More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU0853 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU0853  CBS domain-containing protein  100 
 
 
444 aa  889    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.215802  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1143  hypothetical protein  73.24 
 
 
432 aa  637    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000186322  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1153  hypothetical protein  80.32 
 
 
447 aa  715    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000974304  normal  0.0417904 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3282  protein of unknown function DUF21  67.47 
 
 
433 aa  569  1e-161  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0967  protein of unknown function DUF21  66.5 
 
 
439 aa  558  1e-158  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.854838 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2611  protein of unknown function DUF21  60.75 
 
 
445 aa  500  1e-140  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0762  hypothetical protein  59.43 
 
 
456 aa  499  1e-140  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0171545  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0926  protein of unknown function DUF21  39.57 
 
 
441 aa  296  4e-79  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.731568 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2432  protein of unknown function DUF21  35.51 
 
 
443 aa  286  7e-76  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3678  protein of unknown function DUF21  35.51 
 
 
443 aa  286  7e-76  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.35091 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2925  hypothetical protein  38.71 
 
 
465 aa  284  2.0000000000000002e-75  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.221134  normal  0.412302 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0470  hypothetical protein  37.97 
 
 
432 aa  280  3e-74  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000200568  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3197  hypothetical protein  39.31 
 
 
479 aa  277  2e-73  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.241932  normal  0.866715 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4087  protein of unknown function DUF21  36.03 
 
 
453 aa  275  1.0000000000000001e-72  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3597  protein of unknown function DUF21  32.79 
 
 
447 aa  275  2.0000000000000002e-72  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000988374 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0252  protein of unknown function DUF21  35.65 
 
 
434 aa  266  8e-70  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000514588  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2766  hypothetical protein  37.41 
 
 
442 aa  264  3e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4403  hypothetical protein  37.82 
 
 
436 aa  264  3e-69  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0196704  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1383  transport protein  32.79 
 
 
434 aa  262  8.999999999999999e-69  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.283032  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12560  putative membrane CBS domain protein  36.05 
 
 
420 aa  262  1e-68  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2774  protein of unknown function DUF21  36.1 
 
 
440 aa  260  3e-68  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.730131  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3447  hypothetical protein  36.1 
 
 
440 aa  260  3e-68  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0756  hypothetical protein  37.53 
 
 
436 aa  256  5e-67  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0635919  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3512  protein of unknown function DUF21  36.49 
 
 
431 aa  256  6e-67  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.257501  normal  0.374436 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4107  protein of unknown function DUF21  34.6 
 
 
463 aa  255  1.0000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4147  protein of unknown function DUF21  34.6 
 
 
463 aa  255  1.0000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.263369 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4410  protein of unknown function DUF21  36.94 
 
 
444 aa  253  5.000000000000001e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.938013  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1285  hypothetical protein  35.1 
 
 
446 aa  253  7e-66  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0324547  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2233  protein of unknown function DUF21  36.71 
 
 
437 aa  250  3e-65  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4066  protein of unknown function DUF21  32.63 
 
 
438 aa  249  5e-65  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.659836  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3770  hypothetical protein  36.15 
 
 
441 aa  249  5e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2480  hemolysin  36.03 
 
 
436 aa  248  2e-64  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2313  hypothetical protein  36.08 
 
 
438 aa  247  2e-64  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0064  protein of unknown function DUF21  36.04 
 
 
447 aa  247  3e-64  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2846  protein of unknown function DUF21  35.08 
 
 
443 aa  246  6.999999999999999e-64  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4935  hypothetical protein  34.5 
 
 
443 aa  244  1.9999999999999999e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3640  hypothetical protein  35.31 
 
 
441 aa  244  3e-63  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0703  protein of unknown function DUF21  34.72 
 
 
477 aa  243  7e-63  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.401824 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2385  hypothetical protein  35.29 
 
 
433 aa  242  7.999999999999999e-63  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7969  protein of unknown function DUF21  38.25 
 
 
555 aa  241  2e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0669  hypothetical protein  37.61 
 
 
439 aa  241  2e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0810091 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3036  CBS  35.76 
 
 
442 aa  241  2e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1932  CBS  34.83 
 
 
456 aa  240  2.9999999999999997e-62  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0017665  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2004  hypothetical protein  34.54 
 
 
431 aa  240  2.9999999999999997e-62  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0830  protein of unknown function DUF21  38.97 
 
 
436 aa  240  4e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0185208  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0902  protein of unknown function DUF21  35.32 
 
 
436 aa  240  4e-62  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3672  hypothetical protein  34.62 
 
 
425 aa  239  5.999999999999999e-62  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00780947 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2853  CBS domain-containing protein  35.71 
 
 
439 aa  239  6.999999999999999e-62  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0798  protein of unknown function DUF21  32.37 
 
 
429 aa  239  9e-62  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0238  protein of unknown function DUF21  33.18 
 
