More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_3234 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_3234  Methyltransferase type 11  100 
 
 		 235 aa  472  1e-132  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1026  Methyltransferase type 11  96.15 
 
 		 235 aa  455  1e-127  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2728  SAM-dependent methyltransferase  29.2 
 
 		 252 aa  112  6e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5034  Methyltransferase type 12  30.54 
 
 		 237 aa  110  3e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.244151 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3807  methyltransferase type 12  26.34 
 
 		 237 aa  105  4e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3186  Methyltransferase type 12  27.83 
 
 		 245 aa  106  4e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.458893  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1341  hypothetical protein  33.18 
 
 		 238 aa  105  7e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1686  SAM-dependent methyltransferase  29.24 
 
 		 263 aa  105  7e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0634865 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1187  methyltransferase type 12  37.56 
 
 		 236 aa  104  1e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.683233 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2534  3-demethylubiquinone-9 3-O-methyltransferase  30.41 
 
 		 241 aa  101  1e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.115173 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1513  hypothetical protein  32.27 
 
 		 221 aa  99.4  5e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.296421  normal  0.422698 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1938  hypothetical protein  35.82 
 
 		 232 aa  99  6e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000329837 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1092  methyltransferase type 11  27.71 
 
 		 224 aa  98.2  9e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10913  hypothetical protein  27.31 
 
 		 236 aa  97.1  2e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.127289  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2113  Methyltransferase type 12  30.59 
 
 		 240 aa  93.2  3e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.294106  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2036  Methyltransferase type 12  29.77 
 
 		 231 aa  89.4  5e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.916897  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3795  SAM-dependent methyltransferase  27.75 
 
 		 230 aa  89  5e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.200041 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0419  hypothetical protein  27.1 
 
 		 230 aa  88.6  7e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.271566 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18721  hypothetical protein  33.94 
 
 		 239 aa  87.8  1e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.377095 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4711  methyltransferase type 12  34.13 
 
 		 217 aa  87.8  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04540  hypothetical protein  31.25 
 
 		 237 aa  82.4  0.000000000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0254  methyltransferase type 11  25.23 
 
 		 230 aa  80.1  0.00000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.753586 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18910  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1, 4-benzoquinol methylase  27.27 
 
 		 268 aa  75.1  0.0000000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.07476  normal  0.315555 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2808  hypothetical protein  31.74 
 
 		 248 aa  73.9  0.000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0677099  normal  0.911187 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1039  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.79 
 
 		 241 aa  70.5  0.00000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2197  hypothetical protein  29.21 
 
 		 243 aa  70.9  0.00000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.123697  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0390  Methyltransferase type 11  34.51 
 
 		 194 aa  69.7  0.00000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1458  methyltransferase type 11  34.35 
 
 		 265 aa  64.7  0.000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0537  UbiE/COQ5 family methlytransferase  36.07 
 
 		 221 aa  62  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.406886  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3154  hypothetical protein  36.07 
 
 		 221 aa  62  0.000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0703  ubiE/COQ5 methyltransferase family protein  36.07 
 
 		 221 aa  62  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.161122  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1464  UbiE/COQ5 family methlytransferase  36.07 
 
 		 221 aa  62  0.000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0124  UbiE/COQ5 family methlytransferase  36.07 
 
 		 221 aa  62  0.000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.528868  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2892  UbiE/COQ5 family methlytransferase  36.07 
 
 		 221 aa  62  0.000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2367  Methyltransferase type 11  36.44 
 
 		 270 aa  62.4  0.000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0519  UbiE/COQ5 family methlytransferase  36.07 
 
 		 221 aa  62  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.421388  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5589  Methyltransferase type 11  36.67 
 
 		 275 aa  61.6  0.000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.251711  normal  0.442261 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5779  Methyltransferase type 11  37.69 
 
 		 270 aa  61.2  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.796207  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2014  methyltransferase type 11  30.65 
 
 		 236 aa  60.8  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.51029  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1352  hypothetical protein  29.82 
 
 		 206 aa  58.9  0.00000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1234  Methyltransferase type 12  30.83 
 
 		 269 aa  58.5  0.00000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.186171 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1558  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.78 
 
 		 241 aa  58.2  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1528  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.78 
 
 		 241 aa  58.2  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.828667  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1236  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.06 
 
 		 237 aa  56.2  0.0000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.228899  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3425  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  36.52 
 
 		 258 aa  55.8  0.0000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000129288 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0198  UbiE/COQ5 methyltransferase  32.73 
 
 		 252 aa  55.8  0.0000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.537911  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2225  Methyltransferase type 11  38.75 
 
 		 281 aa  55.5  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.449222  normal  0.183181 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6862  Methyltransferase type 11  43.66 
 
