More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_4523 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_4523  sodium:dicarboxylate symporter  100 
 
 		 415 aa  820    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.281817  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3533  sodium:dicarboxylate symporter  63.1 
 
 		 423 aa  492  9.999999999999999e-139  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.982128  normal  0.330869 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3697  C4-dicarboxylate transporter DctA  56.59 
 
 		 420 aa  437  1e-121  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0331766  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3380  C4-dicarboxylate transporter DctA  56.59 
 
 		 420 aa  436  1e-121  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.290736  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3346  C4-dicarboxylate transporter DctA  56.83 
 
 		 438 aa  436  1e-121  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00211585  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3294  C4-dicarboxylate transporter DctA  56.83 
 
 		 420 aa  435  1e-121  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0209332  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3597  C4-dicarboxylate transporter DctA  56.83 
 
 		 420 aa  435  1e-121  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000021811 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1620  C4-dicarboxylate transporter DctA  56.59 
 
 		 420 aa  436  1e-121  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000559641  hitchhiker  0.000636022 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2244  C4-dicarboxylate transporter DctA  57.21 
 
 		 413 aa  437  1e-121  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0602805  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1855  sodium:dicarboxylate symporter  57.95 
 
 		 414 aa  429  1e-119  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3612  C4-dicarboxylate transporter DctA  56.83 
 
 		 420 aa  424  1e-117  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000454164  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3604  C4-dicarboxylate transporter DctA  56.83 
 
 		 420 aa  424  1e-117  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.389605  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1379  C4-dicarboxylate transporter DctA  55.56 
 
 		 420 aa  389  1e-107  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0185  sodium:dicarboxylate symporter  50.86 
 
 		 428 aa  385  1e-106  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3925  C4-dicarboxylate transporter DctA  51.59 
 
 		 428 aa  386  1e-106  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3934  C4-dicarboxylate transporter DctA  50.86 
 
 		 428 aa  385  1e-106  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1399  sodium:dicarboxylate symporter  53.4 
 
 		 418 aa  388  1e-106  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4016  C4-dicarboxylate transporter DctA  50.86 
 
 		 428 aa  385  1e-106  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3731  C4-dicarboxylate transporter DctA  50.86 
 
 		 428 aa  385  1e-106  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0189  C4-dicarboxylate transporter DctA  50.86 
 
 		 428 aa  385  1e-106  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3836  C4-dicarboxylate transporter DctA  50.86 
 
 		 428 aa  385  1e-106  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.275466 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03376  C4-dicarboxylate transport protein  50.61 
 
 		 428 aa  383  1e-105  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0381  sodium:dicarboxylate symporter  51.34 
 
 		 437 aa  382  1e-105  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000240059  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03329  hypothetical protein  50.61 
 
 		 428 aa  383  1e-105  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0080  C4-dicarboxylate transporter DctA  51.21 
 
 		 430 aa  385  1e-105  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4892  C4-dicarboxylate transporter DctA  50.61 
 
 		 428 aa  384  1e-105  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.321398  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0083  C4-dicarboxylate transporter DctA  50.97 
 
 		 430 aa  382  1e-105  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5339  C4-dicarboxylate transporter DctA  49.75 
 
 		 465 aa  380  1e-104  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0517  C4-dicarboxylate transporter DctA  53.44 
 
 		 421 aa  380  1e-104  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.946656  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3225  sodium:dicarboxylate symporter  50.86 
 
 		 439 aa  379  1e-104  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.891613  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1682  C4-dicarboxylate transport protein  49.02 
 
 		 460 aa  376  1e-103  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.662063  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4078  C4-dicarboxylate transporter DctA  49.64 
 
 		 428 aa  375  1e-103  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1039  sodium:dicarboxylate symporter  50.97 
 
 		 439 aa  377  1e-103  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.681651 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1777  sodium:dicarboxylate symporter  48.65 
 
 		 440 aa  373  1e-102  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4067  C4-dicarboxylate transporter DctA  50.24 
 
 		 429 aa  374  1e-102  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.409819 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1856  sodium:dicarboxylate symporter  48.65 
 
 		 440 aa  373  1e-102  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2100  Sodium/dicarboxylate symporter  48.65 
 
 		 440 aa  373  1e-102  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0228  C4-dicarboxylate transporter DctA  49.5 
 
 		 429 aa  372  1e-102  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4064  C4-dicarboxylate transporter DctA  50.24 
 
 		 429 aa  375  1e-102  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0098  C4-dicarboxylate transporter DctA  50.24 
 
 		 429 aa  374  1e-102  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3748  C4-dicarboxylate transporter DctA  49.76 
 
 		 448 aa  372  1e-102  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3890  C4-dicarboxylate transporter DctA  49.16 
 
 		 430 aa  370  1e-101  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0277  C4-dicarboxylate transporter DctA  50.99 
 
 		 431 aa  369  1e-101  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3886  C4-dicarboxylate transporter DctA  49.88 
 
 		 428 aa  370  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3930  C4-dicarboxylate transporter DctA  49.88 
 
 		 428 aa  370  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.080438  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3809  C4-dicarboxylate transporter DctA  49.88 
 
 		 428 aa  370  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.708508 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3822  C4-dicarboxylate transporter DctA  49.88 
 
 		 428 aa  370  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3990  C4-dicarboxylate transporter DctA  49.88 
 
 		 428 aa  370  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.142242 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3501  C4-dicarboxylate transporter DctA  50.49 
 
 		 451 aa  368  1e-101  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4772  sodium:dicarboxylate symporter  46.14 
 
 		 449 aa  365  1e-100  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.234615  normal  0.37681 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3707  C4-dicarboxylate transporter DctA  48.62 
 
