More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3254 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_3254  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 		 447 aa  902    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4660  glycoside hydrolase family protein  78.4 
 
 		 413 aa  649    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.503774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0511  glycoside hydrolase family 1  51.09 
 
 		 401 aa  372  1e-102  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0421  glycoside hydrolase family 1  47.45 
 
 		 419 aa  368  1e-100  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5280  glycoside hydrolase family protein  45.73 
 
 		 411 aa  358  7e-98  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0160415 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4005  glycoside hydrolase family protein  44.83 
 
 		 437 aa  343  5e-93  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02700  beta-glucosidase/6-phospho-beta- glucosidase/beta-galactosidase  47.04 
 
 		 407 aa  335  1e-90  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.630068  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2526  glycoside hydrolase family 1  46.81 
 
 		 388 aa  324  3e-87  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0542  glycoside hydrolase family protein  44.28 
 
 		 439 aa  318  2e-85  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.294362  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0789  glycoside hydrolase family protein  40.45 
 
 		 443 aa  313  2.9999999999999996e-84  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0245888  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0462  Beta-glucosidase  34.92 
 
 		 418 aa  254  2.0000000000000002e-66  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.626526  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2967  glycoside hydrolase family protein  34.04 
 
 		 431 aa  223  6e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1932  glycoside hydrolase family protein  33.57 
 
 		 431 aa  218  2e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.536159  hitchhiker  0.00000905056 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1799  beta-galactosidase  31.68 
 
 		 446 aa  217  2.9999999999999998e-55  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000188458  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0529  glycoside hydrolase family 1  31.94 
 
 		 417 aa  211  2e-53  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1530  Beta-glucosidase  30.33 
 
 		 438 aa  206  5e-52  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000111423  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04820  Beta-glucosidase  29.6 
 
 		 432 aa  204  2e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0266886  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0969  beta-galactosidase  31.22 
 
 		 446 aa  204  3e-51  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00738034  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0212  Beta-glucosidase  29.24 
 
 		 471 aa  204  3e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.292852  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1578  beta-glucosidase  32.76 
 
 		 450 aa  204  4e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.302978  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0952  Beta-glucosidase  31 
 
 		 446 aa  202  9.999999999999999e-51  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000326763  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1895  beta-galactosidase  33.04 
 
 		 453 aa  200  3.9999999999999996e-50  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.785457  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0374  beta-galactosidase  31.32 
 
 		 450 aa  199  7e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4282  beta-galactosidase  33.41 
 
 		 455 aa  199  1.0000000000000001e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0189474  normal  0.48093 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1509  Beta-glucosidase  33.48 
 
 		 478 aa  199  1.0000000000000001e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000143364 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1638  Beta-glucosidase  30.73 
 
 		 439 aa  197  3e-49  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1788  beta-galactosidase  33.33 
 
 		 472 aa  197  3e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.586379  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1560  glycoside hydrolase family protein  33.84 
 
 		 478 aa  197  3e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.677245 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0493  beta-galactosidase  30.72 
 
 		 446 aa  196  5.000000000000001e-49  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7167  Beta-glucosidase  34.48 
 
 		 459 aa  195  1e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0225404 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1019  Beta-glucosidase  32.41 
 
 		 448 aa  194  2e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.477065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2401  Beta-glucosidase  33.55 
 
 		 452 aa  192  8e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00110187  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1537  glycoside hydrolase family protein  33.02 
 
 		 399 aa  191  2.9999999999999997e-47  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.37521  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1428  glycoside hydrolase family protein  28.3 
 
 		 442 aa  189  5.999999999999999e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.574986  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0133  beta-galactosidase  32.84 
 
 		 478 aa  189  1e-46  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0458  beta-galactosidase  30 
 
 		 452 aa  188  1e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000753308  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2862  Beta-glucosidase  35.18 
 
 		 443 aa  188  2e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.753347  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2422  Beta-glucosidase  30.87 
 
 		 474 aa  186  5e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000277167  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0839  beta-galactosidase  32.04 
 
 		 488 aa  186  7e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.411706  normal  0.263792 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0390  Beta-glucosidase  32.72 
 
 		 467 aa  185  1.0000000000000001e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0163066 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1102  Beta-glucosidase  31.87 
 
 		 448 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.1825  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15280  glycoside hydrolase family 1  30.04 
 
 		 451 aa  184  2.0000000000000003e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000225524  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7170  Beta-glucosidase  33.83 
 
 		 474 aa  184  3e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0420556 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0288  beta-galactosidase  32.89 
 
 		 444 aa  183  5.0000000000000004e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000531793  normal  0.536803 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3811  b-glucosidase  29.55 
 
 		 462 aa  183  7e-45  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.584755 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1939  beta-galactosidase  32.34 
 
 		 458 aa  182  8.000000000000001e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.000000180548  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3309  Beta-glucosidase  32.95 
 
 		 444 aa  182  8.000000000000001e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.581632  normal  0.566627 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6572  Beta-glucosidase  33.48 
 
