More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_3599 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_3599  ABC transporter related  100 
 
 		 250 aa  521  1e-147  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3533  ABC transporter related protein  97.2 
 
 		 250 aa  509  1e-143  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0047  ABC transporter related  70 
 
 		 250 aa  384  1e-106  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0492  ABC transporter-related protein  66 
 
 		 256 aa  350  1e-95  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2985  ABC transporter, ATP-binding protein  62.8 
 
 		 250 aa  336  1.9999999999999998e-91  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2138  ABC transporter related  57.2 
 
 		 250 aa  308  5.9999999999999995e-83  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000174943  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1834  ABC transporter related  55.65 
 
 		 249 aa  299  3e-80  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.269804  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1579  ABC transporter related protein  45.74 
 
 		 255 aa  206  4e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4134  ABC transporter related  39.6 
 
 		 256 aa  204  1e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2403  ABC transporter related  41.2 
 
 		 252 aa  203  2e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0837  putative cation ABC transporter, ATP-binding protein  39.75 
 
 		 256 aa  203  2e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00154907  hitchhiker  0.00000902148 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4399  putative cation ABC transporter, ATP-binding protein  39.75 
 
 		 256 aa  203  2e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0939704  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4415  putative cation ABC transporter, ATP-binding protein  40.17 
 
 		 256 aa  202  5e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00132022  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4031  cation ABC transporter, ATP-binding protein  40.17 
 
 		 256 aa  202  6e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00593261  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4361  cation ABC transporter, ATP-binding protein, putative  39.75 
 
 		 256 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.129987  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4183  cation ABC transporter ATP-binding protein  39.75 
 
 		 256 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.420645  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4021  cation ABC transporter, ATP-binding protein  39.75 
 
 		 256 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0100127  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4303  putative cation ABC transporter, ATP-binding protein  39.75 
 
 		 256 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.9910000000000006e-20 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4505  cation ABC transporter ATP-binding protein  39.75 
 
 		 256 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.345764  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3009  ABC transporter-related protein  38.4 
 
 		 257 aa  192  6e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.12216  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0168  ABC transporter related protein  39.27 
 
 		 255 aa  187  1e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0196  ABC transporter-related protein  39.6 
 
 		 243 aa  187  1e-46  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.440327  normal  0.450863 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4183  ABC transporter related  36.73 
 
 		 250 aa  187  2e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00136273  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2064  ABC transporter-related protein  36.21 
 
 		 254 aa  186  3e-46  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.443264  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0548  ABC transporter related protein  37.94 
 
 		 259 aa  183  2.0000000000000003e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.324241  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0043  ABC transporter related  40.47 
 
 		 247 aa  179  4.999999999999999e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000016055  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3889  ABC transporter related  38.84 
 
 		 258 aa  176  3e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3939  ABC transporter related  38.84 
 
 		 258 aa  176  3e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.869881  normal  0.0578024 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2646  ABC transporter related  40.18 
 
 		 257 aa  175  5e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1654  ABC transporter-like protein  37.1 
 
 		 240 aa  174  9.999999999999999e-43  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1122  ABC transporter, ATP-binding protein  36.51 
 
 		 260 aa  171  6.999999999999999e-42  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.570761  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0597  ABC transporter related protein  38.3 
 
 		 230 aa  171  1e-41  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0186  ABC transporter related  38.94 
 
 		 251 aa  170  3e-41  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0140  ATPase  40.89 
 
 		 252 aa  167  1e-40  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0265592  normal  0.609622 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2475  ABC transporter related  42.44 
 
 		 254 aa  165  5.9999999999999996e-40  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.322042  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2191  ABC transporter related  35.22 
 
 		 249 aa  163  2.0000000000000002e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000419302  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0277  ABC transporter related  33.6 
 
 		 254 aa  163  3e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.210378  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1634  ABC transporter related protein  37.14 
 
 		 245 aa  162  4.0000000000000004e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1214  ABC transporter related protein  36.07 
 
 		 245 aa  162  5.0000000000000005e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2316  ABC transporter related  38.46 
 
 		 251 aa  161  7e-39  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3479  ABC transporter related protein  36.36 
 
 		 246 aa  162  7e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.319887  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1682  ABC transporter related  36.51 
 
 		 247 aa  161  8.000000000000001e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0852  ABC transporter related  38.14 
 
 		 246 aa  160  1e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.478961  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2422  ABC transporter, ATPase subunit  39.27 
 
 		 243 aa  161  1e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0206  ABC transporter related  41.2 
 
 		 222 aa  160  2e-38  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.384968  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1112  ABC transporter related  35.62 
 
 		 259 aa  160  2e-38  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1016  ABC transporter, ATPase subunit  37.35 
 
 		 249 aa  159  3e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18340  ABC transporter related  38.99 
 
 		 239 aa  159  5e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000733695  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0964  ABC transporter related protein  36.05 
 
 		 250 aa  159  5e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.0000527176  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3025  ABC-type transport system, ATP binding component  37.29 
 
 		 257 aa  158  9e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1890  ABC-type zinc transport system ATP-binding protein  40.45 
 
