130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_0755 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_0755  Methyltransferase type 11  100 
 
 
270 aa  533  1e-150  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4407  methyltransferase type 11  62.31 
 
 
270 aa  308  6.999999999999999e-83  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.424506  normal  0.53534 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4299  methyltransferase type 11  61.85 
 
 
266 aa  293  2e-78  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12641  methyltransferase  59.69 
 
 
273 aa  291  6e-78  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2049  methyltransferase type 11  61.45 
 
 
266 aa  290  2e-77  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.495254 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1187  methyltransferase type 11  53.52 
 
 
265 aa  250  2e-65  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4465  methyltransferase type 11  52.4 
 
 
269 aa  244  9.999999999999999e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.375613  normal  0.0124267 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0817  methyltransferase type 11  49.62 
 
 
282 aa  236  3e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000364558 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1727  Methyltransferase type 11  45.97 
 
 
260 aa  229  4e-59  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.312488  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2036  Methyltransferase type 11  48.4 
 
 
255 aa  200  3e-50  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4553  methyltransferase  36.29 
 
 
261 aa  147  2.0000000000000003e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.749759  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2776  Methyltransferase type 11  35.46 
 
 
254 aa  145  6e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.516724  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2470  Methyltransferase type 11  35.86 
 
 
254 aa  144  1e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.225805  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0744  Methyltransferase type 11  34.52 
 
 
248 aa  132  5e-30  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0330334  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0252  hypothetical protein  29.69 
 
 
253 aa  114  2.0000000000000002e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0258  hypothetical protein  29.69 
 
 
253 aa  114  2.0000000000000002e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4452  methyltransferase type 11  35.84 
 
 
277 aa  66.6  0.0000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3590  hypothetical protein  28.49 
 
 
239 aa  66.2  0.0000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.15692 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1625  hypothetical protein  30.05 
 
 
239 aa  65.5  0.0000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.207342 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3339  methyltransferase  28.49 
 
 
239 aa  65.1  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2241  methyltransferase type 11  28.72 
 
 
239 aa  63.2  0.000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.602908  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3376  hypothetical protein  27.37 
 
 
239 aa  60.5  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3290  methyltransferase  26.82 
 
 
239 aa  60.5  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3641  hypothetical protein  27.37 
 
 
239 aa  60.5  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3269  methyltransferase type 11  26.78 
 
 
239 aa  60.1  0.00000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.20677  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3693  hypothetical protein  28.57 
 
 
239 aa  60.1  0.00000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.336986  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3607  hypothetical protein  28.49 
 
 
239 aa  59.3  0.00000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2386  Methyltransferase type 11  28.5 
 
 
301 aa  57  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000258424  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4893  methyltransferase type 11  31.76 
 
 
274 aa  56.6  0.0000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal  0.242267 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2596  methyltransferase type 11  33.7 
 
 
271 aa  56.2  0.0000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0340316  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13866  hypothetical protein  35 
 
 
191 aa  56.2  0.0000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0507  Methyltransferase type 11  34.51 
 
 
258 aa  55.8  0.0000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.459981  hitchhiker  0.00000192307 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3600  hypothetical protein  27.37 
 
 
239 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2312  methyltransferase type 11  37.76 
 
 
276 aa  55.1  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1548  methyltransferase type 11  36 
 
 
225 aa  54.3  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5386  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 
355 aa  54.3  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3423  Methyltransferase type 11  33.98 
 
 
241 aa  53.9  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.248602  normal  0.101773 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5517  methyltransferase type 11  36.67 
 
 
228 aa  53.9  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.550452  normal  0.719059 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3510  methyltransferase type 11  35.54 
 
 
282 aa  52.8  0.000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1228  arsenite S-adenosylmethyltransferase  27.22 
 
 
277 aa  52.4  0.000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1201  arsenite S-adenosylmethyltransferase  26.02 
 
 
270 aa  52.4  0.000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1559  Methyltransferase type 11  34.4 
 
 
233 aa  52.4  0.000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0523794  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2794  methyltransferase type 11  32.45 
 
 
271 aa  52  0.000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.148231  hitchhiker  0.000692591 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3346  Methyltransferase type 11  30.21 
 
 
265 aa  51.6  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.408224  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12966  methyltransferase  36.29 
 
 
270 aa  52  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1590  methyltransferase type 11  33.14 
 
 
267 aa  52  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0597949 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1472  Methyltransferase type 11  29.77 
 
 
242 aa  50.8  0.00002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0623  methyltransferase type 11  27.71 
 
 
278 aa  51.6  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0996998 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1985  methyltransferase type 11  31.28 
 
 
261 aa  51.2  0.00002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0477  Methyltransferase type 11  32.71 
 
 
235 aa  51.2  0.00002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3376  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 
256 aa  51.2  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0407493  hitchhiker  0.00438973 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0321  Methyltransferase type 11  27.91 
 
