More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_1399 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_1399  sodium:dicarboxylate symporter  100 
 
 
418 aa  830    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1855  sodium:dicarboxylate symporter  65.29 
 
 
414 aa  538  9.999999999999999e-153  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3380  C4-dicarboxylate transporter DctA  64.04 
 
 
420 aa  526  1e-148  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.290736  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3346  C4-dicarboxylate transporter DctA  64.04 
 
 
438 aa  526  1e-148  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00211585  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3294  C4-dicarboxylate transporter DctA  64.04 
 
 
420 aa  526  1e-148  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0209332  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3597  C4-dicarboxylate transporter DctA  64.04 
 
 
420 aa  526  1e-148  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000021811 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1620  C4-dicarboxylate transporter DctA  64.2 
 
 
420 aa  526  1e-148  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000559641  hitchhiker  0.000636022 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3697  C4-dicarboxylate transporter DctA  63.7 
 
 
420 aa  523  1e-147  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0331766  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2244  C4-dicarboxylate transporter DctA  63.46 
 
 
413 aa  522  1e-147  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0602805  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3612  C4-dicarboxylate transporter DctA  63.95 
 
 
420 aa  510  1e-143  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000454164  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3604  C4-dicarboxylate transporter DctA  63.7 
 
 
420 aa  509  1e-143  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.389605  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0356  sodium:dicarboxylate symporter  56.13 
 
 
442 aa  457  1e-127  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.212213  normal  0.69556 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3225  sodium:dicarboxylate symporter  54.79 
 
 
439 aa  448  1e-125  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.891613  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0982  C4-dicarboxylate transporter DctA  53.68 
 
 
452 aa  449  1e-125  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.206436  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1039  sodium:dicarboxylate symporter  54.05 
 
 
439 aa  445  1.0000000000000001e-124  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.681651 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3748  C4-dicarboxylate transporter DctA  53.83 
 
 
448 aa  447  1.0000000000000001e-124  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3533  sodium:dicarboxylate symporter  56.43 
 
 
423 aa  441  1e-123  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.982128  normal  0.330869 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3501  C4-dicarboxylate transporter DctA  55.06 
 
 
451 aa  443  1e-123  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0517  C4-dicarboxylate transporter DctA  54.57 
 
 
421 aa  440  9.999999999999999e-123  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.946656  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1379  C4-dicarboxylate transporter DctA  55.56 
 
 
420 aa  440  9.999999999999999e-123  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5339  C4-dicarboxylate transporter DctA  54.61 
 
 
465 aa  440  9.999999999999999e-123  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4196  C4-dicarboxylate transporter DctA  51.56 
 
 
436 aa  441  9.999999999999999e-123  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49130  C4-dicarboxylate transporter DctA  51.32 
 
 
436 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000308919 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0381  sodium:dicarboxylate symporter  53.94 
 
 
437 aa  440  9.999999999999999e-123  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000240059  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3547  sodium:dicarboxylate symporter  55.06 
 
 
454 aa  436  1e-121  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0280524 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03376  C4-dicarboxylate transport protein  51.84 
 
 
428 aa  432  1e-120  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0083  C4-dicarboxylate transporter DctA  52.09 
 
 
430 aa  433  1e-120  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0185  sodium:dicarboxylate symporter  52.09 
 
 
428 aa  434  1e-120  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0189  C4-dicarboxylate transporter DctA  52.09 
 
 
428 aa  434  1e-120  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4016  C4-dicarboxylate transporter DctA  52.09 
 
 
428 aa  434  1e-120  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3934  C4-dicarboxylate transporter DctA  52.09 
 
 
428 aa  434  1e-120  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2100  Sodium/dicarboxylate symporter  51.58 
 
 
440 aa  434  1e-120  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03329  hypothetical protein  51.84 
 
 
428 aa  432  1e-120  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1777  sodium:dicarboxylate symporter  51.58 
 
 
440 aa  433  1e-120  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3836  C4-dicarboxylate transporter DctA  52.09 
 
 
428 aa  434  1e-120  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.275466 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4892  C4-dicarboxylate transporter DctA  51.33 
 
 
428 aa  434  1e-120  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.321398  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3731  C4-dicarboxylate transporter DctA  52.09 
 
 
428 aa  434  1e-120  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1856  sodium:dicarboxylate symporter  51.58 
 
 
440 aa  433  1e-120  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2032  C4-dicarboxylate transporter DctA  54.17 
 
 
447 aa  431  1e-119  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0080  C4-dicarboxylate transporter DctA  52.09 
 
 
430 aa  431  1e-119  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3925  C4-dicarboxylate transporter DctA  52.33 
 
 
428 aa  431  1e-119  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2034  C4-dicarboxylate transporter DctA  52.42 
 
 
442 aa  427  1e-118  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.636554  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1682  C4-dicarboxylate transport protein  51.85 
 
 
460 aa  422  1e-117  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.662063  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4078  C4-dicarboxylate transporter DctA  51.48 
 
 
428 aa  424  1e-117  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0228  C4-dicarboxylate transporter DctA  50.99 
 
 
429 aa  424  1e-117  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0367  sodium:dicarboxylate symporter  51.22 
 
 
447 aa  424  1e-117  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0153  C4-dicarboxylate transporter DctA  51.71 
 
 
429 aa  422  1e-117  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.401467 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3890  C4-dicarboxylate transporter DctA  51.23 
 
 
430 aa  423  1e-117  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3707  C4-dicarboxylate transporter DctA  51.6 
 
