 
 		 315 aa  43.5  0.005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2275  lipid A biosynthesis acyltransferase  23.6 
 
 		 293 aa  43.5  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.547886  normal  0.134069 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3518  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  25.73 
 
 		 310 aa  42.4  0.01  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.771085  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>