More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_3566 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_1896  dihydrolipoamide dehydrogenase  82.3 
 
 		 452 aa  746    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.447671  decreased coverage  0.00000000000000861122 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3566  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  100 
 
 		 452 aa  914    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2588  alpha keto acid dehydrogenase complex, E3 component, lipoamide dehydrogenase  67.11 
 
 		 452 aa  586  1e-166  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.896583  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0515  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.04 
 
 		 463 aa  295  1e-78  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.023508  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0846  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.87 
 
 		 465 aa  283  7.000000000000001e-75  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2585  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.53 
 
 		 459 aa  276  6e-73  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.295349  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2773  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.53 
 
 		 459 aa  276  6e-73  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2502  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.11 
 
 		 459 aa  274  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2536  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.89 
 
 		 459 aa  271  2e-71  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2180  dihydrolipoamide dehydrogenase  36 
 
 		 585 aa  269  7e-71  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000695519  hitchhiker  0.00000000000000384983 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1763  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.22 
 
 		 459 aa  267  2e-70  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.733287  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2801  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.61 
 
 		 459 aa  265  1e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2822  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.86 
 
 		 459 aa  265  1e-69  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0920611  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2575  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.46 
 
 		 459 aa  263  6e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0023205  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1439  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.82 
 
 		 469 aa  260  3e-68  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0608  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.26 
 
 		 458 aa  260  3e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0365  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.23 
 
 		 458 aa  260  4e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1911  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.77 
 
 		 603 aa  259  5.0000000000000005e-68  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00687521  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2782  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.27 
 
 		 459 aa  259  6e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6035  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.96 
 
 		 466 aa  259  7e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2776  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.78 
 
 		 459 aa  258  1e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0539747 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2549  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.16 
 
 		 471 aa  258  2e-67  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1981  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.55 
 
 		 603 aa  256  6e-67  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.01171  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2179  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.59 
 
 		 468 aa  254  3e-66  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2511  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.9 
 
 		 459 aa  254  3e-66  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.136342 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03103  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.14 
 
 		 607 aa  253  6e-66  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0264  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.23 
 
 		 473 aa  253  6e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3520  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.33 
 
 		 602 aa  252  7e-66  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.501053  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1045  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.58 
 
 		 469 aa  252  7e-66  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.722929 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2323  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.15 
 
 		 467 aa  252  1e-65  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.123763  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2479  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.42 
 
 		 467 aa  252  1e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3995  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.29 
 
 		 465 aa  251  2e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0162306  normal  0.78186 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2155  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.53 
 
 		 465 aa  251  2e-65  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2965  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.35 
 
 		 680 aa  250  3e-65  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.155449  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1086  dihydrolipoyl dehydrogenase (dihydrolipoamide dehydrogenase)  32.74 
 
 		 464 aa  250  3e-65  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.912162  normal  0.114778 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2319  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.57 
 
 		 475 aa  250  4e-65  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2352  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.27 
 
 		 467 aa  249  5e-65  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.357235  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1365  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.33 
 
 		 465 aa  250  5e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0890108  normal  0.202546 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2454  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.36 
 
 		 579 aa  249  8e-65  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.154303  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6263  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.59 
 
 		 468 aa  248  1e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.202471 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1543  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.1 
 
 		 470 aa  246  4e-64  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.593732  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2554  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.39 
 
 		 476 aa  246  4e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.40022  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12463  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.6 
 
 		 462 aa  246  4e-64  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.931129  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4513  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.71 
 
 		 465 aa  246  4e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0173943  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1689  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.73 
 
 		 462 aa  246  4.9999999999999997e-64  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.08159 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3001  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.52 
 
 		 462 aa  246  6e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0472874  normal  0.642083 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1830  dihydrolipoamide dehydrogenase  34 
 
 		 466 aa  246  6.999999999999999e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.803775  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0271  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.48 
 
 		 593 aa  246  6.999999999999999e-64  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.146735  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5151  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.53 
 
 		 465 aa  244  1.9999999999999999e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0369329  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0325  alpha keto acid dehydrogenase complex, E3 component, lipoamide dehydrogenase  31.72 
 
 		 457 aa  244  1.9999999999999999e-63  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1797  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.62 
 
 		 474 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3594  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.17 
 
 		 492 aa  244  1.9999999999999999e-63  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1132  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.79 
 
 		 464 aa  244  3e-63  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.487543 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0138  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.17 
 
 		 491 aa  244  3e-63  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1926  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.96 
 
 		 476 aa  244  3e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0180  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.91 
 
 		 467 aa  243  3.9999999999999997e-63  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1972  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.05 
 
 		 474 aa  243  3.9999999999999997e-63  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.266014  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1774  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.96 
 
 		 476 aa  243  5e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0537  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.91 
 
 		 480 aa  243  5e-63  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1752  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.96 
 
 		 476 aa  243  5e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2992  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.51 
 
 		 459 aa  243  7e-63  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2306  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.23 
 
 		 473 aa  242  9e-63  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1237  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.63 
 
 		 465 aa  242  9e-63  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.319499  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1451  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.44 
 
 		 466 aa  241  1e-62  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7193  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.85 
 
 		 619 aa  242  1e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2076  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.85 
 
 		 588 aa  242  1e-62  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0230  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.07 
 
 		 454 aa  242  1e-62  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.247688  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1096  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.14 
 
 		 464 aa  242  1e-62  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1719  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.96 
 
 		 476 aa  241  1e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0074  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.77 
 
 		 462 aa  242  1e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.490103  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3977  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.91 
 
 		 481 aa  241  2e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0378897 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1156  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.46 
 
 		 480 aa  241  2e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.354559  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5671  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.04 
 
 		 466 aa  241  2e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0992  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.32 
 
 		 468 aa  241  2e-62  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0183  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.62 
 
 		 467 aa  241  2e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3815  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.27 
 
 		 468 aa  241  2e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.585527  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2622  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.48 
 
 		 462 aa  241  2e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1351  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.73 
 
 		 456 aa  240  2.9999999999999997e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0398  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.98 
 
 		 467 aa  241  2.9999999999999997e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.175439 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1847  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.87 
 
 		 467 aa  240  2.9999999999999997e-62  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0173545  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11020  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.7 
 
 		 465 aa  240  4e-62  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.874516 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1084  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.05 
 
 		 473 aa  239  5e-62  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.737232  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1496  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.74 
 
 		 476 aa  239  5e-62  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1002  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.74 
 
 		 476 aa  239  5e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.219613  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1745  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.74 
 
 		 476 aa  239  5e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00176702 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1050  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.74 
 
 		 476 aa  239  5e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.164535  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0962  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.48 
 
 		 462 aa  240  5e-62  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1003  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.79 
 
 		 594 aa  240  5e-62  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.851611  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1392  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.74 
 
 		 476 aa  239  5e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0164  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.74 
 
 		 476 aa  239  5e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6299  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.04 
 
 		 625 aa  239  5.999999999999999e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0179219 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2857  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.69 
 
 		 474 aa  239  5.999999999999999e-62  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21030  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.55 
 
 		 562 aa  239  5.999999999999999e-62  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000667155  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0631  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.7 
 
 		 466 aa  239  8e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0991753  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0644  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.7 
 
 		 466 aa  239  8e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.963668 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2832  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.1 
 
 		 463 aa  239  9e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2542  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.56 
 
 		 474 aa  239  9e-62  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.167426  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1554  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.55 
 
 		 589 aa  239  9e-62  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3705  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.33 
 
 		 468 aa  239  1e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.215491 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1878  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.68 
 
 		 466 aa  238  1e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.932595  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>