More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0801 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009718  Fnod_0801  Holliday junction DNA helicase RuvA  100 
 
 
188 aa  362  1e-99  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0911  Holliday junction DNA helicase RuvA  44.85 
 
 
189 aa  148  4e-35  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0783  Holliday junction DNA helicase RuvA  48.21 
 
 
188 aa  147  6e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0760  Holliday junction DNA helicase RuvA  48.21 
 
 
188 aa  147  7e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07040  Holliday junction DNA helicase, RuvA subunit  37.81 
 
 
197 aa  123  2e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00385536  normal  0.295964 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0837  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.75 
 
 
209 aa  114  1.0000000000000001e-24  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12850  Holliday junction DNA helicase, RuvA subunit  35.35 
 
 
194 aa  112  2.0000000000000002e-24  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2516  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.78 
 
 
197 aa  110  2.0000000000000002e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1661  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.67 
 
 
199 aa  109  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.133352  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4725  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.56 
 
 
202 aa  109  3e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.453465 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1915  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.17 
 
 
201 aa  108  3e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0420  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.5 
 
 
200 aa  108  6e-23  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01832  Holliday junction DNA helicase motor protein  32.51 
 
 
203 aa  107  9.000000000000001e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.263475  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01820  hypothetical protein  32.51 
 
 
203 aa  107  9.000000000000001e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.22815  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1754  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.99 
 
 
200 aa  107  1e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000623811  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0181  Holliday junction DNA helicase RuvA  37.69 
 
 
202 aa  106  2e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.595877  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1771  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.51 
 
 
203 aa  105  3e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0290161  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2204  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.68 
 
 
201 aa  105  3e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1954  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.51 
 
 
203 aa  105  3e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.165373  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1248  Holliday junction DNA helicase RuvA  30.69 
 
 
200 aa  105  4e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02691  Holliday junction DNA helicase motor protein  33.01 
 
 
206 aa  105  5e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000921844  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0484  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.16 
 
 
193 aa  104  6e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1323  Holliday junction DNA helicase subunit RuvA  35.29 
 
 
196 aa  104  7e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0418911  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1720  Holliday junction DNA helicase RuvA  39.87 
 
 
179 aa  104  9e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.336599  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1779  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.02 
 
 
203 aa  103  1e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00140889  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1325  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.02 
 
 
203 aa  103  1e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.24557  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2305  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.76 
 
 
196 aa  103  1e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.765847 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2597  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.02 
 
 
203 aa  103  1e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.110942  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2266  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.76 
 
 
196 aa  103  1e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0957  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.02 
 
 
203 aa  103  1e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00202612  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2091  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.02 
 
 
203 aa  103  1e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000143296  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3999  Holliday junction DNA helicase RuvA  29.7 
 
 
205 aa  103  1e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2313  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.76 
 
 
196 aa  103  1e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15070  Holliday junction DNA helicase subunit RuvA  32.97 
 
 
199 aa  103  2e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.180586  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2213  DNA recombination protein, RuvA  31.96 
 
 
191 aa  103  2e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0140161 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0891  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.79 
 
 
195 aa  103  2e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0818688 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4202  Holliday junction DNA helicase RuvA  29.21 
 
 
205 aa  102  2e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.173502  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0028  Holliday junction DNA helicase  32.83 
 
 
199 aa  103  2e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.591728 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1453  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.42 
 
 
187 aa  103  2e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.112528  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2134  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.83 
 
 
195 aa  103  2e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.856024  hitchhiker  0.000118824 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3236  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.65 
 
 
192 aa  103  2e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1216  Holliday junction DNA helicase RuvA  29.21 
 
 
205 aa  102  3e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.210399  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1879  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.67 
 
 
193 aa  102  3e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000619466  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0893  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.49 
 
 
200 aa  102  3e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000557116  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1652  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.08 
 
 
193 aa  102  3e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0616  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.63 
 
 
193 aa  102  3e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.451043 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1245  Holliday junction DNA helicase RuvA  29.21 
 
 
205 aa  102  3e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.738267  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4665  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.57 
 
 
190 aa  102  3e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1226  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.47 
 
 
190 aa  102  4e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17520  Holliday junction DNA helicase subunit RuvA  31.35 
 
 
206 aa  102  4e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.176122 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3345  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.12 
 
