More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_6991 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_6991  luciferase family protein  100 
 
 
306 aa  606  9.999999999999999e-173  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6834  luciferase family protein  32.88 
 
 
327 aa  122  9.999999999999999e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1645  luciferase family protein  30.87 
 
 
315 aa  117  3e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6951  luciferase family protein  31.51 
 
 
322 aa  114  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.247532 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0810  luciferase family protein  31.86 
 
 
308 aa  98.2  1e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4637  luciferase-like protein  30.8 
 
 
293 aa  91.3  2e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4099  luciferase-like protein  27.79 
 
 
334 aa  91.7  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0761616 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4725  luciferase family protein  30.8 
 
 
293 aa  91.3  2e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3595  luciferase family protein  32.54 
 
 
285 aa  91.7  2e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.26001  normal  0.696176 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3175  Luciferase-like monooxygenase  31.38 
 
 
278 aa  89.7  5e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0012092 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5019  luciferase family protein  30.36 
 
 
293 aa  89.7  5e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2912  luciferase family protein  32.2 
 
 
285 aa  89.7  5e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.122178  normal  0.460914 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3326  luciferase-like protein  31.43 
 
 
286 aa  89.7  6e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3388  Fis family transcriptional regulator  31.43 
 
 
286 aa  89.7  6e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.695689  normal  0.0265519 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3337  Fis family transcriptional regulator  31.43 
 
 
286 aa  89.7  6e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.122332  normal  0.403039 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0339  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  35.38 
 
 
314 aa  89  8e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4027  luciferase family protein  25.57 
 
 
306 aa  89  9e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.826665 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4163  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  28.47 
 
 
285 aa  88.6  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.6036  normal  0.953662 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3185  luciferase family protein  25.32 
 
 
317 aa  87.8  2e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3436  luciferase family protein  25.32 
 
 
317 aa  87.8  2e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5167  luciferase family protein  32.27 
 
 
306 aa  87.8  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3086  luciferase family protein (alkanal monooxygenase, FMN-linked)  25.32 
 
 
317 aa  87.4  3e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3417  luciferase family protein  25.32 
 
 
320 aa  87.4  3e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3167  luciferase family protein (alkanal monooxygenase (FMN-linked))  25.32 
 
 
317 aa  86.7  4e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.282639  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1590  luciferase family protein  30.59 
 
 
306 aa  86.3  6e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3405  luciferase family protein  25.32 
 
 
317 aa  86.3  6e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0454  Luciferase-like monooxygenase  28.04 
 
 
322 aa  85.9  7e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0291  luciferase-like protein  31 
 
 
283 aa  85.1  0.000000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.336423  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0301  luciferase family protein  31 
 
 
283 aa  85.1  0.000000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.422839 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0282  luciferase family protein  31 
 
 
283 aa  85.1  0.000000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4839  luciferase family protein  29.44 
 
 
272 aa  85.5  0.000000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.343034  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7422  Luciferase-like monooxygenase  29.82 
 
 
316 aa  84.3  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.33827  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3219  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  36.27 
 
 
299 aa  84.3  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.58554  normal  0.82683 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0369  luciferase-like protein  30.84 
 
 
307 aa  80.9  0.00000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0907338  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3382  luciferase-type oxidoreductase  30.77 
 
 
307 aa  81.3  0.00000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0329  luciferase-like protein  27.99 
 
 
306 aa  80.5  0.00000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0339  luciferase family protein  27.99 
 
 
306 aa  80.5  0.00000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.890109  normal  0.347721 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0318  luciferase family protein  27.99 
 
 
306 aa  80.5  0.00000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3900  Luciferase-like, subgroup  28.47 
 
 
335 aa  80.9  0.00000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.310372  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2881  luciferase-like protein  29.6 
 
 
334 aa  80.1  0.00000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4419  Luciferase-like, subgroup  28.05 
 
 
311 aa  80.1  0.00000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3368  luciferase family protein  29.39 
 
 
278 aa  79.3  0.00000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.852738  normal  0.168989 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4400  Luciferase-like monooxygenase  29.27 
 
 
286 aa  79  0.00000000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7375  Luciferase-like monooxygenase  34.66 
 
 
282 aa  79  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.758616 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3538  Luciferase-like, subgroup  33.18 
 
 
278 aa  77.8  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.240263  normal  0.716857 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2183  Luciferase-like monooxygenase  30.69 
 
 
289 aa  77.8  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8770  Luciferase-like monooxygenase  30.53 
 
 
295 aa  77.8  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.547514 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4899  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  27.49 
 
 
291 aa  77  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0126624  normal  0.510583 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2703  Luciferase-like monooxygenase  32.29 
 
 
341 aa  75.5  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.190412  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0849  luciferase family protein  25.94 
 