 
417 aa  239  9e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.932515 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2870  hypothetical protein  35.32 
 
 
433 aa  239  1e-61  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.221651  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2000  hemolysin-like protein  32.79 
 
 
445 aa  238  2e-61  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0678745  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2815  CBS domain-containing protein  35.06 
 
 
439 aa  237  3e-61  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35020  hemolysin-like protein  35.61 
 
 
432 aa  237  3e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.518958  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0826  protein of unknown function DUF21  38.72 
 
 
436 aa  237  3e-61  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2595  hypothetical protein  34.01 
 
 
476 aa  236  7e-61  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0439  CBS/transporter associated domain-containing protein  30.71 
 
 
445 aa  236  8e-61  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1126  protein of unknown function DUF21  30.99 
 
 
428 aa  235  1.0000000000000001e-60  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.93664  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1441  protein of unknown function DUF21  36.52 
 
 
439 aa  234  2.0000000000000002e-60  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.114074  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2102  hypothetical protein  33.18 
 
 
486 aa  234  3e-60  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0719505  normal  0.288843 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2296  protein of unknown function DUF21  33.02 
 
 
433 aa  233  4.0000000000000004e-60  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.23749  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0521  protein of unknown function DUF21  32.81 
 
 
448 aa  233  6e-60  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0433  transport protein ysiA  30.47 
 
 
445 aa  233  6e-60  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1326  protein of unknown function DUF21  35.87 
 
 
425 aa  233  7.000000000000001e-60  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00045717  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4228  hypothetical protein  35.13 
 
 
445 aa  232  8.000000000000001e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.351193  normal  0.199337 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2212  CBS domain-containing protein  33.26 
 
 
417 aa  232  8.000000000000001e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000293587  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0098  hypothetical protein  34.26 
 
 
460 aa  232  9e-60  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3237  protein of unknown function DUF21  36.99 
 
 
448 aa  232  1e-59  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.422703  normal  0.0333054 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0819  protein of unknown function DUF21  31.11 
 
 
441 aa  231  2e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2159  protein of unknown function DUF21  28.6 
 
 
440 aa  231  2e-59  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.182374  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4050  hypothetical protein  31.66 
 
 
440 aa  231  2e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0807851  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2235  protein of unknown function DUF21  32.2 
 
 
439 aa  230  3e-59  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2008  protein of unknown function DUF21  31.54 
 
 
447 aa  231  3e-59  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000403932  normal  0.229254 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7487  hypothetical protein  36.89 
 
 
436 aa  230  4e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.160114 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0389  hypothetical protein  34.72 
 
 
438 aa  229  6e-59  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1072  hypothetical protein  34.52 
 
 
442 aa  229  7e-59  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.638225  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0907  hypothetical protein  32.83 
 
 
487 aa  229  8e-59  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00145155  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0264  hypothetical protein  34.92 
 
 
432 aa  229  1e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.265353 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3066  hypothetical protein  32.56 
 
 
442 aa  228  1e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.928407  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2711  hypothetical protein  34.96 
 
 
431 aa  229  1e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.155736 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3396  CBS domain protein  32.55 
 
 
442 aa  228  1e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0049  protein of unknown function DUF21  33.73 
 
 
467 aa  228  1e-58  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1413  hypothetical protein  34.95 
 
 
430 aa  228  1e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0999393  normal  0.104956 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3392  CBS domain-containing protein  32.33 
 
 
442 aa  228  2e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2439  protein of unknown function DUF21  35.25 
 
 
443 aa  228  2e-58  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3172  CBS domain-containing protein  32.33 
 
 
442 aa  228  2e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.903732  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3156  hypothetical protein  32.33 
 
 
442 aa  228  2e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3391  CBS domain protein  32.33 
 
 
442 aa  228  2e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0021  protein of unknown function DUF21  36.34 
 
 
435 aa  228  2e-58  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.099852 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3370  CBS domain protein  32.33 
 
 
442 aa  227  3e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1287  protein of unknown function DUF21  35.45 
 
 
428 aa  227  3e-58  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0831  protein of unknown function DUF21  34.06 
 
 
452 aa  226  6e-58  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0300168 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2138  hypothetical protein  31.81 
 
 
440 aa  226  6e-58  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3422  CBS domain-containing protein  32.46 
 
 
435 aa  226  7e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0562  hypothetical protein  34.63 
 
 
439 aa  226  7e-58  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.371677  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1314  hypothetical protein  33.26 
 
 
439 aa  226  8e-58  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0274508  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1250  CBS domain-containing protein  35.76 
 
 
432 aa  225  9e-58  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.144301  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0608  hemolysin  34.63 
 
 
439 aa  226  9e-58  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1577  protein of unknown function DUF21  35.36 
 
 
447 aa  225  1e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.569313  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1858  protein of unknown function DUF21  35.85 
 
 
434 aa  225  1e-57  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>