More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_1686 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_2535  oxidoreductase domain protein  94.59 
 
 		 333 aa  648    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000664622 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1686  oxidoreductase domain protein  100 
 
 		 333 aa  677    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5577  oxidoreductase domain protein  57.59 
 
 		 342 aa  377  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.275125 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2785  oxidoreductase-like  58.46 
 
 		 348 aa  368  1e-101  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1063  oxidoreductase-like protein  61.23 
 
 		 337 aa  361  8e-99  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.172137  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1191  oxidoreductase domain protein  60.62 
 
 		 337 aa  360  3e-98  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.662876  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1122  oxidoreductase domain protein  60.62 
 
 		 337 aa  359  5e-98  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.11444  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3885  oxidoreductase domain-containing protein  52.15 
 
 		 341 aa  335  5.999999999999999e-91  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.037176  normal  0.810555 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3219  oxidoreductase domain-containing protein  58.33 
 
 		 338 aa  330  1e-89  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2174  oxidoreductase domain-containing protein  52.96 
 
 		 341 aa  326  3e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.193543  decreased coverage  0.00937505 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2433  oxidoreductase domain-containing protein  53.27 
 
 		 341 aa  319  5e-86  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.116249 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0522  putative oxidoreductase  52.96 
 
 		 341 aa  315  5e-85  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3206  oxidoreductase domain-containing protein  30.38 
 
 		 369 aa  132  1.0000000000000001e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31670  predicted dehydrogenase  33.09 
 
 		 353 aa  130  3e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3684  oxidoreductase domain-containing protein  32.18 
 
 		 367 aa  130  3e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2951  oxidoreductase domain protein  30.26 
 
 		 359 aa  123  4e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0446  oxidoreductase domain protein  28.82 
 
 		 364 aa  122  7e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1365  oxidoreductase domain-containing protein  33.21 
 
 		 355 aa  120  3e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1190  oxidoreductase domain-containing protein  29.75 
 
 		 371 aa  119  6e-26  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0186482  hitchhiker  0.000025969 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0558  oxidoreductase domain protein  28.89 
 
 		 359 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3572  oxidoreductase domain-containing protein  30.09 
 
 		 359 aa  117  3e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.573102 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1529  oxidoreductase domain protein  28.83 
 
 		 348 aa  115  8.999999999999998e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2154  oxidoreductase domain protein  30.45 
 
 		 347 aa  114  3e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.273291  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1190  oxidoreductase domain-containing protein  28.08 
 
 		 356 aa  114  3e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0202  oxidoreductase domain-containing protein  27.6 
 
 		 359 aa  113  4.0000000000000004e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0208  oxidoreductase domain-containing protein  27.6 
 
 		 359 aa  113  4.0000000000000004e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1073  oxidoreductase domain-containing protein  28.1 
 
 		 362 aa  113  5e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0817  oxidoreductase domain-containing protein  30.21 
 
 		 358 aa  111  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1074  oxidoreductase domain-containing protein  29.93 
 
 		 349 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3364  oxidoreductase domain protein  30.64 
 
 		 366 aa  109  8.000000000000001e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.310163  normal  0.0342924 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24600  predicted dehydrogenase  32.47 
 
 		 366 aa  108  1e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.178343  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1960  gfo/idh/mocA family protein  30.04 
 
 		 351 aa  107  4e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.430175  normal  0.910454 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1807  gfo/idh/mocA family protein  29.67 
 
 		 347 aa  105  9e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01292  predicted oxidoreductase, NADH-binding  29.67 
 
 		 351 aa  105  1e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2331  oxidoreductase domain protein  29.67 
 
 		 351 aa  105  1e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.318532  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01303  hypothetical protein  29.67 
 
 		 351 aa  105  1e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2310  oxidoreductase domain-containing protein  29.67 
 
 		 351 aa  105  1e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1430  gfo/idh/mocA family protein  29.67 
 
 		 351 aa  105  1e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0344  oxidoreductase domain protein  27.72 
 
 		 347 aa  105  2e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1525  gfo/idh/mocA family protein  29.3 
 
 		 351 aa  103  4e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3271  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  32.49 
 
 		 349 aa  102  7e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1925  oxidoreductase domain protein  30 
 
 		 340 aa  102  9e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1808  oxidoreductase domain protein  30.81 
 
 		 344 aa  102  1e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0431  oxidoreductase domain-containing protein  27.59 
 
 		 377 aa  102  1e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0978  oxidoreductase domain-containing protein  28.42 
 
 		 378 aa  101  2e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3045  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  30.31 
 
 		 349 aa  99.8  6e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.936146  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3280  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  30.31 
 
 		 349 aa  99.8  6e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0430  oxidoreductase-like  31.71 
 
 		 376 aa  98.6  1e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5057  oxidoreductase domain protein  29.86 
 
 		 381 aa  98.6  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2159  oxidoreductase domain-containing protein  29.86 
 
 		 351 aa  98.6  1e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.473931 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2269  oxidoreductase domain protein  34.52 
 
 		 354 aa  97.4  3e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.416383  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4657  oxidoreductase domain-containing protein  29.67 
 
