255 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_1711 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012918  GM21_1711  glycosyl transferase family 2  100 
 
 
337 aa  692    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.9788799999999997e-27 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2508  glycosyl transferase family 2  94.36 
 
 
337 aa  638    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000796473  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2865  glycosyl transferase family protein  47.95 
 
 
345 aa  333  3e-90  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000384977  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0919  glycosyl transferase family protein  42.65 
 
 
355 aa  285  8e-76  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00244033  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2088  glycosyl transferase, group 2 family protein  40.17 
 
 
384 aa  266  5e-70  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0979  glycosyl transferase family 2  36.09 
 
 
341 aa  191  2e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000658862  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3593  glycosyl transferase family protein  35.1 
 
 
346 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00282179  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0907  glycosyl transferase family protein  29.84 
 
 
415 aa  85.9  8e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00249013  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3374  glycosyl transferase family 2  27.8 
 
 
1435 aa  80.9  0.00000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2178  glycosyl transferase family protein  26.94 
 
 
1256 aa  79.7  0.00000000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1129  glycosyl transferase family 2  27.42 
 
 
785 aa  78.6  0.0000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0652  putative glycosyl transferase  24.18 
 
 
1119 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.427712 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1485  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.61 
 
 
427 aa  74.3  0.000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0313881  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3142  glycosyl transferase family 2  32.63 
 
 
430 aa  73.9  0.000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3336  glycosyl transferase family protein  26.55 
 
 
1268 aa  73.6  0.000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01594  glycosyltransferase  25.91 
 
 
700 aa  72.8  0.000000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0057  methyltransferase FkbM family  22.04 
 
 
723 aa  72  0.00000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3023  glycosyl transferase, group 1/2 family protein  24.79 
 
 
2401 aa  70.9  0.00000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1063  glycosyl transferase family protein  28.51 
 
 
818 aa  70.9  0.00000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0777  glycosyl transferase family 2  26.41 
 
 
280 aa  70.1  0.00000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0114  glycosyl transferase family 2  26.86 
 
 
410 aa  69.3  0.0000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2268  glycosyl transferase family protein  25.11 
 
 
1600 aa  68.2  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.59897  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3740  glycosyl transferase family 2  23.94 
 
 
1523 aa  67.4  0.0000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3823  glycosyl transferase family 2  23.47 
 
 
1523 aa  66.6  0.0000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.588357 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0257  glycosyl transferase family 2  26.37 
 
 
1340 aa  66.2  0.0000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3218  glycosyl transferase family protein  20.8 
 
 
902 aa  64.7  0.000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0552261  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1887  glycosyl transferase family 2  25.25 
 
 
353 aa  64.7  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3110  glycosyl transferase family 2  29.82 
 
 
325 aa  64.3  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3797  hypothetical protein  25.48 
 
 
1444 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0396  glycosyl transferase family protein  25.11 
 
 
625 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3118  glycosyl transferase family protein  29.39 
 
 
334 aa  63.9  0.000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0878  glycosyl transferase family protein  25.11 
 
 
625 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3821  glycosyl transferase family 2  24.28 
 
 
1739 aa  63.2  0.000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3852  glycosyl transferase family 2  22.46 
 
 
321 aa  62.8  0.000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1055  glycosyl transferase family 2  26.76 
 
 
1162 aa  62.4  0.000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.289988  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0432  glycosyl transferase family protein  25.66 
 
 
348 aa  62.8  0.000000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0724  glycosyl transferase family protein  25.1 
 
 
680 aa  62.4  0.00000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.647901  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2342  glycosyl transferase family protein  23.61 
 
 
270 aa  61.2  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4142  glycosyl transferase family protein  25.43 
 
 
1287 aa  61.6  0.00000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000068759 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0549  glycosyl transferase family protein  25.21 
 
 
818 aa  60.8  0.00000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0567321  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0578  glycosyl transferase family protein  25.42 
 
 
525 aa  60.8  0.00000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0620  glycosyl transferase, group 2 family protein  24.9 
 
 
610 aa  60.5  0.00000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0128  glycosyl transferase family 2  24.19 
 
 
1077 aa  60.1  0.00000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2086  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 
274 aa  60.1  0.00000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4138  glycosyl transferase family protein  27.15 
 
 
624 aa  60.1  0.00000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00102626 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4121  glycosyl transferase family protein  23.85 
 
 
850 aa  59.7  0.00000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.276059  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1318  glycosyl transferase family protein  25.73 
 
 
1314 aa  59.3  0.00000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.581884  normal  0.368047 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4204  glycosyl transferase family 2  22.73 
 
 
305 aa  58.5  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0351  glycosyl transferase family protein  21.49 
 
 
994 aa  58.9  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.792541  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0851  glycosyl transferase family protein  22.22 
 
 
1152 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0023  glycosyl transferase family 2  21.59 
 
 
703 aa  58.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0044  glycosyl transferase family protein  23.63 
 