 
450 aa  420  1e-116  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00151684 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2994  C4-dicarboxylate transporter DctA  53.61 
 
 
449 aa  421  1e-116  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.134288  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4340  C4-dicarboxylate transporter DctA  53.62 
 
 
447 aa  421  1e-116  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1840  C4-dicarboxylate transporter DctA  51.46 
 
 
439 aa  421  1e-116  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.731313  normal  0.395958 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1200  C4-dicarboxylate transporter DctA  52.1 
 
 
440 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3283  sodium:dicarboxylate symporter  49.64 
 
 
447 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4064  C4-dicarboxylate transporter DctA  50.72 
 
 
429 aa  418  9.999999999999999e-116  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4228  C4-dicarboxylate transporter DctA  52.1 
 
 
440 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0640  C4-dicarboxylate transporter DctA  52.21 
 
 
444 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.367999  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6225  C4-dicarboxylate transport protein  49.26 
 
 
444 aa  416  9.999999999999999e-116  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0098  C4-dicarboxylate transporter DctA  50.72 
 
 
429 aa  417  9.999999999999999e-116  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0399  C4-dicarboxylate transporter DctA  51.96 
 
 
444 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0132  sodium:dicarboxylate symporter  50.61 
 
 
449 aa  415  9.999999999999999e-116  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0735159  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4299  C4-dicarboxylate transporter DctA  53.58 
 
 
452 aa  415  9.999999999999999e-116  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00709019 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3258  sodium:dicarboxylate symporter  49.64 
 
 
446 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.823996  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4067  C4-dicarboxylate transporter DctA  50.72 
 
 
429 aa  417  9.999999999999999e-116  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.409819 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0456  C4-dicarboxylate transporter DctA  52.21 
 
 
428 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0476  C4-dicarboxylate transporter DctA  52.21 
 
 
428 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.145716  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1188  C4-dicarboxylate transporter DctA  51.85 
 
 
440 aa  414  1e-114  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.32454  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1218  C4-dicarboxylate transporter DctA  51.85 
 
 
440 aa  414  1e-114  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.623958  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3822  C4-dicarboxylate transporter DctA  52.33 
 
 
428 aa  414  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0330  C4-dicarboxylate transporter DctA  51.98 
 
 
428 aa  414  1e-114  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3059  sodium:dicarboxylate symporter  49.64 
 
 
447 aa  414  1e-114  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2241  sodium:dicarboxylate symporter  51.08 
 
 
443 aa  412  1e-114  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.896869  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3228  C4-dicarboxylate transporter DctA  51.96 
 
 
428 aa  412  1e-114  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4236  C4-dicarboxylate transporter DctA  51.32 
 
 
444 aa  414  1e-114  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.825955 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3809  C4-dicarboxylate transporter DctA  52.33 
 
 
428 aa  414  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.708508 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3886  C4-dicarboxylate transporter DctA  52.33 
 
 
428 aa  414  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2884  C4-dicarboxylate transporter DctA  52.21 
 
 
430 aa  413  1e-114  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0997591  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2815  C4-dicarboxylate transporter DctA  51.96 
 
 
428 aa  412  1e-114  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2259  C4-dicarboxylate transporter DctA  52.21 
 
 
430 aa  413  1e-114  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3930  C4-dicarboxylate transporter DctA  52.33 
 
 
428 aa  414  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.080438  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0430  C4-dicarboxylate transporter DctA  52.21 
 
 
429 aa  413  1e-114  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3990  C4-dicarboxylate transporter DctA  52.33 
 
 
428 aa  414  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.142242 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2873  C4-dicarboxylate transporter DctA  52.21 
 
 
430 aa  413  1e-114  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.259802  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0204  C4-dicarboxylate transporter DctA  51.96 
 
 
428 aa  412  1e-114  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1389  C4-dicarboxylate transporter DctA  51.96 
 
 
428 aa  412  1e-114  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1872  C4-dicarboxylate transporter  50.62 
 
 
430 aa  410  1e-113  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0277  C4-dicarboxylate transporter DctA  51.49 
 
 
431 aa  408  1e-113  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4108  sodium:dicarboxylate symporter  49.39 
 
 
434 aa  408  1e-113  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0814495  normal  0.311636 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33260  C4-dicarboxylate transporter DctA  50.6 
 
 
442 aa  410  1e-113  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.36472  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6215  C4-dicarboxylate transporter DctA  51.44 
 
 
429 aa  411  1e-113  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2790  C4-dicarboxylate transporter DctA  50.96 
 
 
429 aa  411  1e-113  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.712352  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1440  C4-dicarboxylate transporter DctA  53.33 
 
 
448 aa  408  1e-113  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.022063  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2928  C4-dicarboxylate transporter DctA  51.47 
 
 
429 aa  410  1e-113  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4178  C4-dicarboxylate transporter DctA  48.43 
 
 
454 aa  410  1e-113  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.174427 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3480  C4-dicarboxylate transporter DctA  48.77 
 
 
444 aa  409  1e-113  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.327392  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4744  sodium:dicarboxylate symporter  50.37 
 
 
453 aa  407  1.0000000000000001e-112  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.747826 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1437  C4-dicarboxylate transporter DctA  50 
 
 
447 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0432682  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4772  sodium:dicarboxylate symporter  49.51 
 
 
449 aa  408  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.234615  normal  0.37681 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2729  sodium:dicarboxylate symporter  50.48 
 
 
461 aa  401  1e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.850093  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0186  C4-dicarboxylate transporter DctA  51.49 
 
 
429 aa  404  1e-111  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.436113  normal  0.912792 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>