More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0197 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_0784  CTP synthetase  74.04 
 
 		 525 aa  816    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0123  CTP synthetase  71.54 
 
 		 524 aa  798    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000806714  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0125  CTP synthetase  71.54 
 
 		 524 aa  798    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000107739  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0197  CTP synthetase  100 
 
 		 525 aa  1061    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000237577  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1012  CTP synthetase  66.1 
 
 		 527 aa  717    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0111787  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0078  CTP synthetase  51.88 
 
 		 541 aa  529  1e-149  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0157  CTP synthetase  48.11 
 
 		 539 aa  512  1e-144  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.337203  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2304  CTP synthetase  50 
 
 		 533 aa  514  1e-144  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0258787  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1923  CTP synthetase  49.53 
 
 		 542 aa  509  1e-143  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0447943  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3337  CTP synthetase  47.19 
 
 		 531 aa  502  1e-141  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1563  CTP synthetase  49.81 
 
 		 534 aa  502  1e-141  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3446  CTP synthetase  46.82 
 
 		 531 aa  499  1e-140  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0291  CTP synthetase  48.89 
 
 		 534 aa  499  1e-140  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1250  CTP synthase  47.64 
 
 		 530 aa  501  1e-140  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1093  CTP synthetase  47.17 
 
 		 533 aa  498  1e-140  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2035  CTP synthase  47.01 
 
 		 533 aa  501  1e-140  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00063614  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1610  CTP synthetase  46.57 
 
 		 542 aa  495  1e-139  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.103111  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2409  CTP synthetase  47.48 
 
 		 537 aa  498  1e-139  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38810  CTP synthetase  46.93 
 
 		 543 aa  495  1e-139  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4064  CTP synthetase  46.75 
 
 		 542 aa  496  1e-139  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000300969 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4167  CTP synthetase  46.57 
 
 		 542 aa  495  1e-139  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.675672 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2418  CTP synthetase  46.99 
 
 		 542 aa  497  1e-139  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00522161  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5468  CTP synthetase  46.33 
 
 		 535 aa  493  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.516404  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6612  CTP synthetase  48.88 
 
 		 550 aa  492  9.999999999999999e-139  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.174922  hitchhiker  0.00487095 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5187  CTP synthetase  46.33 
 
 		 535 aa  491  9.999999999999999e-139  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.537125  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5038  CTP synthetase  46.52 
 
 		 535 aa  493  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0483501  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5431  CTP synthetase  46.52 
 
 		 535 aa  493  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.6711200000000003e-24 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1119  CTP synthetase  46.75 
 
 		 543 aa  492  9.999999999999999e-139  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1164  CTP synthetase  46.2 
 
 		 542 aa  494  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.309398  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0054  CTP synthetase  47.38 
 
 		 536 aa  492  9.999999999999999e-139  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000543339  hitchhiker  0.00121166 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2598  CTP synthetase  46.44 
 
 		 549 aa  492  9.999999999999999e-139  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0553655  normal  0.17839 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5516  CTP synthetase  46.52 
 
 		 535 aa  493  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00176439  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5583  CTP synthetase  46.33 
 
 		 535 aa  491  9.999999999999999e-139  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.426963  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2180  CTP synthetase  47.76 
 
 		 540 aa  494  9.999999999999999e-139  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5491  CTP synthetase  46.7 
 
 		 535 aa  494  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000497505  unclonable  2.37661e-25 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5136  CTP synthetase  46.52 
 
 		 535 aa  493  9.999999999999999e-139  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5461  CTP synthetase  46.7 
 
 		 535 aa  494  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000119534  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2712  CTP synthase  47.6 
 
 		 563 aa  495  9.999999999999999e-139  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18991  CTP synthetase  46.92 
 
 		 536 aa  493  9.999999999999999e-139  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.433411  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1716  CTP synthase  48.2 
 
 		 545 aa  492  9.999999999999999e-139  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18801  CTP synthetase  46.73 
 
 		 536 aa  489  1e-137  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21631  CTP synthetase  47.09 
 
 		 555 aa  488  1e-137  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.397558 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3035  CTP synthetase  46.37 
 
 		 543 aa  489  1e-137  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0036123 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5022  CTP synthetase  46.33 
 
 		 535 aa  491  1e-137  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18060  CTP synthetase  47.5 
 
 		 535 aa  491  1e-137  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1502  CTP synthetase  46.94 
 
 		 542 aa  491  1e-137  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3859  CTP synthetase  45.78 
 
 		 535 aa  490  1e-137  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2963  CTP synthetase  47.74 
 
 		 555 aa  489  1e-137  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000435948  hitchhiker  0.0000264859 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2472  CTP synthetase  46.6 
 
 		 535 aa  491  1e-137  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2182  CTP synthetase  46.6 
 