 
746 aa  57.8  0.0000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2676  b-glycosyltransferase  20.49 
 
 
338 aa  58.2  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1298  glycosyl transferase family protein  32.48 
 
 
289 aa  58.2  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0767  glycosyl transferase family 2  23.02 
 
 
602 aa  58.5  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0632  glycosyl transferase family protein  23.08 
 
 
1312 aa  56.6  0.0000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.900451 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2074  glycosyl transferase family 2  24.69 
 
 
286 aa  57  0.0000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0069  glycosyl transferase family 2  25.51 
 
 
302 aa  56.6  0.0000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.866174  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0185  glycosyl transferase family 2  22.75 
 
 
305 aa  56.6  0.0000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0197048  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0278  glycosyl transferase family 2  25.71 
 
 
576 aa  56.2  0.0000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.859999  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2011  glycosyl transferase family 2  23.64 
 
 
335 aa  55.8  0.0000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.814426  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0117  glycosyl transferase family 2  23.3 
 
 
777 aa  55.8  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.389637  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0778  glycosyl transferase family 2  30.43 
 
 
384 aa  55.5  0.000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1510  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.4 
 
 
310 aa  54.7  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.932376  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3834  glycosyl transferase, group 2 family protein  24.53 
 
 
327 aa  54.7  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000153474  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0086  glycosyl transferase family protein  24.53 
 
 
327 aa  54.7  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0142969  normal  0.0610644 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0564  glycosyl transferase family 2  25.82 
 
 
670 aa  54.7  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.501276 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3992  glycosyl transferase family 2  23.95 
 
 
1317 aa  54.3  0.000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.33593  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0684  glycosyl transferase family 2  29.31 
 
 
350 aa  54.3  0.000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.584656 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0849  glycosyl transferase family protein  24.4 
 
 
625 aa  54.3  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.33844 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0589  glycosyl transferase family protein  25.99 
 
 
684 aa  53.9  0.000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.271762  normal  0.0559054 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03480  putative beta1,3-glucosyltransferase  25.16 
 
 
327 aa  53.5  0.000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.307597  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1576  glycosyl transferase family 2  21.88 
 
 
746 aa  53.5  0.000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4126  glycosyl transferase, group 2 family protein  25.16 
 
 
327 aa  53.5  0.000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.521987  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6296  glycosyl transferase family 2  25.11 
 
 
814 aa  53.5  0.000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4050  glycosyl transferase, group 2 family protein  25.16 
 
 
327 aa  53.5  0.000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3960  glycosyl transferase, group 2 family protein  23.9 
 
 
327 aa  53.5  0.000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0389703  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03431  hypothetical protein  25.16 
 
 
327 aa  53.5  0.000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.1979  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2030  glycosyl transferase family 2  28.21 
 
 
303 aa  53.5  0.000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.952561  hitchhiker  0.000668775 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0288  glycosyl transferase family protein  19.61 
 
 
709 aa  53.1  0.000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3719  glycosyl transferase family 2  24.59 
 
 
327 aa  53.1  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12320  glycosyl transferase  29.66 
 
 
343 aa  53.1  0.000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2370  glycosyltransferase  26.71 
 
 
319 aa  53.1  0.000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0772  glycosyl transferase family protein  19.61 
 
 
709 aa  53.1  0.000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5500  glycosyl transferase family 2  30.82 
 
 
308 aa  53.1  0.000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.359708  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0841  glycosyl transferase family 2  23.85 
 
 
337 aa  53.1  0.000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0502  glycosyl transferase family 2  21.9 
 
 
355 aa  52.8  0.000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.925562  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0773  glycosyl transferase family protein  20.8 
 
 
369 aa  52.8  0.000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4271  glycosyl transferase family 2  23.87 
 
 
528 aa  52.8  0.000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1147  glycosyl transferase family 2  23.73 
 
 
338 aa  52.8  0.000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.466774  hitchhiker  0.00852999 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3180  glycosyl transferase family 2  29.09 
 
 
322 aa  52.8  0.000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.816568  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3636  glycosyl transferase family protein  22.97 
 
 
322 aa  52.4  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.281554  normal  0.0212445 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0817  hypothetical protein  27.07 
 
 
297 aa  52.4  0.00001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0718  glycosyl transferase family protein  23.02 
 
 
1106 aa  52.4  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.411794  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1867  glycosyl transferase  21.7 
 
 
283 aa  52.4  0.00001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1836  methyltransferase FkbM family  24.36 
 
 
1673 aa  52.4  0.00001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0628  glycosyl transferase family protein  24.16 
 
 
306 aa  52  0.00001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.154474 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3489  glycosyl transferase family protein  25.63 
 
 
635 aa  52  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.473052  normal  0.0475235 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4035  glycosyl transferase family protein  29.14 
 
 
344 aa  52  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2678  glycosyl transferase family protein  27.59 
 
 
841 aa  52.8  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>