283 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_0325 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_0325  Methyltransferase type 11  100 
 
 		 271 aa  570  1e-161  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00246537  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2493  methyltransferase type 11  31.82 
 
 		 238 aa  58.9  0.00000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0424755  normal  0.184077 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0124  demethylmenaquinone methyltransferase  29.66 
 
 		 168 aa  58.2  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000412649  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3275  Methyltransferase type 11  30.6 
 
 		 271 aa  57  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.477394  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0623  methyltransferase type 11  28.45 
 
 		 278 aa  55.8  0.0000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0996998 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1103  methyltransferase type 11  32.89 
 
 		 237 aa  55.8  0.0000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00292057  hitchhiker  0.000229506 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3510  methyltransferase type 11  32.11 
 
 		 282 aa  55.5  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3941  methyltransferase type 11  32.61 
 
 		 237 aa  55.5  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0994  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  33.03 
 
 		 282 aa  55.1  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000209916  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2926  UbiE/COQ5 methyltransferase  34.78 
 
 		 215 aa  53.1  0.000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000153656  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2014  hypothetical protein  29.25 
 
 		 253 aa  53.5  0.000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00388646  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0478  demethylmenaquinone methyltransferase  27.33 
 
 		 252 aa  53.1  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1125  Methyltransferase type 11  28.99 
 
 		 270 aa  53.5  0.000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.321869  normal  0.566486 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3822  methyltransferase type 11  32.73 
 
 		 251 aa  53.1  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.137272  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6874  Methyltransferase type 11  31.71 
 
 		 260 aa  52.4  0.000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.413969  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1008  methyltransferase type 11  26.5 
 
 		 256 aa  52.4  0.000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2463  methyltransferase type 11  33.04 
 
 		 204 aa  52.4  0.000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.899692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3400  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  25.9 
 
 		 232 aa  52.4  0.000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1663  methyltransferase type 11  33.66 
 
 		 243 aa  52.4  0.000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.639645  normal  0.0934074 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3274  Methyltransferase type 11  30.51 
 
 		 261 aa  52.4  0.000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.689568  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3237  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  30.51 
 
 		 258 aa  52  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.675115  normal  0.0534893 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  31.45 
 
 		 225 aa  52  0.00001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0772  Methyltransferase type 11  29.13 
 
 		 240 aa  52  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4655  Methyltransferase type 11  28.48 
 
 		 310 aa  51.6  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0904903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2343  methyltransferase type 11  37.5 
 
 		 367 aa  52  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.479505 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2918  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  33.96 
 
 		 241 aa  51.6  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.536779  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3301  methyltransferase type 11  27.59 
 
 		 225 aa  52  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2472  methyltransferase type 11  36.46 
 
 		 367 aa  51.6  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0962  methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 242 aa  51.6  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2384  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  33.61 
 
 		 258 aa  52  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.528666  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2332  methyltransferase type 11  27.14 
 
 		 279 aa  52  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.214932 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8231  methyltransferase type 11  28.35 
 
 		 237 aa  50.8  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3145  hypothetical protein  32.11 
 
 		 204 aa  50.8  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.725921  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3296  hypothetical protein  31.82 
 
 		 212 aa  51.2  0.00002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.114197  normal  0.0687983 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2867  Methyltransferase type 11  35.05 
 
 		 355 aa  50.8  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0744  methyltransferase type 11  28.49 
 
 		 256 aa  51.2  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23770  putative biotin synthesis protein  33.03 
 
 		 187 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0761957 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3284  methyltransferase type 11  32.11 
 
 		 173 aa  51.2  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.859694  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2098  methyltransferase type 11  29.2 
 
 		 263 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5517  methyltransferase type 11  30.91 
 
 		 228 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.550452  normal  0.719059 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0485  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  26.76 
 
 		 249 aa  50.8  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.693247  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11556  methyltransferase  25.54 
 
 		 347 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0189  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  25.36 
 
 		 275 aa  50.4  0.00003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3246  Methyltransferase type 11  25.29 
 
 		 255 aa  50.4  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00392072  normal  0.0412956 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1407  hypothetical protein  32.65 
 
 		 191 aa  50.4  0.00003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.709337  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3440  Methyltransferase type 11  26.87 
 
 		 256 aa  50.4  0.00003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0427  hypothetical protein  27.27 
 
 		 244 aa  50.1  0.00004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_10824  predicted protein  27.97 
 
 		 304 aa  50.1  0.00004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0540311  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2273  methyltransferase type 11  30.58 
 
 		 204 aa  50.1  0.00004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.972016  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2345  methyltransferase type 11  32.17 
 
 		 204 aa  50.1  0.00004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0654899 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2320  Methyltransferase type 11  28.97 
 