 		 535 aa  491  1e-137  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2383  CTP synthetase  46.6 
 
 		 537 aa  491  1e-137  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.508995  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17290  CTP synthetase  46.94 
 
 		 542 aa  491  1e-137  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1743  CTP synthetase  45.69 
 
 		 534 aa  488  1e-137  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1754  CTP synthetase  47.96 
 
 		 546 aa  489  1e-137  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3181  CTP synthetase  45.88 
 
 		 533 aa  490  1e-137  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000127982  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0919  CTP synthetase  47.68 
 
 		 542 aa  489  1e-137  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1183  CTP synthase  48.42 
 
 		 535 aa  485  1e-136  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0724747  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0071  CTP synthase  45.93 
 
 		 559 aa  486  1e-136  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1291  CTP synthetase  46.9 
 
 		 555 aa  486  1e-136  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2785  CTP synthetase  45.78 
 
 		 538 aa  487  1e-136  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.963897  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1262  CTP synthetase  46.31 
 
 		 543 aa  486  1e-136  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1782  CTP synthetase  46.73 
 
 		 536 aa  487  1e-136  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1393  CTP synthetase  48.3 
 
 		 550 aa  486  1e-136  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.438798  normal  0.174623 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0051  CTP synthetase  47.28 
 
 		 547 aa  488  1e-136  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3115  CTP synthetase  46.62 
 
 		 557 aa  486  1e-136  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.00000124409  hitchhiker  0.00148298 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08471  CTP synthetase  45.59 
 
 		 539 aa  487  1e-136  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.859496  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0040  CTP synthase  49.06 
 
 		 531 aa  483  1e-135  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0878  CTP synthetase  48.41 
 
 		 528 aa  484  1e-135  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2717  CTP synthase  48.22 
 
 		 568 aa  483  1e-135  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1361  CTP synthetase  46 
 
 		 543 aa  482  1e-135  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0802006  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2034  CTP synthetase  45.62 
 
 		 558 aa  484  1e-135  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1765  CTP synthetase  46.31 
 
 		 548 aa  483  1e-135  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.279833  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1243  CTP synthetase  46.79 
 
 		 543 aa  483  1e-135  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.381709  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0228  CTP synthetase  48.04 
 
 		 531 aa  483  1e-135  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0116565 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0170  CTP synthetase  45.37 
 
 		 535 aa  482  1e-135  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.357981 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1762  CTP synthetase  48.22 
 
 		 533 aa  482  1e-135  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.55526  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0320  CTP synthetase  47.5 
 
 		 555 aa  483  1e-135  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0760  CTP synthase  48.5 
 
 		 562 aa  482  1e-135  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0174  CTP synthetase  46.67 
 
 		 542 aa  483  1e-135  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.472124  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0052  CTP synthetase  48.21 
 
 		 554 aa  484  1e-135  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.431062 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1734  CTP synthetase  46.57 
 
 		 535 aa  478  1e-134  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0461926  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1872  CTP synthetase  47.12 
 
 		 555 aa  480  1e-134  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1552  CTP synthase  46 
 
 		 543 aa  481  1e-134  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.873983  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2366  CTP synthetase  45.4 
 
 		 546 aa  478  1e-134  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.863535  normal  0.823957 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03082  CTP synthetase  47.3 
 
 		 543 aa  479  1e-134  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000772842  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2653  CTP synthetase  46.17 
 
 		 554 aa  479  1e-134  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.476334  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5105  CTP synthetase  46.35 
 
 		 552 aa  480  1e-134  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.298058 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1911  CTP synthetase  45.84 
 
 		 542 aa  479  1e-134  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.884152  normal  0.767011 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18211  CTP synthetase  45.9 
 
 		 555 aa  480  1e-134  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3265  CTP synthetase  47.31 
 
 		 543 aa  480  1e-134  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.804111  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18801  CTP synthetase  46.17 
 
 		 536 aa  479  1e-134  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.061143  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1325  CTP synthetase  48.49 
 
 		 536 aa  478  1e-134  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00186219  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4844  CTP synthetase  46.05 
 
 		 532 aa  478  1e-134  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00361153  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29581  CTP synthetase  45.97 
 
 		 558 aa  480  1e-134  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0791  CTP synthase  48.5 
 
 		 534 aa  479  1e-134  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.720942  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1955  CTP synthetase  47.57 
 
 		 530 aa  476  1e-133  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3181  CTP synthetase  46.29 
 
 		 563 aa  475  1e-133  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0433  CTP synthetase  46.49 
 
 		 550 aa  477  1e-133  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0589327 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2586  CTP synthetase  46.47 
 
 		 538 aa  475  1e-133  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0528943 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2594  CTP synthetase  46.62 
 
 		 551 aa  476  1e-133  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.693911  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>