More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3533 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_3533  sodium:dicarboxylate symporter  100 
 
 		 423 aa  841    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.982128  normal  0.330869 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1855  sodium:dicarboxylate symporter  65.52 
 
 		 414 aa  509  1e-143  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4523  sodium:dicarboxylate symporter  63.1 
 
 		 415 aa  492  9.999999999999999e-139  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.281817  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3380  C4-dicarboxylate transporter DctA  59.9 
 
 		 420 aa  471  1e-132  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.290736  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3346  C4-dicarboxylate transporter DctA  59.9 
 
 		 438 aa  472  1e-132  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00211585  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3294  C4-dicarboxylate transporter DctA  59.9 
 
 		 420 aa  472  1e-132  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0209332  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3597  C4-dicarboxylate transporter DctA  59.9 
 
 		 420 aa  472  1e-132  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000021811 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2244  C4-dicarboxylate transporter DctA  59.65 
 
 		 413 aa  473  1e-132  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0602805  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3697  C4-dicarboxylate transporter DctA  57.89 
 
 		 420 aa  471  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0331766  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1620  C4-dicarboxylate transporter DctA  59.65 
 
 		 420 aa  471  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000559641  hitchhiker  0.000636022 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3604  C4-dicarboxylate transporter DctA  57.89 
 
 		 420 aa  455  1e-127  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.389605  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3612  C4-dicarboxylate transporter DctA  58.13 
 
 		 420 aa  457  1e-127  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000454164  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1399  sodium:dicarboxylate symporter  56.43 
 
 		 418 aa  441  1e-123  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0228  C4-dicarboxylate transporter DctA  50.12 
 
 		 429 aa  412  1e-114  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5339  C4-dicarboxylate transporter DctA  50.57 
 
 		 465 aa  414  1e-114  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1777  sodium:dicarboxylate symporter  52.07 
 
 		 440 aa  409  1e-113  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1856  sodium:dicarboxylate symporter  52.07 
 
 		 440 aa  409  1e-113  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2100  Sodium/dicarboxylate symporter  49.21 
 
 		 440 aa  409  1e-113  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3225  sodium:dicarboxylate symporter  51.26 
 
 		 439 aa  411  1e-113  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.891613  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0356  sodium:dicarboxylate symporter  53.25 
 
 		 442 aa  409  1e-113  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.212213  normal  0.69556 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1039  sodium:dicarboxylate symporter  51.26 
 
 		 439 aa  410  1e-113  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.681651 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0381  sodium:dicarboxylate symporter  51.53 
 
 		 437 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000240059  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0982  C4-dicarboxylate transporter DctA  50.59 
 
 		 452 aa  405  1.0000000000000001e-112  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.206436  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0185  sodium:dicarboxylate symporter  49.64 
 
 		 428 aa  402  1e-111  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3731  C4-dicarboxylate transporter DctA  49.64 
 
 		 428 aa  402  1e-111  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0189  C4-dicarboxylate transporter DctA  49.64 
 
 		 428 aa  402  1e-111  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3836  C4-dicarboxylate transporter DctA  49.64 
 
 		 428 aa  402  1e-111  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.275466 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4016  C4-dicarboxylate transporter DctA  49.64 
 
 		 428 aa  402  1e-111  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0277  C4-dicarboxylate transporter DctA  50.58 
 
 		 431 aa  401  1e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0083  C4-dicarboxylate transporter DctA  49.05 
 
 		 430 aa  403  1e-111  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4892  C4-dicarboxylate transporter DctA  49.88 
 
 		 428 aa  404  1e-111  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.321398  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3934  C4-dicarboxylate transporter DctA  49.64 
 
 		 428 aa  402  1e-111  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0456  C4-dicarboxylate transporter DctA  52.16 
 
 		 428 aa  401  1e-111  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0476  C4-dicarboxylate transporter DctA  52.16 
 
 		 428 aa  401  1e-111  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.145716  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03376  C4-dicarboxylate transport protein  49.39 
 
 		 428 aa  400  9.999999999999999e-111  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0330  C4-dicarboxylate transporter DctA  50.98 
 
 		 428 aa  400  9.999999999999999e-111  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0186  C4-dicarboxylate transporter DctA  49.65 
 
 		 429 aa  399  9.999999999999999e-111  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.436113  normal  0.912792 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0430  C4-dicarboxylate transporter DctA  52.04 
 
 		 429 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0640  C4-dicarboxylate transporter DctA  51.93 
 
 		 444 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.367999  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03329  hypothetical protein  49.39 
 
 		 428 aa  400  9.999999999999999e-111  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0080  C4-dicarboxylate transporter DctA  49.05 
 
 		 430 aa  399  9.999999999999999e-111  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4772  sodium:dicarboxylate symporter  48.39 
 
 		 449 aa  398  1e-109  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.234615  normal  0.37681 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2815  C4-dicarboxylate transporter DctA  51.92 
 
 		 428 aa  398  1e-109  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3228  C4-dicarboxylate transporter DctA  51.92 
 
 		 428 aa  398  1e-109  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1379  C4-dicarboxylate transporter DctA  51.79 
 
 		 420 aa  396  1e-109  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3925  C4-dicarboxylate transporter DctA  49.64 
 
 		 428 aa  395  1e-109  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0399  C4-dicarboxylate transporter DctA  51.69 
 
 		 444 aa  397  1e-109  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0517  C4-dicarboxylate transporter DctA  51.46 
 
 		 421 aa  396  1e-109  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.946656  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3258  sodium:dicarboxylate symporter  48.39 
 
 		 446 aa  395  1e-109  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.823996  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0192  C4-dicarboxylate transporter DctA  49.41 
 