 		 458 aa  182  1e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0265684  normal  0.0290842 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06938  beta-glucosidase  31.65 
 
 		 449 aa  181  2e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5888  beta-galactosidase  33.1 
 
 		 470 aa  181  2e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1944  Beta-glucosidase  33.41 
 
 		 433 aa  181  2e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.781532  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2781  beta-galactosidase  31.9 
 
 		 456 aa  181  2e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3305  Beta-glucosidase  31.38 
 
 		 474 aa  181  2.9999999999999997e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.40854 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1733  beta-galactosidase  29.86 
 
 		 482 aa  178  2e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.174879  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1896  beta-galactosidase  31.11 
 
 		 439 aa  178  2e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.42466 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3701  beta-galactosidase  30.11 
 
 		 457 aa  177  3e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3403  beta-galactosidase  31.12 
 
 		 457 aa  177  4e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.968269  normal  0.135443 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6082  glycoside hydrolase family 1  30.96 
 
 		 436 aa  177  4e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3344  Beta-glucosidase  29.23 
 
 		 478 aa  176  6e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2605  beta-galactosidase  33.4 
 
 		 472 aa  176  7e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.620464 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0937  beta-galactosidase  31.76 
 
 		 484 aa  176  8e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0483408  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5087  beta-glucosidase  29.76 
 
 		 453 aa  176  9e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.167744  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4773  beta-galactosidase  33.86 
 
 		 447 aa  176  9e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1879  beta-galactosidase  30.91 
 
 		 488 aa  174  1.9999999999999998e-42  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.251034  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1146  Beta-glucosidase  34.25 
 
 		 440 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7951  Beta-glucosidase  32.51 
 
 		 437 aa  172  7.999999999999999e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0188  beta-galactosidase  30.97 
 
 		 472 aa  172  9e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2184  beta-galactosidase  33.91 
 
 		 471 aa  172  1e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000108551  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1349  beta-galactosidase  33.41 
 
 		 453 aa  172  1e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.135254  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08390  broad-specificity cellobiase  31.81 
 
 		 494 aa  172  1e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.817528  normal  0.180996 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2874  putative Beta-glucosidase A  33.11 
 
 		 440 aa  172  2e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.355603  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0743  Beta-glucosidase  29.03 
 
 		 475 aa  171  3e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1481  beta-galactosidase  30.69 
 
 		 467 aa  171  4e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3481  glycoside hydrolase family 1  28.15 
 
 		 470 aa  170  5e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3627  Beta-glucosidase  32.2 
 
 		 458 aa  170  5e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.904469  normal  0.578785 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2765  Beta-glucosidase  30.69 
 
 		 470 aa  170  6e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3397  beta-galactosidase  31.11 
 
 		 482 aa  169  9e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0879388 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1082  beta-galactosidase  30.85 
 
 		 447 aa  169  1e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.655373  normal  0.120438 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2084  Beta-glucosidase  32 
 
 		 440 aa  168  1e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.483435  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1520  Beta-glucosidase  32.58 
 
 		 440 aa  168  2e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0705421 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3614  Beta-glucosidase  31.83 
 
 		 448 aa  167  2.9999999999999998e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2786  Beta-glucosidase  31.33 
 
 		 468 aa  167  2.9999999999999998e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2763  beta-galactosidase  34.32 
 
 		 436 aa  167  5e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0979  Beta-glucosidase  28.66 
 
 		 475 aa  166  6.9999999999999995e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2324  glycoside hydrolase family protein  28.46 
 
 		 470 aa  166  8e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1327  glycoside hydrolase family 1  27.82 
 
 		 474 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.294079  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4587  Beta-glucosidase  31.85 
 
 		 465 aa  166  1.0000000000000001e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.349984  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4857  Beta-glucosidase  28.44 
 
 		 450 aa  165  1.0000000000000001e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.368438  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1084  beta-galactosidase  31.47 
 
 		 482 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.106414  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1654  beta-glucosidase A  32.49 
 
 		 435 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.484784  hitchhiker  0.0000345699 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3523  Beta-glucosidase  27.59 
 
 		 465 aa  164  3e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.233162  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5462  Beta-glucosidase  33.48 
 
 		 489 aa  163  7e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4295  Beta-glucosidase  29.2 
 
 		 447 aa  162  8.000000000000001e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000161333 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1895  beta-galactosidase  30.13 
 
 		 454 aa  162  1e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3061  beta-galactosidase  29.55 
 
 		 456 aa  160  3e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1840  Beta-glucosidase  30.61 
 
 		 458 aa  161  3e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.185877  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2667  Beta-glucosidase  27.7 
 
 		 470 aa  160  6e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1936  beta-galactosidase  29.77 
 
 		 458 aa  159  7e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.111209  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1754  beta-galactosidase  32.08 
 
 		 485 aa  159  7e-38  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0528393 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1838  beta-galactosidase  27.55 
 
 		 451 aa  159  1e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>