131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_2607 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007777  Francci3_2607  twin arginine-targeting protein translocase  100 
 
 
107 aa  207  5e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.0000181166  normal  0.0738114 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4869  twin arginine-targeting protein translocase  98 
 
 
98 aa  102  2e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.167987  normal  0.115935 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2251  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  74 
 
 
114 aa  80.1  0.000000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.624721  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1204  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  61.02 
 
 
142 aa  74.3  0.0000000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.397153  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3667  twin arginine-targeting protein translocase  69.39 
 
 
74 aa  73.6  0.0000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.72518 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2319  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  64.71 
 
 
103 aa  69.7  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000189125  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12129  twin arginine translocase protein A  55.36 
 
 
115 aa  65.5  0.0000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.119011  normal  0.626487 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3980  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  50 
 
 
103 aa  63.5  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.368125  normal  0.0318419 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3442  twin arginine translocase protein A  50.85 
 
 
82 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.385779  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3093  twin arginine translocase protein A  53.57 
 
 
84 aa  62  0.000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.370382  normal  0.391884 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5859  sec-independent translocation protein MttA/Hcf106  74.47 
 
 
107 aa  60.8  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.86878  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2689  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  58 
 
 
108 aa  58.9  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4378  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  60 
 
 
69 aa  57.8  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.600878  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1503  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  60.47 
 
 
121 aa  57.4  0.00000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.432776  hitchhiker  0.000608688 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0195  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  56.82 
 
 
86 aa  57.4  0.00000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1515  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  52.78 
 
 
95 aa  57  0.00000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00781786  normal  0.224045 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2305  twin arginine translocase protein A  70 
 
 
94 aa  57  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0188826  normal  0.0162961 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3893  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  41.43 
 
 
98 aa  56.2  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000775372  normal  0.0335955 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2474  twin arginine translocase protein A  47.76 
 
 
79 aa  55.5  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2519  twin arginine translocase protein A  47.76 
 
 
79 aa  55.5  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2511  twin arginine translocase protein A  47.76 
 
 
79 aa  55.5  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.256791  normal  0.624979 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2252  twin arginine translocase protein A  75 
 
 
100 aa  54.7  0.0000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0118258  normal  0.775201 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2370  twin arginine translocase protein A  75 
 
 
100 aa  55.1  0.0000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.730984  hitchhiker  0.00440018 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2468  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  69.7 
 
 
89 aa  53.9  0.0000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.134961  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2652  twin arginine-targeting protein translocase  50 
 
 
99 aa  53.5  0.0000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.572667  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1795  twin-arginine translocation protein TatA/E  35.82 
 
 
81 aa  53.5  0.000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6972  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  50.91 
 
 
82 aa  53.1  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3837  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  51.11 
 
 
140 aa  52  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.669997 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1443  Sec-independent protein secretion pathway components-like protein  31.58 
 
 
110 aa  52  0.000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.115776  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1023  twin arginine-targeting protein translocase  43.86 
 
 
59 aa  52  0.000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4453  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  43.66 
 
 
87 aa  52  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.230373  normal  0.0943376 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21960  twin arginine-targeting protein translocase, TatA/E family  51.22 
 
 
107 aa  50.8  0.000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.148281  normal  0.304965 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1882  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  67.74 
 
 
98 aa  50.4  0.000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.217317  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1290  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  64.71 
 
 
94 aa  50.4  0.000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2352  twin arginine translocase protein A  41.82 
 
 
56 aa  49.7  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3682  twin arginine-targeting protein translocase  40.74 
 
 
60 aa  48.9  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000036766  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1926  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  42.11 
 
 
90 aa  48.9  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000393248 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1987  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  46.67 
 
 
71 aa  48.5  0.00003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.283995  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1118  twin arginine-targeting protein translocase  40.91 
 
 
84 aa  47.8  0.00005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18530  twin arginine-targeting protein translocase, TatA/E family  44 
 
 
95 aa  47.8  0.00005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0332142  decreased coverage  0.00893017 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0191  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  47.06 
 
 
62 aa  47.8  0.00006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0104423  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2333  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  37.5 
 
 
87 aa  47  0.00008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.192204  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1823  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  50.98 
 
 
105 aa  47  0.00009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1769  twin-arginine translocation protein TatA/E  64.52 
 
 
101 aa  46.6  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.506415  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0200  twin arginine translocase protein A  42.86 
 
 
88 aa  46.6  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000520781  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2334  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  40.68 
 
 
94 aa  46.6  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.396798  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0040  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  33.33 
 
 
74 aa  46.2  0.0001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.620384  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1933  twin arginine translocase protein A  42.86 
 