 		 429 aa  397  1e-109  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0620705 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0367  sodium:dicarboxylate symporter  50.85 
 
 		 447 aa  397  1e-109  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3748  C4-dicarboxylate transporter DctA  50 
 
 		 448 aa  397  1e-109  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0204  C4-dicarboxylate transporter DctA  51.92 
 
 		 428 aa  398  1e-109  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0132  sodium:dicarboxylate symporter  48.38 
 
 		 449 aa  395  1e-109  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0735159  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1389  C4-dicarboxylate transporter DctA  51.92 
 
 		 428 aa  398  1e-109  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4744  sodium:dicarboxylate symporter  48.71 
 
 		 453 aa  393  1e-108  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.747826 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6215  C4-dicarboxylate transporter DctA  50.83 
 
 		 429 aa  394  1e-108  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1437  C4-dicarboxylate transporter DctA  50.61 
 
 		 447 aa  392  1e-108  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0432682  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3283  sodium:dicarboxylate symporter  48.15 
 
 		 447 aa  392  1e-108  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2259  C4-dicarboxylate transporter DctA  51.08 
 
 		 430 aa  392  1e-108  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2928  C4-dicarboxylate transporter DctA  50.95 
 
 		 429 aa  394  1e-108  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2790  C4-dicarboxylate transporter DctA  50.95 
 
 		 429 aa  394  1e-108  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.712352  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2873  C4-dicarboxylate transporter DctA  51.08 
 
 		 430 aa  392  1e-108  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.259802  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3059  sodium:dicarboxylate symporter  48.15 
 
 		 447 aa  391  1e-107  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4340  C4-dicarboxylate transporter DctA  51.92 
 
 		 447 aa  390  1e-107  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2884  C4-dicarboxylate transporter DctA  50.84 
 
 		 430 aa  391  1e-107  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0997591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1840  C4-dicarboxylate transporter DctA  49.77 
 
 		 439 aa  390  1e-107  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.731313  normal  0.395958 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3890  C4-dicarboxylate transporter DctA  49.39 
 
 		 430 aa  386  1e-106  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1774  sodium:dicarboxylate symporter  50.85 
 
 		 448 aa  387  1e-106  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.458594  normal  0.0497 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3501  C4-dicarboxylate transporter DctA  49.88 
 
 		 451 aa  387  1e-106  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2717  C4-dicarboxylate transporter DctA  47.7 
 
 		 443 aa  387  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3930  C4-dicarboxylate transporter DctA  49.15 
 
 		 428 aa  383  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.080438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2034  C4-dicarboxylate transporter DctA  48.96 
 
 		 442 aa  382  1e-105  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.636554  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3886  C4-dicarboxylate transporter DctA  49.15 
 
 		 428 aa  383  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3707  C4-dicarboxylate transporter DctA  47.14 
 
 		 450 aa  384  1e-105  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00151684 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2994  C4-dicarboxylate transporter DctA  50.92 
 
 		 449 aa  384  1e-105  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.134288  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3990  C4-dicarboxylate transporter DctA  49.15 
 
 		 428 aa  383  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.142242 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3822  C4-dicarboxylate transporter DctA  49.15 
 
 		 428 aa  383  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3809  C4-dicarboxylate transporter DctA  49.15 
 
 		 428 aa  383  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.708508 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4178  C4-dicarboxylate transporter DctA  47.11 
 
 		 454 aa  383  1e-105  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.174427 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0153  C4-dicarboxylate transporter DctA  47.57 
 
 		 429 aa  383  1e-105  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.401467 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4078  C4-dicarboxylate transporter DctA  49.39 
 
 		 428 aa  384  1e-105  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8666  sodium:dicarboxylate symporter  47.91 
 
 		 466 aa  380  1e-104  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1682  C4-dicarboxylate transport protein  48.18 
 
 		 460 aa  379  1e-104  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.662063  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2729  sodium:dicarboxylate symporter  51.09 
 
 		 461 aa  379  1e-104  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.850093  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4299  C4-dicarboxylate transporter DctA  51.07 
 
 		 452 aa  381  1e-104  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00709019 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0518  C4-dicarboxylate transporter DctA  51.35 
 
 		 426 aa  381  1e-104  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.51947  normal  0.633866 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49130  C4-dicarboxylate transporter DctA  48.17 
 
 		 436 aa  380  1e-104  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000308919 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3480  C4-dicarboxylate transporter DctA  46.87 
 
 		 444 aa  381  1e-104  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.327392  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2032  C4-dicarboxylate transporter DctA  50.96 
 
 		 447 aa  380  1e-104  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3547  sodium:dicarboxylate symporter  48.74 
 
 		 454 aa  380  1e-104  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0280524 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1872  C4-dicarboxylate transporter  51.62 
 
 		 430 aa  377  1e-103  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0225  C4-dicarboxylate transporter DctA  50.62 
 
 		 426 aa  378  1e-103  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4067  C4-dicarboxylate transporter DctA  47.7 
 
 		 429 aa  376  1e-103  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.409819 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4197  C4-dicarboxylate transporter DctA  51.49 
 
 		 426 aa  377  1e-103  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.481188 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4064  C4-dicarboxylate transporter DctA  47.7 
 
 		 429 aa  376  1e-103  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4196  C4-dicarboxylate transporter DctA  47.68 
 
 		 436 aa  378  1e-103  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2978  C4-dicarboxylate transporter DctA  47.7 
 
 		 444 aa  376  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.231883  normal  0.172231 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1218  C4-dicarboxylate transporter DctA  46.79 
 
 		 440 aa  375  1e-103  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.623958  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0098  C4-dicarboxylate transporter DctA  47.7 
 
 		 429 aa  376  1e-103  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>