134 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3275 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007777  Francci3_3275  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  100 
 
 
430 aa  885    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.879816 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1046  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  61.32 
 
 
437 aa  548  1e-155  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0338425 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6320  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  60.24 
 
 
446 aa  505  9.999999999999999e-143  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.809424 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3091  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  55.61 
 
 
454 aa  491  1e-137  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.169338  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0280  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  41.29 
 
 
441 aa  309  6.999999999999999e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1946  hypothetical protein  36.12 
 
 
445 aa  304  2.0000000000000002e-81  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3254  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  41.9 
 
 
435 aa  301  2e-80  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5059  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  41.67 
 
 
442 aa  292  1e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00110922 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0211  L-lysine 6-monooxygenase  40.99 
 
 
427 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.606934  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0571  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  38.26 
 
 
434 aa  281  2e-74  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.488636 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0950  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  37.09 
 
 
444 aa  280  5e-74  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0919  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  37.82 
 
 
442 aa  277  3e-73  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.245016  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3318  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  37.62 
 
 
441 aa  277  3e-73  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00871217 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4631  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  35.45 
 
 
445 aa  274  3e-72  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3179  L-lysine 6-monooxygenase IucD  35.22 
 
 
425 aa  272  8.000000000000001e-72  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.856954 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2520  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  36 
 
 
425 aa  268  2e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.730683 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0278  siderophore biosynthesis protein IucD  36.23 
 
 
437 aa  268  2e-70  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0586  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  34.38 
 
 
444 aa  266  5e-70  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0107165 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5731  L-ornithine N5-oxygenase  37.84 
 
 
438 aa  266  5.999999999999999e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0025  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  36.72 
 
 
437 aa  264  3e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.227506 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4809  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  37.12 
 
 
452 aa  256  4e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0783  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  35.56 
 
 
442 aa  256  7e-67  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0711  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucD  35.56 
 
 
442 aa  255  1.0000000000000001e-66  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1811  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  29.53 
 
 
426 aa  229  5e-59  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3333  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  32.85 
 
 
449 aa  215  9.999999999999999e-55  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2835  monooxygenase  31.94 
 
 
427 aa  211  3e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.165057 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4219  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  34.06 
 
 
457 aa  200  5e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.369251 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0217  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  30.5 
 
 
502 aa  199  9e-50  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0408  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  33.01 
 
 
431 aa  198  2.0000000000000003e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.232287  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1630  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  30.5 
 
 
445 aa  192  7e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3460  L-lysine 6-monooxygenase  30.7 
 
 
434 aa  191  2e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4057  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  30.59 
 
 
505 aa  190  4e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.457714  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0659  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  32 
 
 
471 aa  190  5e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0481875  normal  0.873986 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02102  hypothetical protein  29.95 
 
 
468 aa  188  2e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1073  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  31.92 
 
 
502 aa  186  7e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0118854  normal  0.903474 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1054  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  30.44 
 
 
463 aa  179  1e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0135  siderophore biosynthetis protein  27.42 
 
 
442 aa  172  7.999999999999999e-42  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4294  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  31.23 
 
 
432 aa  171  2e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.093868  hitchhiker  0.0000660921 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0592  lysine/ornithine N-monooxygenase  29.9 
 
 
447 aa  171  3e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.301691  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1510  siderophore biosynthesis protein  27.63 
 
 
496 aa  171  3e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0286  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  27.67 
 
 
455 aa  170  4e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1817  putative siderophore biosynthesis oxidoreductase protein  32.28 
 
 
462 aa  170  5e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2447  lysine N6-hydroxylase/L-ornithine N5-oxygenase family protein  27.92 
 
 
432 aa  169  7e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3189  lysine N6-hydroxylase/L-ornithine N5-oxygenase family protein  27.92 
 
 
432 aa  169  7e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.603333  normal  0.0134512 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2546  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  27.92 
 
 
432 aa  169  8e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3030  siderophore biosynthesis protein  27.6 
 
 
498 aa  169  1e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1520  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  27.38 
 
 
495 aa  168  2e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.217805 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1454  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  27.38 
 
 
496 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1093  L-ornithine 5-monooxygenase (L-ornithine N5-oxygenase)  31.54 
 
 
443 aa  166  9e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.865676 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2739  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  29.44 
 
 
428 aa  163  5.0000000000000005e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.234234 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2840  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  27.88 
 
 
442 aa  163  6e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000828048  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2708  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  27.56 
 
 
501 aa  161  2e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2411  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  27.07 
 
 
505 aa  161  2e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2809  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  27.56 
 