 		 227 aa  55.5  0.0000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0465  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  40.57 
 
 		 249 aa  55.5  0.0000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1080  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  35.51 
 
 		 233 aa  55.5  0.0000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0245435  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0772  Methyltransferase type 12  25.81 
 
 		 310 aa  55.5  0.0000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0469  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.36 
 
 		 234 aa  55.5  0.0000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10980  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  33.02 
 
 		 296 aa  55.1  0.0000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2422  hypothetical protein  35.94 
 
 		 194 aa  55.1  0.0000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2052  Methyltransferase type 11  35.94 
 
 		 216 aa  55.1  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.782296  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5517  methyltransferase type 11  37.23 
 
 		 228 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.550452  normal  0.719059 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1999  2-heptaprenyl-1,4- naphthoquinonemethyltransferas e  29.55 
 
 		 235 aa  54.7  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.753273  normal  0.375757 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0905  Methyltransferase type 11  32.85 
 
 		 216 aa  54.7  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.445237  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2252  methyltransferase type 11  31.94 
 
 		 266 aa  54.7  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2403  Methyltransferase type 11  36.21 
 
 		 262 aa  54.7  0.000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1640  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  27.27 
 
 		 237 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.169643  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3712  Methyltransferase type 11  45.65 
 
 		 244 aa  53.9  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.435938  normal  0.0474323 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3067  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.53 
 
 		 239 aa  54.3  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000221573  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3495  UbiE/COQ5 methyltransferase  32.41 
 
 		 275 aa  54.3  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0172261  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1271  methyltransferase type 11  38.96 
 
 		 274 aa  53.9  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.459603  hitchhiker  0.00156427 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0759  methyltransferase, putative  35.94 
 
 		 216 aa  53.9  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3809  SAM binding protein  30.71 
 
 		 219 aa  54.3  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.914048  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0189  Methyltransferase type 11  30.05 
 
 		 213 aa  54.3  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.14372  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0051  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.32 
 
 		 237 aa  54.3  0.000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.181609  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2461  Methyltransferase type 11  31.61 
 
 		 265 aa  53.9  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2082  Methyltransferase type 11  37.14 
 
 		 265 aa  53.5  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0250363  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0867  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase UbiE, putative  32.71 
 
 		 256 aa  53.1  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0166  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.33 
 
 		 239 aa  53.1  0.000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00279122 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1423  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  27.84 
 
 		 237 aa  53.1  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1395  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  27.84 
 
 		 237 aa  53.1  0.000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1395  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  27.84 
 
 		 237 aa  53.1  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4657  Methyltransferase type 11  29.83 
 
 		 624 aa  53.1  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.109696 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2906  methyltransferase  29.69 
 
 		 248 aa  52.8  0.000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00515512  hitchhiker  0.000112395 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3983  methyltransferase type 11  31.4 
 
 		 293 aa  53.1  0.000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.307607  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1676  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  27.84 
 
 		 237 aa  53.1  0.000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000970326  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1534  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  27.84 
 
 		 237 aa  53.1  0.000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.190517  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4088  glycosyl transferase family protein  43.04 
 
 		 1032 aa  53.1  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.127971 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1408  membrane-associated protein  28 
 
 		 213 aa  53.1  0.000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  34.51 
 
 		 225 aa  52.8  0.000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1607  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  27.84 
 
 		 237 aa  53.1  0.000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000707225 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3263  methyltransferase type 11  35 
 
 		 229 aa  53.1  0.000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6478  methyltransferase type 11  36.67 
 
 		 269 aa  52.8  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0560724  normal  0.10851 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0208  UbiE/COQ5 methyltransferase  30.71 
 
 		 250 aa  52.8  0.000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0448386  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2798  methyltransferase type 11  34.31 
 
 		 249 aa  52.8  0.000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.4443  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3776  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.36 
 
 		 237 aa  52.4  0.000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0393069  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2207  Methyltransferase type 11  33.8 
 
 		 219 aa  52.4  0.000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1569  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.36 
 
 		 237 aa  52.4  0.000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.781622  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4211  methyltransferase type 11  35.94 
 
 		 250 aa  52  0.000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11556  methyltransferase  33.82 
 
 		 347 aa  52  0.000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2245  Methyltransferase type 11  32.14 
 
 		 212 aa  52  0.000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.810534 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4438  methyltransferase type 11  35.94 
 
 		 252 aa  52  0.000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4277  methyltransferase type 11  35.94 
 
 		 252 aa  52  0.000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2653  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.06 
 
 		 232 aa  52  0.000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1355  Methyltransferase type 11  26.85 
 
 		 220 aa  51.2  0.00001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.632641  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0217  UbiE/COQ5 methyltransferase  28.67 
 
 		 255 aa  51.6  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0805678  normal  0.734054 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>