65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_0129 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_0129  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  100 
 
 		 171 aa  347  5e-95  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0146  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  96.49 
 
 		 171 aa  311  2.9999999999999996e-84  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.613584  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1182  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  35.42 
 
 		 148 aa  84  0.000000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.900555  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001938  hypothetical protein  33.08 
 
 		 143 aa  74.7  0.0000000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4394  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  36.62 
 
 		 147 aa  73.6  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.001025  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4086  hemerythrin HHE cation binding region  30.07 
 
 		 146 aa  72.8  0.000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0733  hypothetical protein  35.29 
 
 		 195 aa  72.4  0.000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.21283  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1764  hypothetical protein  36.6 
 
 		 150 aa  71.2  0.000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4534  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  29.33 
 
 		 345 aa  70.9  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2501  hemerythrin  32.61 
 
 		 160 aa  70.1  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4302  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  34.97 
 
 		 171 aa  68.6  0.00000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5414  hypothetical protein  31.72 
 
 		 157 aa  66.2  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01683  hypothetical protein  30.94 
 
 		 151 aa  65.1  0.0000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0790342  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4867  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  32.65 
 
 		 158 aa  64.7  0.0000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00231267  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3570  hemerythrin HHE cation binding region  30.22 
 
 		 145 aa  63.2  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.499938 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0691  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  31.33 
 
 		 147 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3879  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  31.94 
 
 		 165 aa  62.8  0.000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2777  hemerythrin HHE cation binding protein  28.57 
 
 		 145 aa  62.8  0.000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2773  hypothetical protein  28.67 
 
 		 147 aa  62  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0249473  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1486  hemerythrin HHE cation binding region  31.93 
 
 		 168 aa  60.5  0.00000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4614  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  30 
 
 		 185 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.178279  normal  0.138326 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0069  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  33.06 
 
 		 158 aa  59.7  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1146  hemerythrin HHE cation binding region  26.21 
 
 		 146 aa  59.7  0.00000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.184168  normal  0.471523 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3504  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  26.19 
 
 		 271 aa  58.9  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.033907  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2426  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  37.14 
 
 		 163 aa  59.3  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.13977  normal  0.0393648 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2188  hemerythrin HHE cation binding region  27.1 
 
 		 162 aa  58.5  0.00000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5496  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  32.54 
 
 		 184 aa  58.2  0.00000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0180  hemerythrin HHE cation binding region protein  35.78 
 
 		 166 aa  56.6  0.0000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0077  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  32.26 
 
 		 158 aa  56.6  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.556159 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0362  hypothetical protein  31.21 
 
 		 162 aa  57  0.0000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1828  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  29.5 
 
 		 145 aa  57  0.0000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0340  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  30.61 
 
 		 159 aa  57  0.0000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000991487  hitchhiker  0.00000000430115 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2304  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  33.85 
 
 		 155 aa  55.8  0.0000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.49085  hitchhiker  0.00000533583 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2248  hypothetical protein  30.47 
 
 		 161 aa  55.1  0.0000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00300  hemerythrin HHE cation binding protein  29.41 
 
 		 157 aa  55.1  0.0000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2007  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  28.8 
 
 		 164 aa  55.1  0.0000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1404  hemerythrin HHE cation binding protein  34.29 
 
 		 165 aa  54.7  0.0000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2453  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  34.29 
 
 		 165 aa  54.3  0.0000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.217194  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2549  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  34.29 
 
 		 165 aa  54.3  0.0000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1421  hemerythrin HHE cation binding region protein  30.94 
 
 		 178 aa  54.3  0.0000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00370  hypothetical protein  25.34 
 
 		 196 aa  53.1  0.000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.284993 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1827  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  32.08 
 
 		 149 aa  53.1  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3897  hemerythrin HHE cation binding region  26.76 
 
 		 351 aa  52  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.65028  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1791  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  26.06 
 
 		 346 aa  51.2  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.482606  normal  0.753058 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4232  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  30.28 
 
 		 178 aa  50.4  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2480  hypothetical protein  29.63 
 
 		 177 aa  49.7  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0435976  normal  0.540036 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0996  hypothetical protein  31.08 
 
 		 169 aa  49.3  0.00003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.457689  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2793  Hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  26.49 
 
 		 185 aa  47.8  0.00008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0769418  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0603  hemerythrin HHE cation binding region  32.46 
 
 		 154 aa  47.4  0.00009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.499729  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3837  hypothetical protein  20 
 
 		 445 aa  47  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0111576  normal  0.104463 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0858  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  29.17 
 
 		 186 aa  47  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2404  hemerythrin HHE cation binding region  28.57 
 
 		 158 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00792518 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08638  HHE domain protein (AFU_orthologue; AFUA_4G00730)  28.95 
 
 		 228 aa  46.2  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.000349477  normal  0.759451 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5327  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  24.16 
 
 		 347 aa  45.8  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2004  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  24.46 
 
 		 151 aa  45.8  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA02980  conserved hypothetical protein  29.89 
 
 		 220 aa  45.4  0.0004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.959027  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3909  hemerythrin HHE cation binding region  29.6 
 
 		 147 aa  44.3  0.0008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.288591  normal  0.315835 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2722  hemerythrin HHE cation binding domain protein  29.81 
 
 		 154 aa  44.3  0.0009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05325  conserved hypothetical protein  26.63 
 
 		 206 aa  43.9  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3465  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  26.09 
 
 		 147 aa  43.5  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.15554  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2678  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  23.72 
 
 		 187 aa  42.7  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.027018 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2008  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  24.66 
 
 		 202 aa  42.4  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2146  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  25.83 
 
 		 350 aa  42.4  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.460261 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3032  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  28.57 
 
 		 154 aa  42.4  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2543  hypothetical protein  26.32 
 
 		 216 aa  41.6  0.005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.771916  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>