More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_1128 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_1128  protein of unknown function DUF140  100 
 
 		 268 aa  519  1e-146  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2250  protein of unknown function DUF140  76.69 
 
 		 267 aa  392  1e-108  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6634  protein of unknown function DUF140  68.38 
 
 		 260 aa  360  1e-98  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.451559  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03700  ABC-type transport system involved in resistance to organic solvents, permease component  71.66 
 
 		 250 aa  358  4e-98  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.270229  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4348  protein of unknown function DUF140  64.07 
 
 		 285 aa  349  2e-95  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09380  ABC-type transport system involved in resistance to organic solvents, permease component  65.92 
 
 		 267 aa  329  3e-89  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0701  hypothetical protein  69.49 
 
 		 261 aa  323  3e-87  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0856  hypothetical protein  60.16 
 
 		 253 aa  303  3.0000000000000004e-81  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.792912 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2826  hypothetical protein  59.02 
 
 		 257 aa  277  2e-73  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2506  hypothetical protein  51.82 
 
 		 269 aa  258  7e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.423121 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13535  integral membrane protein YrbE4a  51.46 
 
 		 254 aa  252  5.000000000000001e-66  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000148357 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1554  hypothetical protein  52.36 
 
 		 237 aa  252  5.000000000000001e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5204  hypothetical protein  52.79 
 
 		 237 aa  249  3e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.217332 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4619  hypothetical protein  51.67 
 
 		 254 aa  249  4e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4707  hypothetical protein  51.67 
 
 		 254 aa  249  4e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3952  protein of unknown function DUF140  54.42 
 
 		 254 aa  248  6e-65  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2988  protein of unknown function DUF140  52.03 
 
 		 285 aa  247  1e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2849  hypothetical protein  49.59 
 
 		 270 aa  247  2e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5002  hypothetical protein  51.25 
 
 		 254 aa  245  4.9999999999999997e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4152  hypothetical protein  52.23 
 
 		 269 aa  245  4.9999999999999997e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3830  protein of unknown function DUF140  49.03 
 
 		 267 aa  244  9e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3673  hypothetical protein  49.59 
 
 		 270 aa  241  1e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3746  hypothetical protein  49.59 
 
 		 270 aa  241  1e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.507857  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3686  hypothetical protein  49.59 
 
 		 270 aa  240  2e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.86718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4540  hypothetical protein  49.59 
 
 		 270 aa  239  2.9999999999999997e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.113009 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0264  hypothetical protein  50.41 
 
 		 256 aa  238  8e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.720653 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0273  hypothetical protein  50.41 
 
 		 256 aa  238  8e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0283  hypothetical protein  50.41 
 
 		 256 aa  238  8e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.23346 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10168  integral membrane protein YrbE1a  48.12 
 
 		 265 aa  227  1e-58  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4606  hypothetical protein  47.26 
 
 		 255 aa  224  1e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.809194  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10598  integral membrane protein YrbE2a  46.67 
 
 		 265 aa  224  1e-57  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4172  hypothetical protein  46.69 
 
 		 257 aa  223  3e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0713  hypothetical protein  47.66 
 
 		 265 aa  222  4e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2099  hypothetical protein  45.57 
 
 		 255 aa  221  9.999999999999999e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.26077  normal  0.522283 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0132  hypothetical protein  46.44 
 
 		 265 aa  221  9.999999999999999e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.99032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1625  hypothetical protein  46.09 
 
 		 266 aa  219  5e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1650  hypothetical protein  46.09 
 
 		 266 aa  219  5e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0498  hypothetical protein  46.09 
 
 		 269 aa  219  5e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0382697  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1676  hypothetical protein  46.09 
 
 		 266 aa  219  5e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.277826  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0654  hypothetical protein  48.65 
 
 		 269 aa  216  2e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0633475  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3025  ABC-type transport system involved in resistance to organic solvents permease component-like protein  46.97 
 
 		 269 aa  216  4e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.753078  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4401  hypothetical protein  44.53 
 
 		 250 aa  216  4e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1522  hypothetical protein  46.4 
 
 		 271 aa  214  9e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.926137  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1545  hypothetical protein  46.4 
 
 		 271 aa  214  9e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0361  hypothetical protein  42.63 
 
 		 256 aa  212  3.9999999999999995e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0520  protein of unknown function DUF140  47.6 
 
 		 262 aa  212  7e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4190  hypothetical protein  47.75 
 
 		 255 aa  211  1e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.731627  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0957  hypothetical protein  46.52 
 
 		 281 aa  209  3e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3984  hypothetical protein  41.22 
 
 		 257 aa  205  7e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0106  hypothetical protein  46.44 
 
 		 265 aa  202  5e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.963801 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0116  hypothetical protein  46.44 
 