 		 262 aa  157  2e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0815  ABC transporter-related protein  39.55 
 
 		 255 aa  156  3e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.120726  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1103  ABC transporter related  37.39 
 
 		 250 aa  155  5.0000000000000005e-37  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.813503  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0517  ABC transporter related  35.85 
 
 		 221 aa  155  5.0000000000000005e-37  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0439  ABC transporter related  37.92 
 
 		 237 aa  155  7e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0164474  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2434  ABC transporter related protein  35.51 
 
 		 246 aa  154  1e-36  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000150378  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_573  cation ABC transporter, ATP-binding protein  38.53 
 
 		 254 aa  154  1e-36  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2087  ABC transporter related  36.2 
 
 		 258 aa  154  1e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.454279  normal  1 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3314  ABC transporter related  37.17 
 
 		 262 aa  154  1e-36  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1590  ABC transporter related  37.61 
 
 		 262 aa  154  1e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0632  cation ABC transporter, ATP-binding protein  38.53 
 
 		 254 aa  153  2e-36  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1057  ABC transporter related  37.8 
 
 		 284 aa  153  2.9999999999999998e-36  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1014  ABC transporter related protein  36.04 
 
 		 287 aa  153  2.9999999999999998e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1589  ABC transporter related protein  35.29 
 
 		 250 aa  152  4e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.741401  normal  0.0385936 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1257  ABC transporter related  36.32 
 
 		 271 aa  150  2e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0480594  hitchhiker  0.000898687 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1192  ABC transporter related  37.82 
 
 		 259 aa  150  2e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.00000000837637  hitchhiker  0.00000450172 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2631  ATP-binding transport protein  34.85 
 
 		 296 aa  149  4e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0977377  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1814  ABC transporter related  34.85 
 
 		 296 aa  149  4e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0381501  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1704  chelated iron ABC transporter, ATP-binding protein YfeB  34.85 
 
 		 296 aa  149  4e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3438  ABC transporter related  40.3 
 
 		 253 aa  149  4e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.824241  normal  0.104948 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0605  ABC transporter related  37.16 
 
 		 254 aa  148  7e-35  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0155  zinc ABC transporter, ATP-binding protein  35.71 
 
 		 236 aa  147  1.0000000000000001e-34  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0247418  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1614  ABC transporter related  34.68 
 
 		 261 aa  147  1.0000000000000001e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.507834  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1648  ABC transporter related  34.68 
 
 		 261 aa  147  1.0000000000000001e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.168951  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5757  ABC transporter related protein  37.87 
 
 		 263 aa  147  1.0000000000000001e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.329137  normal  0.47815 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3806  ABC transporter related protein  34.5 
 
 		 221 aa  146  3e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000628307  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3815  ABC transporter related  40.8 
 
 		 253 aa  146  4.0000000000000006e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0507934 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0623  ABC transporter related  34.1 
 
 		 294 aa  145  7.0000000000000006e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.512401  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1010  ABC transporter related  38.21 
 
 		 242 aa  144  9e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.645133 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2418  zinc ABC transporter ATP-binding protein  33.81 
 
 		 245 aa  144  9e-34  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4770  ABC transporter related  37.24 
 
 		 250 aa  144  1e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.285332  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0097  ABC transporter ATP-binding protein  35.94 
 
 		 281 aa  144  2e-33  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00699805  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0234  ABC-type Mn/Zn transport system, ATPase component  34.43 
 
 		 235 aa  143  2e-33  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000000539035  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18240  ATPase component of Mn/Zn ABC-type transporter  42.79 
 
 		 226 aa  143  2e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1675  ATPase  38.94 
 
 		 233 aa  142  3e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000905168  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0038  manganese ABC transporter, ATP-binding protein  34.45 
 
 		 249 aa  142  4e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000473887  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0401  ABC transporter-related protein  35.32 
 
 		 257 aa  142  4e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2132  ABC transporter-related protein  34.02 
 
 		 296 aa  142  5e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.350282 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03380  ATPase component of Mn/Zn ABC-type transporter  36.6 
 
 		 258 aa  142  5e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.379323  normal  0.939533 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0289  ABC transporter related  34.31 
 
 		 268 aa  142  5e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.137233  normal  0.108159 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2734  ABC transporter related  33.33 
 
 		 258 aa  142  5e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1546  ABC transporter related  35.17 
 
 		 248 aa  142  5e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0736  ABC transporter related protein  37.98 
 
 		 277 aa  142  6e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0929  ABC transporter related  35.59 
 
 		 244 aa  142  6e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.281501  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1399  ABC transporter related  36.44 
 
 		 246 aa  142  6e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.765734  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2065  metal ABC transporter, ATP-binding protein  33.89 
 
 		 249 aa  142  7e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2048  ABC transporter related protein  38.07 
 
 		 247 aa  141  8e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.833471 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0689  ABC transporter related protein  36.36 
 
 		 258 aa  141  9.999999999999999e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.010451  normal  0.0371148 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3636  ABC transporter-related protein  33.61 
 
 		 249 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3403  ABC transporter related  34.32 
 
 		 292 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>