25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_3086 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_3086  Rubrerythrin  100 
 
 		 161 aa  324  3e-88  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1188  Rubrerythrin  95.03 
 
 		 161 aa  310  6.999999999999999e-84  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.20623  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2291  rubrerythrin  45.28 
 
 		 161 aa  146  1.0000000000000001e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.683509  normal  0.317377 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2193  hypothetical protein  44.03 
 
 		 161 aa  137  4.999999999999999e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0430  rubrerythrin  44.03 
 
 		 161 aa  126  1.0000000000000001e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00579708  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1897  hypothetical protein  42.24 
 
 		 159 aa  122  2e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00778692  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1315  hypothetical protein  33.93 
 
 		 171 aa  78.2  0.00000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.155182  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0468  rubrerythrin  28.57 
 
 		 161 aa  70.9  0.000000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0818206  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2967  hypothetical protein  31.29 
 
 		 163 aa  66.6  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1311  Rubrerythrin  30.46 
 
 		 159 aa  59.3  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000177343 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2914  Rubrerythrin  29.33 
 
 		 159 aa  56.6  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1807  rubrerythrin  30.92 
 
 		 151 aa  50.1  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0765  rubrerythrin  28.38 
 
 		 151 aa  49.3  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.000572509  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2114  Rubrerythrin  25.68 
 
 		 151 aa  49.3  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1085  hypothetical protein  24.36 
 
 		 162 aa  46.2  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.265267 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1323  rubrerythrin  27.52 
 
 		 149 aa  45.1  0.0004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.116816  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0416  rubrerythrin  30.28 
 
 		 185 aa  45.4  0.0004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3150  rubrerythrin  26.32 
 
 		 150 aa  43.9  0.0009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.138111  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0378  Rhodanese domain protein  24.66 
 
 		 284 aa  43.1  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.656719  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2304  Rubrerythrin  24.85 
 
 		 161 aa  42  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000648386  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3242  rubrerythrin  26.03 
 
 		 163 aa  42.4  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000412048  hitchhiker  0.000706309 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0583  Rubrerythrin  27.74 
 
 		 161 aa  41.6  0.005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1783  hypothetical protein  29.33 
 
 		 151 aa  40.8  0.008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.127386  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0797  rubrerythrin  24.64 
 
 		 173 aa  40.8  0.009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3220  rubrerythrin  26.71 
 
 		 164 aa  40.4  0.01  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.580262  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>