 
293 aa  75.1  0.000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.713393  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1250  Luciferase-like monooxygenase  30.6 
 
 
296 aa  75.5  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1563  luciferase family protein  41.35 
 
 
299 aa  74.7  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.413404 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1334  luciferase-type oxidoreductase  28.45 
 
 
306 aa  74.7  0.000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.450235  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1207  putative F420-dependent oxidoreductase  31.77 
 
 
327 aa  74.3  0.000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.814029  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4430  luciferase-like  26.11 
 
 
337 aa  73.9  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.173582  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4141  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  32 
 
 
285 aa  73.9  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.628473  normal  0.0129648 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2322  luciferase family protein  30.3 
 
 
281 aa  73.6  0.000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4370  hypothetical protein  29.67 
 
 
284 aa  73.2  0.000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0709  Luciferase-like monooxygenase  29.45 
 
 
307 aa  72.8  0.000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4138  luciferase-like protein  22.19 
 
 
353 aa  72.8  0.000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4723  hypothetical protein  29.03 
 
 
288 aa  72  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4343  hypothetical protein  29.03 
 
 
288 aa  71.6  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0191984  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4429  hypothetical protein  29.03 
 
 
288 aa  71.6  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.184143  normal  0.205104 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3525  Luciferase-like monooxygenase  28.7 
 
 
291 aa  70.9  0.00000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.011869  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1478  putative luciferase-alpha subunit  29.95 
 
 
330 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00296323 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2098  luciferase family protein  25.9 
 
 
309 aa  70.5  0.00000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.463112 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0272  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  26.56 
 
 
292 aa  70.9  0.00000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.505051  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3119  Luciferase-like monooxygenase  32.06 
 
 
299 aa  70.9  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.460925  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0161  luciferase-like  34.53 
 
 
289 aa  70.1  0.00000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1970  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  27.97 
 
 
293 aa  70.1  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2282  Luciferase-like monooxygenase  29.02 
 
 
312 aa  70.5  0.00000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0554594  normal  0.109814 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4131  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  33.09 
 
 
289 aa  69.7  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.107679  normal  0.0404326 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2920  luciferase family protein  35.48 
 
 
291 aa  69.7  0.00000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0594  luciferase-like protein  29.63 
 
 
312 aa  69.7  0.00000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.852458 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4098  luciferase family protein  25.83 
 
 
310 aa  69.3  0.00000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.207864  normal  0.49324 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2367  luciferase family protein  26.12 
 
 
322 aa  69.3  0.00000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.184521  hitchhiker  0.000901573 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4790  luciferase-like protein  34.31 
 
 
284 aa  68.9  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1979  Luciferase-like monooxygenase  33.08 
 
 
291 aa  67.8  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.132329  normal  0.747602 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4624  luciferase family protein  23.91 
 
 
306 aa  68.2  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3854  Luciferase-like, subgroup  28.8 
 
 
288 aa  68.2  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0625  Luciferase-like monooxygenase  28.12 
 
 
332 aa  67.8  0.0000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00154415  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2329  Luciferase-like monooxygenase  40.38 
 
 
339 aa  67.8  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.270807  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5598  luciferase-like protein  27.7 
 
 
294 aa  67.8  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2186  luciferase-like protein  28.42 
 
 
310 aa  67  0.0000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.423156  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11883  oxidoreductase  26.51 
 
 
307 aa  67.4  0.0000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.352058 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2831  luciferase family protein  26.02 
 
 
290 aa  67.4  0.0000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0195486 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2814  Luciferase-like monooxygenase  26.16 
 
 
314 aa  67.4  0.0000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1552  Luciferase-like monooxygenase  28.64 
 
 
284 aa  67  0.0000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2247  luciferase family protein  25.87 
 
 
310 aa  67  0.0000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4740  Luciferase-like monooxygenase  28.79 
 
 
330 aa  67  0.0000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8869  Luciferase-like monooxygenase  26.87 
 
 
336 aa  67  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0086  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  27.65 
 
 
313 aa  66.6  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6444  luciferase family protein  29.45 
 
 
293 aa  66.6  0.0000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.16375 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2104  luciferase family protein  30.77 
 
 
353 aa  65.9  0.0000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4525  luciferase-like protein  32.93 
 
 
283 aa  66.2  0.0000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5942  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  30.54 
 
 
252 aa  66.2  0.0000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5372  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  30.21 
 
 
287 aa  66.2  0.0000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0364521 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0572  Luciferase-like monooxygenase  25.21 
 
 
316 aa  66.2  0.0000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1522  Luciferase-like monooxygenase  30.21 
 
 
300 aa  65.9  0.0000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0131104  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0164  Luciferase-like monooxygenase  27.97 
 
 
334 aa  65.9  0.0000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>