More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_2473 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_2473  luciferase family protein  100 
 
 
289 aa  573  1.0000000000000001e-163  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.702772  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4755  luciferase family protein  56.29 
 
 
293 aa  308  6.999999999999999e-83  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.757656  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0396  Luciferase-like monooxygenase  49.1 
 
 
288 aa  265  7e-70  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2780  luciferase family protein  49.32 
 
 
298 aa  263  3e-69  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.0000000437181  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5752  luciferase family protein  51.2 
 
 
288 aa  260  2e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0179397 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2560  luciferase family protein  49.47 
 
 
305 aa  257  1e-67  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.0000351517  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3016  hypothetical protein  48.24 
 
 
295 aa  223  3e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.098004  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4150  hypothetical protein  47.89 
 
 
296 aa  222  6e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3538  Luciferase-like, subgroup  41.28 
 
 
278 aa  127  3e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.240263  normal  0.716857 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3219  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  35.9 
 
 
299 aa  124  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.58554  normal  0.82683 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2877  luciferase-like protein  39.72 
 
 
291 aa  122  5e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.399246  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4569  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  38.89 
 
 
288 aa  122  8e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.658744  normal  0.0471725 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2907  luciferase family protein  39.72 
 
 
291 aa  122  9e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0407498  normal  0.486218 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2921  luciferase family protein  39.25 
 
 
351 aa  120  3e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4839  luciferase family protein  35.81 
 
 
272 aa  119  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.343034  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4419  Luciferase-like, subgroup  35.64 
 
 
311 aa  117  3e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0704  luciferase family protein  35.98 
 
 
346 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0169592 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2183  Luciferase-like monooxygenase  36 
 
 
289 aa  115  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2322  luciferase family protein  35.78 
 
 
281 aa  114  3e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1987  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  39.36 
 
 
273 aa  114  3e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0369  luciferase-like protein  36.55 
 
 
307 aa  112  9e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0907338  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0849  luciferase family protein  33.17 
 
 
293 aa  111  1.0000000000000001e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.713393  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3514  Luciferase-like monooxygenase  37.33 
 
 
295 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.726686  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4637  luciferase-like protein  30.9 
 
 
293 aa  109  5e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4725  luciferase family protein  30.9 
 
 
293 aa  109  5e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5019  luciferase family protein  30.83 
 
 
293 aa  108  8.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3326  luciferase-like protein  33.86 
 
 
286 aa  107  2e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3388  Fis family transcriptional regulator  33.86 
 
 
286 aa  107  2e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.695689  normal  0.0265519 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3337  Fis family transcriptional regulator  33.86 
 
 
286 aa  107  2e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.122332  normal  0.403039 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4624  luciferase family protein  34.78 
 
 
306 aa  106  4e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8770  Luciferase-like monooxygenase  32.37 
 
 
295 aa  105  7e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.547514 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1970  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  33.63 
 
 
293 aa  105  8e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24560  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  34.43 
 
 
277 aa  105  1e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.759524 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3595  luciferase family protein  35.23 
 
 
285 aa  103  2e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.26001  normal  0.696176 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2334  Luciferase-like monooxygenase  40.59 
 
 
304 aa  103  3e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0649051  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2831  luciferase family protein  36.32 
 
 
290 aa  103  3e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0195486 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0272  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  33.84 
 
 
292 aa  103  4e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.505051  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3175  Luciferase-like monooxygenase  33.64 
 
 
278 aa  102  7e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0012092 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4723  hypothetical protein  33.02 
 
 
288 aa  102  9e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2912  luciferase family protein  34.41 
 
 
285 aa  102  1e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.122178  normal  0.460914 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4343  hypothetical protein  33.02 
 
 
288 aa  101  2e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0191984  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3854  Luciferase-like, subgroup  35.68 
 
 
288 aa  100  2e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2098  luciferase family protein  35.29 
 
 
309 aa  101  2e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.463112 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4429  hypothetical protein  33.02 
 
 
288 aa  101  2e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.184143  normal  0.205104 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0291  luciferase-like protein  35.68 
 
 
283 aa  100  3e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.336423  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0301  luciferase family protein  35.68 
 
 
283 aa  100  3e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.422839 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5645  luciferase family protein  31.97 
 
 
284 aa  99.8  5e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.86442 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0972  luciferase-like protein  41.01 
 
 
342 aa  99.8  5e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1973  luciferase family protein  33.96 
 
 
274 aa  99.4  6e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1017  luciferase family protein  33.78 
 
 
276 aa  99  8e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5167  luciferase family protein  35.33 
 
 
306 aa  98.6  1e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0282  luciferase family protein  35.14 
 
