147 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_1462 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009718  Fnod_1462  ATPase  100 
 
 
352 aa  715    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1301  ATPase  63.91 
 
 
328 aa  442  1e-123  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.777797  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1850  ATPase  58.92 
 
 
351 aa  438  9.999999999999999e-123  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1812  ATPase  58.64 
 
 
351 aa  435  1e-121  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1448  ATPase  49.3 
 
 
360 aa  361  9e-99  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.440303  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0934  ATPase  37.91 
 
 
302 aa  195  1e-48  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0637  hypothetical protein  27.72 
 
 
371 aa  112  1.0000000000000001e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.261889  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0623  hypothetical protein  27.37 
 
 
371 aa  110  4.0000000000000004e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00147327  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0483  ATPase  29.29 
 
 
327 aa  107  4e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3359  hypothetical protein  25.59 
 
 
353 aa  105  1e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2040  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  30.74 
 
 
364 aa  103  6e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0628555  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0805  hypothetical protein  27.2 
 
 
355 aa  102  9e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1600  MoxR-like ATPase  30 
 
 
332 aa  100  3e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2921  hypothetical protein  26.38 
 
 
353 aa  100  4e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.772953 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2964  hypothetical protein  29.87 
 
 
348 aa  99.8  6e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.171946  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1546  hypothetical protein  27.44 
 
 
379 aa  99.8  6e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.776475 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0522  AAA family ATPase  29.22 
 
 
332 aa  99.4  8e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.010453  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0748  hypothetical protein  32.6 
 
 
347 aa  99.4  9e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0051  hypothetical protein  28.23 
 
 
353 aa  99  1e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.645365  normal  0.49777 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2042  AAA ATPase  23.73 
 
 
396 aa  97.4  3e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0306993  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1928  MoxR-like protein ATPase-like protein  26.02 
 
 
353 aa  97.4  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1120  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  26.94 
 
 
354 aa  97.4  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0152  P-loop ATPase  28.63 
 
 
379 aa  95.5  1e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1363  hypothetical protein  27.42 
 
 
353 aa  95.5  1e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1490  AAA_3 ATPase  28.4 
 
 
364 aa  94.7  2e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1784  ATPase  28.63 
 
 
372 aa  95.1  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3122  hypothetical protein  28.79 
 
 
387 aa  94.4  2e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0872  ATPase  30.54 
 
 
340 aa  94  3e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.571105  normal  0.718721 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0475  ATPase  27.59 
 
 
383 aa  94  3e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2286  hypothetical protein  31.96 
 
 
348 aa  91.7  2e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6512  ATPase  31.33 
 
 
342 aa  89.7  7e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1782  ATPase  30 
 
 
331 aa  88.2  2e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.860256  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5422  ATPase  27.2 
 
 
368 aa  86.7  5e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1340  ATPase  27.68 
 
 
372 aa  87  5e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.287921  normal 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5625  ATPase  26.24 
 
 
368 aa  85.9  9e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.486488  normal  0.318658 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5803  ATPase  26.24 
 
 
368 aa  85.9  9e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000039959 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2569  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  27.85 
 
 
327 aa  85.5  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1251  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  28.7 
 
 
347 aa  84.7  0.000000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2825  MoxR-like protein ATPase-like protein  34.3 
 
 
367 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1973  hypothetical protein  27.78 
 
 
372 aa  84.7  0.000000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0367199  normal  0.929244 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1729  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  29.46 
 
 
330 aa  84  0.000000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.0000142331  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1800  hypothetical protein  25.48 
 
 
381 aa  82  0.00000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1621  AAA ATPase  30.6 
 
 
354 aa  79.7  0.00000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.171391  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5262  AAA ATPase  30.6 
 
 
354 aa  79.7  0.00000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.786609  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5603  ATPase  29.68 
 
 
341 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5996  hypothetical protein  27.03 
 
 
369 aa  73.2  0.000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3480  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  23.75 
 
 
367 aa  71.6  0.00000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0256  hypothetical protein  26.91 
 
 
368 aa  71.2  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.143072  normal  0.216525 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1403  hypothetical protein  27.35 
 
 
369 aa  71.2  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1319  hypothetical protein  26.01 
 
 
369 aa  70.1  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4134  ATPase  22.74 
 
 
379 aa  68.6  0.0000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2868  ATPase  26.83 
 