 
193 aa  102  4e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00238137 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0745  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.33 
 
 
199 aa  102  5e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000883401  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1746  Holliday junction DNA helicase RuvA  30.69 
 
 
204 aa  101  5e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.357273  normal  0.827108 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2430  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.03 
 
 
203 aa  101  6e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0285195  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1112  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.24 
 
 
197 aa  101  7e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.810212  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0310  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.54 
 
 
194 aa  100  9e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.966825  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1583  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.16 
 
 
193 aa  100  9e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.281985  normal  0.49857 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3626  Holliday junction DNA helicase RuvA  30.43 
 
 
198 aa  100  9e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0674583  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2144  Holliday junction DNA helicase RuvA  30.1 
 
 
204 aa  100  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0379489  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0452  Holliday junction resolvasome DNA-binding subunit  29.9 
 
 
208 aa  100  1e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0798924  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2031  Holliday junction DNA helicase RuvA  30.1 
 
 
204 aa  100  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000338953  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003923  holliday junction DNA helicase RuvA  30.54 
 
 
203 aa  100  1e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00197305  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2421  Holliday junction DNA helicase RuvA  30.1 
 
 
204 aa  100  1e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0480934  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1691  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.67 
 
 
198 aa  100  1e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2363  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.3 
 
 
205 aa  100  1e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00132923  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0994  Holliday junction DNA helicase RuvA  30.96 
 
 
197 aa  100  1e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.199668  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0442  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.56 
 
 
194 aa  99.8  2e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1076  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.84 
 
 
199 aa  99.8  2e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.131842  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_384  Holliday junction DNA helicase  33.71 
 
 
194 aa  100  2e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0269  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.37 
 
 
204 aa  100  2e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2430  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.37 
 
 
205 aa  99  3e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1938  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.2 
 
 
205 aa  99  3e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00077844  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1409  Holliday junction DNA helicase RuvA  30.69 
 
 
202 aa  99  3e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.103613  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2041  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.71 
 
 
205 aa  99  3e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000000869116  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2043  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.71 
 
 
205 aa  99  3e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000236908  hitchhiker  0.0000000623922 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2353  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.49 
 
 
194 aa  99.4  3e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.547794 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4542  Holliday junction DNA helicase RuvA  29.35 
 
 
201 aa  99.4  3e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51790  Holliday junction DNA helicase RuvA  29.35 
 
 
201 aa  99.4  3e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000465402 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2304  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.71 
 
 
205 aa  99  3e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00141893  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2420  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.71 
 
 
205 aa  99  3e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000176513  normal  0.0290514 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3978  Holliday junction DNA helicase RuvA  30.69 
 
 
202 aa  99  4e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0282687  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4408  Holliday junction DNA helicase RuvA  27.87 
 
 
202 aa  99  4e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0615399  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2077  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.71 
 
 
205 aa  98.6  4e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000433363  hitchhiker  0.00159664 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1956  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.71 
 
 
205 aa  98.6  4e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00381182  normal  0.897117 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0390  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.64 
 
 
200 aa  99  4e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.303654  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01215  Holliday junction DNA helicase motor protein  35.57 
 
 
193 aa  98.6  5e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2477  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.33 
 
 
194 aa  98.6  5e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.389677  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2109  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.03 
 
 
203 aa  98.6  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.434147  normal  0.12473 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2049  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.03 
 
 
203 aa  98.6  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.774525  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2054  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.03 
 
 
203 aa  98.6  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.292031  normal  0.142265 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0573  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.51 
 
 
184 aa  98.6  5e-20  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.838758  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2212  Holliday junction DNA helicase RuvA  29.9 
 
 
204 aa  98.6  5e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0313  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.14 
 
 
196 aa  98.6  5e-20  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.178792  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1229  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.03 
 
 
203 aa  98.6  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0100145  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1353  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.03 
 
 
203 aa  98.6  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.760741  hitchhiker  0.00521266 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1416  Holliday junction DNA helicase RuvA  29.74 
 
 
220 aa  98.2  6e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.685038 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2189  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.83 
 
 
200 aa  98.2  7e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000251944  normal  0.355786 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3400  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.14 
 
 
193 aa  98.2  7e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2533  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.14 
 
 
193 aa  98.2  7e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3406  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.14 
 
 
193 aa  98.2  7e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>