 		 366 aa  96.7  5e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.199713  hitchhiker  0.00440873 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0615  oxidoreductase domain-containing protein  33.85 
 
 		 379 aa  96.3  7e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.537783  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6116  oxidoreductase domain protein  29.45 
 
 		 667 aa  95.9  8e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.409557 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2603  oxidoreductase domain protein  33.05 
 
 		 326 aa  95.9  9e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0256  oxidoreductase-like  27.48 
 
 		 368 aa  95.5  1e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4668  oxidoreductase domain protein  25.65 
 
 		 357 aa  94.7  2e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4111  oxidoreductase-like  28 
 
 		 360 aa  94.7  2e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.740502 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1851  oxidoreductase domain protein  31.6 
 
 		 355 aa  95.1  2e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4185  oxidoreductase domain protein  32.31 
 
 		 377 aa  94.4  2e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1537  oxidoreductase domain protein  32.86 
 
 		 356 aa  93.6  4e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0747  oxidoreductase domain-containing protein  32.46 
 
 		 358 aa  93.2  6e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.244929 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0406  oxidoreductase domain protein  29.77 
 
 		 340 aa  92.4  8e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5816  oxidoreductase domain protein  29.72 
 
 		 397 aa  91.7  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.510371  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4613  oxidoreductase domain-containing protein  36.55 
 
 		 342 aa  92.4  1e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.500705  normal  0.21491 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0048  dehydrogenase or related protein  26.26 
 
 		 319 aa  91.7  2e-17  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1138  myo-inositol 2-dehydrogenase  26.81 
 
 		 312 aa  90.5  3e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0009  oxidoreductase domain protein  31.12 
 
 		 355 aa  90.9  3e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0624  oxidoreductase domain protein  29.12 
 
 		 382 aa  90.9  3e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0754033  normal  0.160836 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0762  oxidoreductase domain protein  31.91 
 
 		 378 aa  90.5  4e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3023  oxidoreductase domain protein  33.5 
 
 		 367 aa  90.5  4e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2325  oxidoreductase domain-containing protein  26.32 
 
 		 327 aa  90.1  5e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.144088  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0217  oxidoreductase domain protein  27.69 
 
 		 344 aa  89.7  6e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5258  oxidoreductase domain protein  34.48 
 
 		 367 aa  89.7  6e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0141  oxidoreductase domain protein  27.16 
 
 		 394 aa  89.7  7e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2967  oxidoreductase domain protein  30.34 
 
 		 353 aa  89.4  7e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50150  oxidoreductase family, NAD-binding Rossmann fold domain protein  30.19 
 
 		 345 aa  89.4  7e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6528  oxidoreductase domain protein  27.6 
 
 		 667 aa  89  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.125495 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1242  oxidoreductase domain-containing protein  36.02 
 
 		 328 aa  88.6  1e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.225329  normal  0.0194042 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1578  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  31.41 
 
 		 377 aa  88.6  1e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00538789 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3671  putative oxidoreductase  32.54 
 
 		 383 aa  87.8  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0205617  normal  0.172582 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1780  oxidoreductase domain-containing protein  27.32 
 
 		 360 aa  88.6  2e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4425  oxidoreductase domain protein  28.57 
 
 		 355 aa  88.6  2e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  hitchhiker  0.00532668  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0993  oxidoreductase domain-containing protein  26.43 
 
 		 385 aa  87.4  3e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0209  oxidoreductase domain-containing protein  25.65 
 
 		 346 aa  87.4  3e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0203  oxidoreductase domain-containing protein  25.65 
 
 		 346 aa  87.4  3e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1569  oxidoreductase domain protein  36.17 
 
 		 374 aa  87.4  3e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0156  oxidoreductase domain protein  37.93 
 
 		 396 aa  86.7  5e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0966  oxidoreductase domain protein  32.09 
 
 		 384 aa  86.7  5e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1577  oxidoreductase domain protein  34.2 
 
 		 390 aa  86.7  5e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3609  Inositol 2-dehydrogenase  29.1 
 
 		 367 aa  86.3  6e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0639  oxidoreductase domain protein  26.26 
 
 		 321 aa  86.3  7e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.215253  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01870  predicted dehydrogenase  35.38 
 
 		 339 aa  86.3  8e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.686021  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1727  oxidoreductase-like protein  28.75 
 
 		 331 aa  85.9  8e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.039355  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1107  oxidoreductase domain protein  35.86 
 
 		 350 aa  85.9  8e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2339  oxidoreductase domain-containing protein  28.75 
 
 		 344 aa  85.9  8e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.445673 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0599  oxidoreductase domain-containing protein  29.11 
 
 		 383 aa  85.5  0.000000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1704  oxidoreductase domain-containing protein  27.43 
 
 		 344 aa  85.1  0.000000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04302  oxidoreductase YvaA  32.83 
 
 		 350 aa  85.5  0.000000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05984  NAD binding Rossmann fold oxidoreductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G10240)  32.44 
 
 		 355 aa  84.7  0.000000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0766488 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>