More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0220 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_0718  GMP synthase  70.76 
 
 		 513 aa  748    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0220  GMP synthase  100 
 
 		 522 aa  1066    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0677  GMP synthase, large subunit  58.93 
 
 		 522 aa  605  9.999999999999999e-173  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.476602  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3123  GMP synthase  56.42 
 
 		 516 aa  593  1e-168  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0836  GMP synthase  56.2 
 
 		 533 aa  588  1e-167  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.008715  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0755  GMP synthase  56.67 
 
 		 560 aa  590  1e-167  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.326962  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_740  GMP synthase (glutamine-hydrolysing)  56.09 
 
 		 560 aa  586  1e-166  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1628  GMP synthase  57.23 
 
 		 511 aa  587  1e-166  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.948363  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0445  GMP synthase  55.85 
 
 		 524 aa  583  1.0000000000000001e-165  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.323324  normal  0.382919 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4308  GMP synthase  54.74 
 
 		 520 aa  583  1.0000000000000001e-165  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.25397  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1739  GMP synthase  54.74 
 
 		 512 aa  583  1.0000000000000001e-165  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.929225 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2132  GMP synthase  54.35 
 
 		 512 aa  579  1e-164  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1667  GMP synthase  55.13 
 
 		 513 aa  578  1e-164  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0959  GMP synthase, large subunit  57.28 
 
 		 531 aa  580  1e-164  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4571  GMP synthase  54.35 
 
 		 520 aa  577  1.0000000000000001e-163  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.855441  normal  0.321233 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3517  GMP synthase  54.16 
 
 		 520 aa  572  1.0000000000000001e-162  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0782  GMP synthase  53.89 
 
 		 516 aa  572  1.0000000000000001e-162  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004340  GMP synthase (glutamine-hydrolyzing)  53.56 
 
 		 517 aa  574  1.0000000000000001e-162  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0738  GMP synthase  53.47 
 
 		 517 aa  569  1e-161  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1946  GMP synthase  55.09 
 
 		 513 aa  571  1e-161  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0589  GMP synthase  55.38 
 
 		 511 aa  568  1e-161  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0765  GMP synthase  53.89 
 
 		 516 aa  570  1e-161  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0327  GMP synthase  53.58 
 
 		 520 aa  570  1e-161  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2105  GMP synthase  54.05 
 
 		 516 aa  570  1e-161  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0748059  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2348  GMP synthase  54.91 
 
 		 518 aa  569  1e-161  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.598137  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3478  GMP synthase  55.04 
 
 		 514 aa  569  1e-161  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01077  GMP synthase  53.37 
 
 		 517 aa  571  1e-161  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1616  GMP synthase  54.91 
 
 		 518 aa  568  1e-161  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2123  GMP synthase  54.84 
 
 		 518 aa  571  1e-161  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.69459  hitchhiker  0.00100541 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0645  GMP synthase, large subunit  56.16 
 
 		 507 aa  567  1e-160  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000665212  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2315  GMP synthase, large subunit  53.89 
 
 		 514 aa  566  1e-160  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1525  GMP synthase  53.5 
 
 		 518 aa  567  1e-160  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1901  GMP synthase  53.31 
 
 		 517 aa  568  1e-160  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.783209  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1171  GMP synthase  53.35 
 
 		 526 aa  567  1e-160  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0966  GMP synthase  52.73 
 
 		 509 aa  566  1e-160  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.527198  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1521  GMP synthase  54.72 
 
 		 518 aa  568  1e-160  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0467837  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0344  GMP synthase  54.25 
 
 		 518 aa  563  1.0000000000000001e-159  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2880  GMP synthase  51.7 
 
 		 542 aa  563  1.0000000000000001e-159  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0899  GMP synthase  54.72 
 
 		 520 aa  562  1.0000000000000001e-159  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0189  GMP synthase  51.82 
 
 		 575 aa  563  1.0000000000000001e-159  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0241  GMP synthase  54.51 
 
 		 513 aa  562  1.0000000000000001e-159  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.212928  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1635  GMP synthase  53.7 
 
 		 513 aa  562  1.0000000000000001e-159  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1016  GMP synthase  52.69 
 
 		 525 aa  563  1.0000000000000001e-159  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.612801  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1264  GMP synthase  52.91 
 
 		 510 aa  563  1.0000000000000001e-159  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3058  GMP synthase  52.56 
 
 		 523 aa  563  1.0000000000000001e-159  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2644  GMP synthase  55.09 
 
 		 513 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0315  GMP synthase  53.26 
 
 		 518 aa  558  1e-158  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.185414 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0361  GMP synthase  53 
 
 		 520 aa  559  1e-158  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.190367  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2658  GMP synthase  51.33 
 
 		 525 aa  559  1e-158  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000100783  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0595  GMP synthase, large subunit  53.2 
 