 
501 aa  161  2e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.242413 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3723  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  31.18 
 
 
452 aa  160  3e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.411426 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1656  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  27.56 
 
 
501 aa  160  3e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000130755 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4749  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  30.84 
 
 
432 aa  160  4e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.827287  normal  0.49584 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0513  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  28.33 
 
 
458 aa  160  4e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1825  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  30.72 
 
 
435 aa  160  5e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2730  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  27.32 
 
 
501 aa  159  9e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.100586  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0197  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  31.74 
 
 
456 aa  158  2e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0156088 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4036  lysine/ornithine N-monooxygenase  29.42 
 
 
462 aa  157  3e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3740  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  29.81 
 
 
439 aa  157  4e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2871  lysine/ornithine N-monooxygenase-like protein  31.59 
 
 
438 aa  156  6e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.774332  normal  0.562088 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2550  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  28.29 
 
 
428 aa  156  8e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.504762 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2874  L-ornithine N5-oxygenase  29.38 
 
 
443 aa  156  8e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.123675  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3173  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  26.57 
 
 
440 aa  155  1e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4488  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  32.33 
 
 
422 aa  153  5e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1810  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  30.28 
 
 
442 aa  153  5e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.633774 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1802  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  28.05 
 
 
496 aa  151  2e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.000066726  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1595  lysine/ornithine N-monooxygenase  31.48 
 
 
454 aa  151  2e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0832377  hitchhiker  0.00131609 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1345  L-ornithine 5-monooxygenase (L-ornithine N5-oxygenase)  32.63 
 
 
446 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0865314  normal  0.202415 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3691  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  31.57 
 
 
432 aa  147  3e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33810  L-ornithine N5-oxygenase  27.58 
 
 
443 aa  147  3e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00000120742  normal  0.0105626 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2790  L-ornithine 5-monooxygenase (L-ornithine N5-oxygenase)  30.63 
 
 
458 aa  147  3e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.122143 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1859  L-ornithine N5-oxygenase  28.06 
 
 
445 aa  147  5e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.886808  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05823  Ornithine monooxygenasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q7Z8P5]  28.79 
 
 
498 aa  145  1e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1973  lysine/ornithine N-monooxygenase-like protein  29.55 
 
 
444 aa  144  4e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0295223 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2120  L-ornithine N5-oxygenase PvdA  29.31 
 
 
444 aa  144  4e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0401511 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5066  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  30.42 
 
 
442 aa  143  6e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1163  lysine/ornithine N-monooxygenase  29.62 
 
 
458 aa  142  8e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.126227  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1643  lysine/ornithine N-monooxygenase  29.62 
 
 
458 aa  142  8e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0478364  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2095  L-ornithine N5-oxygenase PvdA  29.83 
 
 
444 aa  142  8e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.59328  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3796  L-ornithine N5-oxygenase  29.08 
 
 
444 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.902122  normal  0.11479 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1618  lysine/ornithine N-monooxygenase  29.4 
 
 
458 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00185713 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4789  lysine/ornithine N-monooxygenase  30.14 
 
 
458 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00013329  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1561  lysine/ornithine N-monooxygenase  31.06 
 
 
458 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000104933  normal  0.191057 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1749  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  31.12 
 
 
444 aa  140  3e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0367243  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2090  l-ornithine 5-monooxygenase  30.39 
 
 
495 aa  140  3e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0869348  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2416  l-ornithine 5-monooxygenase  29.55 
 
 
504 aa  141  3e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0539899  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0527  l-ornithine 5-monooxygenase  29.48 
 
 
456 aa  141  3e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4074  L-ornithine 5-monooxygenase  29.88 
 
 
456 aa  140  3e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0146729  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2654  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  29.46 
 
 
445 aa  141  3e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000731675  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1540  lysine/ornithine N-monooxygenase  30.61 
 
 
458 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.310035  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1929  putative L-ornithine 5-monooxygenase MbaA  30.39 
 
 
468 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.421821  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02550  lysine/ornithine N-monooxygenase  29.21 
 
 
455 aa  140  3.9999999999999997e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0324873  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25600  L-ornithine N5-oxygenase-PvdA-like protein  27.71 
 
 
453 aa  140  3.9999999999999997e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1623  l-ornithine 5-monooxygenase  30.39 
 
 
468 aa  138  2e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.246388  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0286  l-ornithine 5-monooxygenase  30.39 
 
 
517 aa  138  2e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0287172  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0875  l-ornithine 5-monooxygenase  30.39 
 
 
468 aa  138  2e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.635923  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>