 
283 aa  97.8  2e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1250  Luciferase-like monooxygenase  37.16 
 
 
296 aa  97.1  3e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3368  luciferase family protein  35.79 
 
 
278 aa  97.1  3e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.852738  normal  0.168989 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3525  Luciferase-like monooxygenase  34.88 
 
 
291 aa  96.7  4e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.011869  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3119  Luciferase-like monooxygenase  31.68 
 
 
299 aa  96.7  4e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.460925  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1590  luciferase family protein  36.41 
 
 
306 aa  96.3  5e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5598  luciferase-like protein  32.54 
 
 
294 aa  95.5  8e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5819  luciferase family protein  34.48 
 
 
274 aa  95.9  8e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.762331  normal  0.818563 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2634  luciferase family protein  35.58 
 
 
290 aa  95.1  1e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.112704 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4069  luciferase-like protein  33.48 
 
 
339 aa  94.7  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.377547  normal  0.436291 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4430  luciferase-like  33.17 
 
 
337 aa  94.7  2e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.173582  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4027  luciferase family protein  33.88 
 
 
306 aa  94.7  2e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.826665 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4400  Luciferase-like monooxygenase  31.25 
 
 
286 aa  94  3e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0339  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  35.16 
 
 
314 aa  93.6  4e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0487  luciferase family protein  34.07 
 
 
292 aa  92.8  5e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.372075  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10958  oxidoreductase  35.29 
 
 
288 aa  92.8  6e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.410507 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1977  Luciferase-like monooxygenase  32.67 
 
 
282 aa  92.8  7e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3566  Luciferase-like monooxygenase  34.98 
 
 
274 aa  92  9e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.136726  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5372  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  29.37 
 
 
287 aa  91.7  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0364521 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4097  luciferase family protein  30.12 
 
 
306 aa  90.1  4e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.607989  normal  0.480627 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1269  Luciferase-like monooxygenase  36.78 
 
 
290 aa  89.7  4e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.213447  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0329  luciferase-like protein  33.7 
 
 
306 aa  89.7  5e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0339  luciferase family protein  33.7 
 
 
306 aa  89.7  5e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.890109  normal  0.347721 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0318  luciferase family protein  33.7 
 
 
306 aa  89.7  5e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4370  hypothetical protein  32.29 
 
 
284 aa  89  8e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13096  hypothetical protein  33.33 
 
 
275 aa  89  8e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0377667  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1850  hypothetical protein  32.39 
 
 
290 aa  89  9e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2104  luciferase family protein  35.29 
 
 
353 aa  88.2  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2703  Luciferase-like monooxygenase  33.49 
 
 
341 aa  88.2  1e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.190412  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1645  luciferase family protein  30.28 
 
 
315 aa  88.2  1e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2400  Luciferase-like monooxygenase  33.82 
 
 
285 aa  88.6  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00843006  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1552  Luciferase-like monooxygenase  30.65 
 
 
284 aa  88.2  2e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2015  luciferase family protein  36.52 
 
 
308 aa  87.8  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.212649  normal  0.512168 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1886  luciferase-like  33.66 
 
 
287 aa  87.4  3e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.5944 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3873  putative F420-dependent oxidoreductase  36.31 
 
 
343 aa  87  3e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0154742  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0161  luciferase-like  31.87 
 
 
289 aa  86.3  5e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2032  luciferase-like protein  35.96 
 
 
308 aa  85.9  8e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2078  luciferase family protein  35.96 
 
 
308 aa  85.9  8e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.62194 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4740  Luciferase-like monooxygenase  28.17 
 
 
330 aa  85.1  0.000000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4885  luciferase family protein  31.11 
 
 
290 aa  85.5  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.795052  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1207  putative F420-dependent oxidoreductase  27.17 
 
 
327 aa  84.3  0.000000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.814029  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4131  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  34.07 
 
 
289 aa  84.7  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.107679  normal  0.0404326 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4599  Luciferase-like monooxygenase  27.48 
 
 
288 aa  84.7  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00704418 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2279  Luciferase-like monooxygenase  30.93 
 
 
311 aa  84.3  0.000000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.463796  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2521  luciferase-like monooxygenase  34.46 
 
 
364 aa  84.3  0.000000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  hitchhiker  0.00896395  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5013  Luciferase-like monooxygenase  29.83 
 
 
288 aa  84  0.000000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4544  luciferase family protein  34.59 
 
 
282 aa  83.6  0.000000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.178601 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4193  hypothetical protein  38.62 
 
 
339 aa  83.6  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.598863  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8767  hypothetical protein  33.5 
 
 
278 aa  83.2  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.430519 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>