 		 239 aa  50.1  0.00004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.46525  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1577  methyltransferase type 11  25.42 
 
 		 301 aa  50.1  0.00004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0911179  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2918  Methyltransferase type 11  28.95 
 
 		 248 aa  49.7  0.00005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0444641  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1148  methyltransferase type 11  31.15 
 
 		 215 aa  49.7  0.00005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0718  glycosyl transferase family protein  29.36 
 
 		 1106 aa  49.3  0.00006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.411794  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5912  methyltransferase type 11  35.92 
 
 		 706 aa  49.7  0.00006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2013  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  26.67 
 
 		 241 aa  49.7  0.00006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2225  Methyltransferase type 11  34.82 
 
 		 281 aa  49.3  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.449222  normal  0.183181 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4832  methyltransferase type 11  28.7 
 
 		 287 aa  48.9  0.00008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0563647  normal  0.0172807 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2354  methyltransferase type 11  26.32 
 
 		 231 aa  48.9  0.00008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.202193  normal  0.578326 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3659  Methyltransferase type 11  28.23 
 
 		 255 aa  48.9  0.00009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0109241  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3293  Methyltransferase type 11  27.55 
 
 		 257 aa  48.9  0.00009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5124  methyltransferase type 11  33.65 
 
 		 241 aa  48.9  0.00009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.306844 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7237  methyltransferase type 11  28 
 
 		 269 aa  48.5  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0859301  normal  0.799948 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0630  hypothetical protein  29.63 
 
 		 240 aa  48.5  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2758  demethylmenaquinone methyltransferase  29.13 
 
 		 256 aa  48.1  0.0001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.338753  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0429  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.33 
 
 		 249 aa  48.5  0.0001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2218  Methyltransferase type 11  30.28 
 
 		 254 aa  48.5  0.0001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2374  methyltransferase type 11  30.25 
 
 		 212 aa  48.5  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.404257 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0498  methyltransferase type 11  32.65 
 
 		 235 aa  48.5  0.0001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3272  methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 202 aa  48.1  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.554198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2962  methyltransferase type 11  26.05 
 
 		 401 aa  48.1  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3266  hypothetical protein  26.23 
 
 		 400 aa  47.4  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4181  methyltransferase type 11  30 
 
 		 270 aa  48.1  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4806  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  25 
 
 		 280 aa  47.8  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0061  Orf34  30.28 
 
 		 246 aa  47.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.157248  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3931  Methyltransferase type 11  30.43 
 
 		 271 aa  47.8  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.37046  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4002  methyltransferase type 11  30 
 
 		 276 aa  47.8  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.268063  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3265  methyltransferase type 11  32.69 
 
 		 241 aa  47.8  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3885  methyltransferase type 11  30.33 
 
 		 274 aa  48.1  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4832  methyltransferase type 11  30 
 
 		 270 aa  48.1  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3334  methyltransferase type 11  30 
 
 		 270 aa  48.1  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0235  Methyltransferase type 11  29.09 
 
 		 242 aa  47.8  0.0002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2130  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.79 
 
 		 241 aa  47.8  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.874721 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0078  methyltransferase type 11  24.58 
 
 		 259 aa  47.8  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1562  UbiE/COQ5 family methlytransferase  30.28 
 
 		 246 aa  47.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4274  methyltransferase type 11  30.19 
 
 		 222 aa  47.8  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.254306  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1474  UbiE/COQ5 family methlytransferase  30.28 
 
 		 246 aa  47.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0302671  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1751  Methyltransferase type 11  30.43 
 
 		 204 aa  47  0.0003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.190561  hitchhiker  0.00369788 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1697  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.48 
 
 		 249 aa  47.4  0.0003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0587723  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0297  UbiE/COQ5 family methyltransferase  28.8 
 
 		 256 aa  47.4  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.378405  normal  0.771638 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2641  Methyltransferase type 11  28.76 
 
 		 268 aa  47.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.307371  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0463  methyltransferase type 11  34 
 
 		 197 aa  47  0.0003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.115014  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1472  Methyltransferase type 11  32.11 
 
 		 242 aa  47  0.0003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0303  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  29.37 
 
 		 256 aa  47  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01809  methyltransferase  33.33 
 
 		 268 aa  47.4  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0282  UbiE/COQ5 family methyltransferase  29.37 
 
 		 256 aa  47  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.986318 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3475  Methyltransferase type 11  28.76 
 
 		 268 aa  47.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4275  Methyltransferase type 11  29.09 
 
 		 203 aa  47  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.18004 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1121  methyltransferase type 11  28.7 
 
 		 293 aa  47  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.536452  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>