 		 511 aa  558  1e-158  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1170  GMP synthase  51.33 
 
 		 525 aa  559  1e-158  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00961955  normal  0.0544013 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2656  GMP synthase  51.33 
 
 		 525 aa  559  1e-158  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0518373  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2659  GMP synthase  51.52 
 
 		 525 aa  559  1e-158  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00262883  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2766  GMP synthase  51.52 
 
 		 525 aa  559  1e-158  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2744  GMP synthase  51.71 
 
 		 525 aa  558  1e-158  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.903073  normal  0.254018 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0328  GMP synthase  53 
 
 		 520 aa  559  1e-158  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1184  GMP synthase  53.45 
 
 		 519 aa  560  1e-158  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.550912  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2875  GMP synthase  51.52 
 
 		 525 aa  559  1e-158  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0300  GMP synthase  55.09 
 
 		 513 aa  559  1e-158  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.176102  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3731  GMP synthase  51.33 
 
 		 525 aa  559  1e-158  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00256427  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0163  GMP synthase, large subunit  53.68 
 
 		 525 aa  559  1e-158  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2703  GMP synthase  51.71 
 
 		 525 aa  560  1e-158  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.668496  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02399  bifunctional GMP synthase/glutamine amidotransferase protein  51.33 
 
 		 525 aa  558  1e-157  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.119389  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1161  GMP synthase, large subunit  51.33 
 
 		 525 aa  558  1e-157  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0469795  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1385  GMP synthase  52.91 
 
 		 511 aa  556  1e-157  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2216  GMP synthase  53.51 
 
 		 528 aa  557  1e-157  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.285654 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2791  GMP synthase  51.14 
 
 		 525 aa  557  1e-157  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000385155  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1432  GMP synthase  54.55 
 
 		 511 aa  556  1e-157  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0118817  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0694  GMP synthase  52.2 
 
 		 542 aa  556  1e-157  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2882  GMP synthase  51.33 
 
 		 525 aa  557  1e-157  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0113861  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0495  GMP synthase  53 
 
 		 519 aa  556  1e-157  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0294  GMP synthase  52.39 
 
 		 537 aa  555  1e-157  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.223502  normal  0.0574353 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0342  GMP synthase  53.55 
 
 		 514 aa  558  1e-157  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0421  GMP synthase  51.43 
 
 		 523 aa  557  1e-157  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0907  GMP synthase  51.92 
 
 		 575 aa  556  1e-157  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0722  GMP synthase  52.2 
 
 		 542 aa  556  1e-157  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0373308  normal  0.160767 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02361  hypothetical protein  51.33 
 
 		 525 aa  558  1e-157  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.1002  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0501  GMP synthase  52.52 
 
 		 511 aa  556  1e-157  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2998  GMP synthase  50.95 
 
 		 525 aa  555  1e-157  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0177003  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1560  GMP synthase  51.99 
 
 		 525 aa  554  1e-156  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0290  GMP synthase  52.68 
 
 		 524 aa  553  1e-156  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4241  GMP synthase  51.92 
 
 		 525 aa  551  1e-156  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2645  GMP synthase  52.02 
 
 		 525 aa  555  1e-156  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1314  GMP synthase  52.37 
 
 		 525 aa  555  1e-156  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.867472  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0515  GMP synthase  52.71 
 
 		 512 aa  553  1e-156  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000605671  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1751  GMP synthase  52.87 
 
 		 520 aa  554  1e-156  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.485294  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2143  GMP synthase  52.8 
 
 		 535 aa  554  1e-156  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.188131  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1054  GMP synthase  51.13 
 
 		 540 aa  553  1e-156  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0138128  hitchhiker  0.000561419 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1681  GMP synthase  51.54 
 
 		 529 aa  553  1e-156  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.100042  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3211  GMP synthase  53.86 
 
 		 541 aa  553  1e-156  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.689429  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2728  GMP synthase, large subunit  50.57 
 
 		 525 aa  553  1e-156  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.211488  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1128  GMP synthase, large subunit  50.57 
 
 		 525 aa  554  1e-156  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.340292  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1270  GMP synthase  51.42 
 
 		 525 aa  553  1e-156  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0196123  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2542  GMP synthase  52.51 
 
 		 540 aa  554  1e-156  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0477  GMP synthase  52.71 
 
 		 511 aa  552  1e-156  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0297  GMP synthase  51.64 
 
 		 517 aa  554  1e-156  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1793  GMP synthase  52.14 
 
 		 515 aa  551  1e-156  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1294  GMP synthase  53.36 
 
 		 518 aa  553  1e-156  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.141337  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1264  GMP synthase  52.71 
 
 		 511 aa  553  1e-156  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02972  GMP synthase  52.47 
 
 		 525 aa  554  1e-156  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>