35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_1252 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_1252  DNA polymerase beta domain protein region  100 
 
 		 136 aa  276  7e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.859255 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2978  DNA polymerase beta domain protein region  86.15 
 
 		 217 aa  226  1e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1397  DNA polymerase beta domain protein region  55.08 
 
 		 134 aa  127  4.0000000000000003e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0347326  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1760  DNA polymerase beta domain protein region  43.97 
 
 		 135 aa  75.9  0.0000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0269  nucleotidyltransferase  39.53 
 
 		 135 aa  72  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5679  putative nucleotidyltransferase  39.52 
 
 		 135 aa  71.6  0.000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0666104  decreased coverage  0.000482275 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2281  nucleotidyltransferase  36.29 
 
 		 132 aa  68.2  0.00000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0106509  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3165  hypothetical protein  34.21 
 
 		 139 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2422  DNA polymerase beta subunit  41.07 
 
 		 135 aa  65.5  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2345  DNA polymerase beta domain protein region  36 
 
 		 144 aa  64.3  0.0000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1075  DNA polymerase beta subunit  37.27 
 
 		 132 aa  62.8  0.000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141135 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1276  DNA polymerase beta subunit  34.85 
 
 		 129 aa  60.1  0.000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000156571 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0133  DNA polymerase beta subunit  34.15 
 
 		 131 aa  56.6  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0882  DNA polymerase beta subunit  35.29 
 
 		 156 aa  55.8  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000293265 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0893  DNA polymerase beta domain-containing protein region  33.59 
 
 		 143 aa  52.4  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2946  DNA polymerase beta subunit  33.87 
 
 		 131 aa  52  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4418  DNA polymerase beta subunit  37.21 
 
 		 148 aa  50.1  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.234666 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2954  DNA polymerase beta subunit  30.3 
 
 		 133 aa  49.7  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2332  DNA polymerase beta subunit  34.78 
 
 		 128 aa  49.7  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0658  DNA polymerase beta subunit  32.32 
 
 		 137 aa  48.5  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000311195  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1316  nucleotidyltransferase  34.21 
 
 		 148 aa  48.1  0.00004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3257  DNA polymerase, beta-like region  30.63 
 
 		 132 aa  47.8  0.00006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00329127  hitchhiker  2.42256e-16 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0825  DNA polymerase beta subunit  35.96 
 
 		 140 aa  47  0.00009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.453012  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0763  DNA polymerase beta subunit  34.88 
 
 		 143 aa  46.2  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.122769 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1736  hypothetical protein  32.71 
 
 		 271 aa  46.2  0.0002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.76389  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3676  DNA polymerase beta domain protein region  33.33 
 
 		 132 aa  45.4  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.839378  normal  0.137366 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0225  DNA polymerase beta domain protein region  32.05 
 
 		 142 aa  46.2  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1668  DNA polymerase beta domain protein region  36.62 
 
 		 146 aa  44.3  0.0005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0364  DNA polymerase beta subunit  29.91 
 
 		 148 aa  44.3  0.0005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0250  DNA polymerase beta subunit  37.21 
 
 		 137 aa  43.9  0.0008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2734  DNA polymerase beta domain protein region  38.81 
 
 		 144 aa  41.6  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.174135  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0331  hypothetical protein  31.11 
 
 		 134 aa  41.6  0.004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0231643  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2353  DNA polymerase beta domain protein region  38.67 
 
 		 116 aa  40.8  0.006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1589  DNA polymerase beta domain protein region  31.52 
 
 		 132 aa  40.8  0.006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.382693  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1672  DNA polymerase beta domain protein region  30.21 
 
 		 146 aa  40.4  0.009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>