 		 450 aa  366  1e-100  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00151684 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0367  sodium:dicarboxylate symporter  46.62 
 
 		 447 aa  366  1e-100  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4413  sodium:dicarboxylate symporter  47.72 
 
 		 468 aa  365  1e-100  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0153  C4-dicarboxylate transporter DctA  49.39 
 
 		 429 aa  367  1e-100  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.401467 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0982  C4-dicarboxylate transporter DctA  50.25 
 
 		 452 aa  366  1e-100  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.206436  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49130  C4-dicarboxylate transporter DctA  49.5 
 
 		 436 aa  365  1e-99  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000308919 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4196  C4-dicarboxylate transporter DctA  49.26 
 
 		 436 aa  363  4e-99  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4236  C4-dicarboxylate transporter DctA  48.28 
 
 		 444 aa  361  1e-98  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.825955 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0132  sodium:dicarboxylate symporter  47.43 
 
 		 449 aa  360  2e-98  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0735159  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3258  sodium:dicarboxylate symporter  45.77 
 
 		 446 aa  360  2e-98  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.823996  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1200  C4-dicarboxylate transporter DctA  48.39 
 
 		 440 aa  360  2e-98  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1872  C4-dicarboxylate transporter  50.86 
 
 		 430 aa  359  4e-98  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3547  sodium:dicarboxylate symporter  50.38 
 
 		 454 aa  359  5e-98  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0280524 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2032  C4-dicarboxylate transporter DctA  50.24 
 
 		 447 aa  359  5e-98  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0356  sodium:dicarboxylate symporter  49.88 
 
 		 442 aa  359  6e-98  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.212213  normal  0.69556 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0192  C4-dicarboxylate transporter DctA  49.88 
 
 		 429 aa  358  8e-98  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0620705 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0027  sodium:dicarboxylate symporter  46.45 
 
 		 450 aa  358  9e-98  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0186  C4-dicarboxylate transporter DctA  49.63 
 
 		 429 aa  358  9.999999999999999e-98  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.436113  normal  0.912792 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1188  C4-dicarboxylate transporter DctA  47.79 
 
 		 440 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.32454  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4228  C4-dicarboxylate transporter DctA  48.39 
 
 		 440 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1218  C4-dicarboxylate transporter DctA  48.14 
 
 		 440 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.623958  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0009  sodium:dicarboxylate symporter  46.21 
 
 		 450 aa  357  2.9999999999999997e-97  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.767498  normal  0.693161 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3059  sodium:dicarboxylate symporter  46.81 
 
 		 447 aa  355  5.999999999999999e-97  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1437  C4-dicarboxylate transporter DctA  48.54 
 
 		 447 aa  355  5.999999999999999e-97  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0432682  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3283  sodium:dicarboxylate symporter  46.81 
 
 		 447 aa  354  1e-96  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2717  C4-dicarboxylate transporter DctA  47.41 
 
 		 443 aa  354  1e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2034  C4-dicarboxylate transporter DctA  49.88 
 
 		 442 aa  353  2.9999999999999997e-96  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.636554  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2884  sodium:dicarboxylate symporter  45.37 
 
 		 425 aa  352  7e-96  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.701489  normal  0.137865 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33260  C4-dicarboxylate transporter DctA  48.77 
 
 		 442 aa  352  8e-96  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.36472  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0640  C4-dicarboxylate transporter DctA  45.58 
 
 		 444 aa  351  1e-95  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.367999  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0330  C4-dicarboxylate transporter DctA  47.3 
 
 		 428 aa  351  2e-95  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2994  C4-dicarboxylate transporter DctA  49.03 
 
 		 449 aa  350  3e-95  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.134288  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3480  C4-dicarboxylate transporter DctA  47.17 
 
 		 444 aa  349  4e-95  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.327392  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0399  C4-dicarboxylate transporter DctA  45.58 
 
 		 444 aa  349  4e-95  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0476  C4-dicarboxylate transporter DctA  47.39 
 
 		 428 aa  348  7e-95  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.145716  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4178  C4-dicarboxylate transporter DctA  46.32 
 
 		 454 aa  348  7e-95  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.174427 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0456  C4-dicarboxylate transporter DctA  47.39 
 
 		 428 aa  348  7e-95  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4299  C4-dicarboxylate transporter DctA  50.5 
 
 		 452 aa  347  3e-94  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00709019 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2815  C4-dicarboxylate transporter DctA  47.15 
 
 		 428 aa  346  6e-94  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3228  C4-dicarboxylate transporter DctA  47.15 
 
 		 428 aa  346  6e-94  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0204  C4-dicarboxylate transporter DctA  47.15 
 
 		 428 aa  346  6e-94  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0430  C4-dicarboxylate transporter DctA  47.15 
 
 		 429 aa  346  6e-94  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1389  C4-dicarboxylate transporter DctA  47.15 
 
 		 428 aa  346  6e-94  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2978  C4-dicarboxylate transporter DctA  45.63 
 
 		 444 aa  345  7e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.231883  normal  0.172231 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3554  sodium:dicarboxylate symporter  43.49 
 
 		 455 aa  345  8e-94  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.325233 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2056  sodium:dicarboxylate symporter  45.04 
 
 		 439 aa  344  2e-93  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.220852  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2501  sodium:dicarboxylate symporter  45.72 
 
 		 452 aa  344  2e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.235664  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3684  sodium:dicarboxylate symporter  44.79 
 
 		 435 aa  343  2e-93  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2884  C4-dicarboxylate transporter DctA  47.15 
 
 		 430 aa  344  2e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0997591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2873  C4-dicarboxylate transporter DctA  47.15 
 
 		 430 aa  344  2e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.259802  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>