 
55 aa  46.2  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00450459  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0069  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  53.85 
 
 
60 aa  46.2  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0240  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  59.46 
 
 
99 aa  46.2  0.0002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.443858  normal  0.816195 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4461  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  40 
 
 
66 aa  45.8  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.408951 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0060  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  43.75 
 
 
146 aa  45.4  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.554164  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2724  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  38.89 
 
 
90 aa  45.1  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1849  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  36.73 
 
 
69 aa  45.1  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.194429 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0076  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  39.58 
 
 
189 aa  45.1  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.85392 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0065  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  43.75 
 
 
139 aa  45.4  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0077  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  43.75 
 
 
139 aa  45.4  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2548  sec-independent protein translocase, protein  54.05 
 
 
130 aa  44.7  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0910954  normal  0.655548 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1660  twin arginine-targeting protein translocase  50 
 
 
136 aa  44.7  0.0004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.680457 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2169  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  50.77 
 
 
83 aa  44.7  0.0004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.309144  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0395  twin arginine-targeting protein translocase  33.96 
 
 
71 aa  44.7  0.0005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0782971  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0405  twin arginine-targeting protein translocase  33.96 
 
 
71 aa  44.7  0.0005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.019238  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0292  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  43.4 
 
 
89 aa  44.3  0.0005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.328055  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0887  sec-independent translocase  41.3 
 
 
194 aa  44.3  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0281514  normal  0.284391 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2272  twin arginine translocase protein A  44.68 
 
 
61 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000018794  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2088  twin arginine translocase protein A  44.68 
 
 
61 aa  44.3  0.0006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000777407  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2028  twin arginine translocase protein A  44.68 
 
 
61 aa  44.3  0.0006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000175615  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2026  twin arginine translocase protein A  44.68 
 
 
61 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000580487  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2242  twin arginine translocase protein A  44.68 
 
 
61 aa  44.3  0.0006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000411362  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0503  twin arginine-targeting protein translocase  32.91 
 
 
79 aa  44.3  0.0006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2354  twin arginine translocase protein A  44.68 
 
 
61 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000108072  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2225  twin arginine translocase protein A  44.68 
 
 
61 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000148535  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3099  twin arginine translocase protein A  44.68 
 
 
61 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000000374823  hitchhiker  2.75028e-16 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2269  twin arginine translocase protein A  44.68 
 
 
61 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.75681e-36 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1104  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  62.5 
 
 
50 aa  43.9  0.0007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2323  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  37.74 
 
 
63 aa  43.9  0.0007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.405896  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1095  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  39.13 
 
 
207 aa  43.9  0.0008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3515  twin arginine translocase protein A  33.8 
 
 
104 aa  43.9  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0856606  normal  0.226749 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4849  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  44.9 
 
 
56 aa  43.5  0.0009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00272525  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1964  twin arginine-targeting protein translocase  29.76 
 
 
92 aa  43.1  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.485465 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3898  twin arginine-targeting protein translocase  31.65 
 
 
79 aa  43.5  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0416  twin arginine-targeting protein translocase  31.65 
 
 
79 aa  43.5  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0428  twin arginine-targeting protein translocase  31.65 
 
 
79 aa  43.5  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000041421 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2705  twin arginine translocase protein A  36.84 
 
 
81 aa  43.1  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0941  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  42.22 
 
 
55 aa  42.7  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0442  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  31.65 
 
 
79 aa  43.5  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.34986 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0226  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  54.29 
 
 
51 aa  43.5  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000363266  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2549  Sec-independent protein translocase TatA  54.05 
 
 
101 aa  42  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.130237  normal  0.642517 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1469  twin-arginine translocation protein TatB  45 
 
 
126 aa  42.4  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0327243  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1396  twin arginine-targeting protein translocase  44.9 
 
 
104 aa  42.7  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.419367  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1749  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  44 
 
 
58 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3795  twin arginine-targeting protein translocase  31.4 
 
 
89 aa  42.4  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.743518  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2067  twin arginine translocase protein A  42.55 
 
 
59 aa  42.7  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000287314  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1284  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  29.59 
 
 
106 aa  42.4  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1725  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  44 
 
 
58 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3836  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  35 
 
 
67 aa  42.7  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.647162 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1267  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  43.84 
 
 
80 aa  42.7  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1005  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  50 
 
 
77 aa  42  0.003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1252  twin argininte translocase protein A  35.42 
 
 
63 aa  42  0.003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0990  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  40.43 
 
 
140 aa  42  0.003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0122855  hitchhiker  0.000780107 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>