 
414 aa  67.8  0.0000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.249465  normal  0.109975 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1218  hypothetical protein  25.56 
 
 
369 aa  66.2  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.780645 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1910  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  24.91 
 
 
360 aa  66.2  0.0000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2936  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  28.37 
 
 
361 aa  63.2  0.000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.26531  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16090  ATPase family protein associated with various cellular activities (AAA)  25.69 
 
 
489 aa  61.6  0.00000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.454576  hitchhiker  0.000000267923 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0249  hypothetical protein  24.49 
 
 
367 aa  61.2  0.00000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.211939  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2697  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  25.61 
 
 
347 aa  59.7  0.00000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1222  AAA ATPase  23.32 
 
 
505 aa  58.9  0.0000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00799  ATPase  27.13 
 
 
334 aa  55.1  0.000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000387294  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3321  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  21.87 
 
 
418 aa  53.9  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.395905  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1259  AAA ATPase  22.97 
 
 
412 aa  53.9  0.000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2287  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  30.97 
 
 
303 aa  52.4  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.243939  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2669  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  22.52 
 
 
372 aa  52.4  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000749839  normal  0.0501266 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4561  hypothetical protein  30.97 
 
 
303 aa  52.4  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2275  ATPase  30.97 
 
 
303 aa  52.4  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2051  ATPase  30.97 
 
 
303 aa  52.4  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.285449  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2098  ATPase  30.97 
 
 
303 aa  52.4  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1808  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  28.08 
 
 
398 aa  52  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.0067351  normal  0.07307 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2370  MoxR-like ATPase  30.36 
 
 
305 aa  50.8  0.00004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.470488  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2494  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  20.97 
 
 
521 aa  50.1  0.00005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1425  AAA ATPase  24.15 
 
 
362 aa  50.4  0.00005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.113795 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8670  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  23.42 
 
 
414 aa  50.1  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0965091  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2126  ATPase  28.32 
 
 
303 aa  49.7  0.00007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2107  ATPase  28.32 
 
 
303 aa  49.7  0.00007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2348  ATPase  28.32 
 
 
315 aa  49.3  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1523  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  30.91 
 
 
305 aa  49.3  0.0001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0039  ATPase  30.2 
 
 
333 aa  49.3  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.320822 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2824  AAA family ATPase  27.27 
 
 
310 aa  48.1  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0314282  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2942  MoxR-like ATPase  29.1 
 
 
309 aa  48.1  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000701608  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3038  AAA family ATPase  27.27 
 
 
310 aa  48.1  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.392336  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0313  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpA  34.34 
 
 
740 aa  48.5  0.0002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1967  ATPase  27.93 
 
 
303 aa  48.1  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.379731  normal  0.918061 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1696  MoxR family protein  28.85 
 
 
313 aa  47.8  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2153  MoxR protein  27.43 
 
 
303 aa  47.4  0.0003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2773  magnesium chelatase; methanol dehydrogenase regulator  28.36 
 
 
310 aa  47.8  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0680478  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1856  ATPase  27.43 
 
 
303 aa  47.8  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.195599  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2242  ATPase  27.43 
 
 
313 aa  47.8  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.839891  normal  0.451068 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2426  ATPase  30.43 
 
 
314 aa  47.8  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.624284  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1897  MoxR protein  27.43 
 
 
309 aa  47.8  0.0003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.585542  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2623  ATPase  28.32 
 
 
303 aa  47.8  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.3673  normal  0.0965943 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0175  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  29.8 
 
 
382 aa  47.4  0.0004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3068  ATPase, AAA family  26.87 
 
 
310 aa  47.4  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0718148  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0879  ATPase  29.37 
 
 
334 aa  47.4  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.714074 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2759  magnesium chelatase; methanol dehydrogenase regulator  28.36 
 
 
309 aa  47  0.0005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5567  ATPase  26.81 
 
 
305 aa  47  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0627555  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1778  ATPase  26.55 
 
 
303 aa  47  0.0005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3073  AAA family ATPase  28.36 
 
 
310 aa  46.6  0.0006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.209671  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2903  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit clpA  34.65 
 
 
778 aa  46.6  0.0007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.11213  normal  0.265378 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0941  ATPase  30.23 
 
 
308 aa  46.6  0.0007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>