 		 265 aa  202  5e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.239683  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0125  hypothetical protein  46.44 
 
 		 265 aa  202  5e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.288689  normal  0.150892 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0012  hypothetical protein  43.93 
 
 		 312 aa  202  6e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.261504  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1246  protein of unknown function DUF140  47.27 
 
 		 285 aa  202  7e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.869523  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4170  protein of unknown function DUF140  44.27 
 
 		 285 aa  186  3e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3789  protein of unknown function DUF140  44.49 
 
 		 272 aa  178  9e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0920  hypothetical protein  50.92 
 
 		 255 aa  173  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.403471 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1221  protein of unknown function DUF140  46.01 
 
 		 349 aa  171  1e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0833  hypothetical protein  42.28 
 
 		 297 aa  153  2e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1620  protein of unknown function DUF140  39.09 
 
 		 246 aa  146  3e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.346599  normal  0.915848 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0676  protein of unknown function DUF140  33.89 
 
 		 256 aa  145  7.0000000000000006e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.496775 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2297  hypothetical protein  32.38 
 
 		 270 aa  135  7.000000000000001e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.346227  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0705  protein of unknown function DUF140  31.84 
 
 		 269 aa  129  5.0000000000000004e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.316668  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0708  protein of unknown function DUF140  36.08 
 
 		 272 aa  129  6e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.356543  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11995  integral membrane protein YrbE3a  46.62 
 
 		 141 aa  129  7.000000000000001e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1863  ABC amino acid transporter, inner membrane subunit  30.77 
 
 		 251 aa  126  3e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.685467  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1976  hypothetical protein  32.51 
 
 		 250 aa  125  7e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.45767  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1997  protein of unknown function DUF140  30.34 
 
 		 251 aa  124  1e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3181  protein of unknown function DUF140  28.92 
 
 		 261 aa  124  2e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.35104  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2082  protein of unknown function DUF140  30.34 
 
 		 251 aa  124  2e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1812  protein of unknown function DUF140  31.48 
 
 		 271 aa  124  2e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.402733 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5283  protein of unknown function DUF140  31.45 
 
 		 264 aa  124  2e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.125379 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2986  ABC transporter, permease  32.68 
 
 		 263 aa  124  2e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1039  hypothetical protein  30.04 
 
 		 256 aa  121  9.999999999999999e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4314  hypothetical protein  31.2 
 
 		 252 aa  120  1.9999999999999998e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.450744  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3314  protein of unknown function DUF140  33.33 
 
 		 245 aa  120  3e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.602612  hitchhiker  0.000176122 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0327  hypothetical protein  30.99 
 
 		 258 aa  119  4.9999999999999996e-26  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.650486  normal  0.733671 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0852  protein of unknown function DUF140  29.67 
 
 		 267 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0347867 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1816  hypothetical protein  30.33 
 
 		 267 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0190  protein of unknown function DUF140  32.44 
 
 		 262 aa  116  3.9999999999999997e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.126608  normal  0.454528 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0741  protein of unknown function DUF140  29.92 
 
 		 267 aa  115  7.999999999999999e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.121135  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0562  hypothetical protein  31.92 
 
 		 256 aa  115  8.999999999999998e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000209401  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3706  hypothetical protein  30.89 
 
 		 258 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.311916  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1687  hypothetical protein  31.96 
 
 		 263 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0408  hypothetical protein  32.64 
 
 		 257 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4068  protein of unknown function DUF140  32.88 
 
 		 263 aa  113  3e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4107  protein of unknown function DUF140  32.88 
 
 		 263 aa  113  3e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.2496  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0797  protein of unknown function DUF140  31.33 
 
 		 269 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.841347  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0817  hypothetical protein  31.08 
 
 		 257 aa  112  5e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.879823  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3483  hypothetical protein  32.62 
 
 		 257 aa  112  7.000000000000001e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0788  hypothetical protein  31.22 
 
 		 257 aa  112  8.000000000000001e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4625  hypothetical protein  30.27 
 
 		 376 aa  112  9e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.306336  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1271  hypothetical protein  28.91 
 
 		 255 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.584401  hitchhiker  0.000000000788442 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0473  hypothetical protein  32.44 
 
 		 258 aa  111  1.0000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000261611  unclonable  0.00000724337 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2450  hypothetical protein  31.02 
 
 		 266 aa  110  3e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0989  hypothetical protein  28.57 
 
 		 260 aa  108  7.000000000000001e-23  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.348409  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3513  ABC transporter, inner membrane subunit  28.69 
 
 		 255 aa  108  1e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.525641  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1524  hypothetical protein  33.65 
 
 		 261 aa  108  1e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0162884  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2890  hypothetical protein  30.91 
 
 		 258 aa  107  3e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1871  protein of unknown function DUF140  28.77 
 
 		 264 aa  107  3e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0106887 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>