 
207 aa  50.4  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3275  Methyltransferase type 11  33.9 
 
 
271 aa  50.4  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.477394  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0328  Methyltransferase type 11  27.91 
 
 
207 aa  50.4  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3422  arsenite S-adenosylmethyltransferase  28.87 
 
 
271 aa  50.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.352558  normal  0.929536 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1633  methyltransferase type 11  32.95 
 
 
409 aa  50.1  0.00004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0334927  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5595  Methyltransferase type 11  30.23 
 
 
239 aa  50.1  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4080  arsenite S-adenosylmethyltransferase  27.75 
 
 
283 aa  50.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.214239  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1968  arsenite S-adenosylmethyltransferase  27.23 
 
 
276 aa  49.7  0.00005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.429307  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1224  methyltransferase type 11  35.05 
 
 
282 aa  49.7  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.158383  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0253  MarR family transcriptional regulator  29.03 
 
 
411 aa  49.3  0.00006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0159637  normal  0.716874 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2880  methyltransferase type 11  36.67 
 
 
246 aa  49.3  0.00006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3249  Methyltransferase type 11  31.48 
 
 
382 aa  49.3  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1420  arsenite S-adenosylmethyltransferase  26.58 
 
 
280 aa  49.3  0.00007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0266  methyltransferase type 11  26.75 
 
 
279 aa  48.9  0.00008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.608985  normal  0.806838 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4050  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  25.26 
 
 
261 aa  48.9  0.00008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0402  UbiE/COQ5 family methlytransferase  22.84 
 
 
200 aa  48.1  0.0001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1577  methyltransferase type 11  27.44 
 
 
301 aa  48.5  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0911179  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2184  Methyltransferase type 11  28.77 
 
 
293 aa  48.9  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0767  Methyltransferase type 11  34.19 
 
 
194 aa  47.8  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.763548  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2552  Methyltransferase type 11  28.3 
 
 
263 aa  47.4  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.318811 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0381  methyltransferase type 11  23.46 
 
 
200 aa  46.6  0.0004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10291  methyltransferase  26.56 
 
 
352 aa  47  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.55915 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0718  glycosyl transferase family protein  37 
 
 
1106 aa  46.2  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.411794  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1559  hypothetical protein  32.45 
 
 
208 aa  46.2  0.0006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.00538046  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3154  hypothetical protein  41.18 
 
 
221 aa  46.2  0.0006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1202  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  25.32 
 
 
277 aa  46.2  0.0006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0703  ubiE/COQ5 methyltransferase family protein  41.18 
 
 
221 aa  46.2  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.161122  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0124  UbiE/COQ5 family methlytransferase  41.18 
 
 
221 aa  46.2  0.0006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.528868  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1464  UbiE/COQ5 family methlytransferase  41.18 
 
 
221 aa  46.2  0.0006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2892  UbiE/COQ5 family methlytransferase  41.18 
 
 
221 aa  46.2  0.0006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3246  Methyltransferase type 11  39.62 
 
 
255 aa  46.2  0.0006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00392072  normal  0.0412956 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0519  UbiE/COQ5 family methlytransferase  41.18 
 
 
221 aa  45.8  0.0007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.421388  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0537  UbiE/COQ5 family methlytransferase  41.18 
 
 
221 aa  45.8  0.0007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.406886  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2610  transcriptional regulator, ArsR family  28.12 
 
 
309 aa  45.8  0.0007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.184924 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11556  methyltransferase  34.78 
 
 
347 aa  45.4  0.0009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5499  Methyltransferase type 11  29.14 
 
 
196 aa  45.4  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.456016  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2754  biotin biosynthesis protein BioC  27.86 
 
 
272 aa  45.1  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.32969  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2169  methyltransferase type 11  26.19 
 
 
210 aa  44.7  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0325  Methyltransferase type 11  29.25 
 
 
271 aa  45.1  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00246537  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_345  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  22.22 
 
 
200 aa  45.1  0.001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1926  Methyltransferase type 11  42.11 
 
 
281 aa  45.1  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0165  UbiE/COQ5 methyltransferase  27.55 
 
 
283 aa  44.7  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.119395  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0104  Methyltransferase type 11  31 
 
 
260 aa  44.7  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1594  methyltransferase type 11  20.14 
 
 
218 aa  44.3  0.002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2949  Methyltransferase type 11  30.86 
 
 
299 aa  44.3  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.212824  normal  0.160481 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0676  Methyltransferase type 11  25.62 
 
 
280 aa  44.3  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22070  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.95 
 
 
247 aa  44.7  0.002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.120652  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0953  arsenite S-adenosylmethyltransferase  36.36 
 
 
265 aa  43.9  0.003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000240908  hitchhiker  0.000000043462 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12710  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  31.94 
 
 
198 aa  43.5  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>