More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_4113 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_4113  oxidoreductase domain-containing protein  100 
 
 
354 aa  739    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.152531  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2775  oxidoreductase domain protein  75.71 
 
 
361 aa  580  1e-164  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0108511  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1052  oxidoreductase domain-containing protein  26.42 
 
 
359 aa  98.6  1e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.704406  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3483  oxidoreductase domain-containing protein  25.27 
 
 
387 aa  96.3  7e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4507  oxidoreductase domain protein  24.24 
 
 
358 aa  91.3  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0706  putative oxidoreductase  26.58 
 
 
331 aa  90.1  5e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00559097  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0344  oxidoreductase domain protein  23.55 
 
 
347 aa  87.8  3e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0351  oxidoreductase domain-containing protein  24.46 
 
 
360 aa  87  4e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0333  oxidoreductase domain-containing protein  24.46 
 
 
360 aa  87  4e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.137144  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2970  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  26.14 
 
 
377 aa  85.5  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3042  oxidoreductase domain-containing protein  26.14 
 
 
377 aa  85.5  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1073  oxidoreductase domain-containing protein  31.55 
 
 
362 aa  84.7  0.000000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3335  oxidoreductase domain protein  24.61 
 
 
377 aa  84.3  0.000000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1871  hypothetical protein  25.85 
 
 
377 aa  83.2  0.000000000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00529235 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0558  oxidoreductase domain protein  25.53 
 
 
359 aa  82.8  0.000000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2927  putative dehydrogenase  24.02 
 
 
337 aa  82  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.311728  hitchhiker  0.00000297483 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5057  oxidoreductase domain protein  30 
 
 
381 aa  82.4  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4018  oxidoreductase domain protein  31.68 
 
 
365 aa  82.4  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0993  oxidoreductase domain-containing protein  29.82 
 
 
385 aa  82  0.00000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3283  inositol 2-dehydrogenase  24.18 
 
 
331 aa  80.9  0.00000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00244107 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1957  oxidoreductase-like  23.83 
 
 
341 aa  80.5  0.00000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.476566  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0256  oxidoreductase-like  24.3 
 
 
368 aa  80.1  0.00000000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2997  oxidoreductase domain protein  22.92 
 
 
377 aa  80.1  0.00000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3076  dehydrogenase-like protein  24.08 
 
 
342 aa  80.1  0.00000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.103628 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1442  oxidoreductase domain-containing protein  24.8 
 
 
376 aa  80.1  0.00000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0681  oxidoreductase domain-containing protein  26.53 
 
 
329 aa  79.7  0.00000000000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.109969 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2702  oxidoreductase domain protein  32.47 
 
 
329 aa  79.3  0.00000000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.832621  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4806  oxidoreductase domain-containing protein  27.03 
 
 
391 aa  79.3  0.00000000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.104238  normal 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4623  oxidoreductase domain-containing protein  27.03 
 
 
400 aa  78.2  0.0000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2334  oxidoreductase domain protein  25.84 
 
 
366 aa  77.4  0.0000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3435  oxidoreductase domain protein  28.24 
 
 
381 aa  77.8  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1611  oxidoreductase-like protein  32.65 
 
 
335 aa  77.4  0.0000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4289  oxidoreductase domain protein  27.63 
 
 
374 aa  77.4  0.0000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4959  oxidoreductase domain protein  26.49 
 
 
395 aa  77  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.598803  normal  0.114649 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2780  oxidoreductase domain protein  26.49 
 
 
395 aa  77  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.779998  normal  0.106115 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2951  oxidoreductase domain protein  24.27 
 
 
359 aa  77  0.0000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1583  dehydrogenase  23.66 
 
 
378 aa  77  0.0000000000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000299864  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4185  oxidoreductase domain protein  24.11 
 
 
377 aa  76.3  0.0000000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2924  oxidoreductase domain-containing protein  25.95 
 
 
404 aa  76.3  0.0000000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.624367 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0199  oxidoreductase domain-containing protein  23.18 
 
 
374 aa  75.9  0.0000000000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1340  oxidoreductase domain protein  23.7 
 
 
377 aa  75.5  0.000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2412  inositol 2-dehydrogenase  26.33 
 
 
336 aa  75.9  0.000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.17702 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08642  NAD binding Rossmann fold oxidoreductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G04870)  33.06 
 
 
408 aa  74.7  0.000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0962  oxidoreductase domain-containing protein  24.87 
 
 
357 aa  75.1  0.000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0510  oxidoreductase domain protein  28.95 
 
 
371 aa  75.1  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0984  oxidoreductase domain protein  25.71 
 
 
371 aa  74.7  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.915722 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2654  oxidoreductase domain protein  24.58 
 
 
325 aa  74.3  0.000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0431748  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1594  oxidoreductase domain-containing protein  24.65 
 
 
340 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.410074  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0202  oxidoreductase domain-containing protein  27.45 
 
 
359 aa  74.3  0.000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5584  oxidoreductase  26.3 
 
 
356 aa  74.3  0.000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0916209  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0208  oxidoreductase domain-containing protein  27.45 
 
 
359 aa  74.3  0.000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3330  oxidoreductase domain protein  23.36 
 
 
339 aa  73.9  0.000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0129274  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1832  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  35.11 
 
 
353 aa  73.9  0.000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000457819  normal  0.338324 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2791  oxidoreductase domain-containing protein  26.38 
 
 
382 aa  73.6  0.000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3184  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  36.19 
 
 
353 aa  73.2  0.000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3425  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  36.19 
 
 
353 aa  73.2  0.000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1396  oxidoreductase domain-containing protein  22.74 
 
 
364 aa  73.2  0.000000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.780713  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0434  oxidoreductase domain-containing protein  21.7 
 
 
356 aa  73.6  0.000000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1908  4,5-dihydroxyphthalate dehydrogenase  25.74 
 
 
399 aa  73.2  0.000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.810291 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2007  oxidoreductase  32.45 
 
 
336 aa  73.2  0.000000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0414834  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0808  oxidoreductase domain protein  28 
 
 
367 aa  72.8  0.000000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.721919  normal  0.048308 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1741  oxidoreductase domain protein  28.19 
 
 
462 aa  72.8  0.000000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4503  oxidoreductase domain protein  27.14 
 
 
345 aa  72.8  0.000000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1047  oxidoreductase domain protein  26.84 
 
 
374 aa  72.8  0.000000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3413  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  38.1 
 
 
353 aa  72.8  0.000000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0020549  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3425  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  36.19 
 
 
353 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00879234  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1542  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  29.38 
 
 
318 aa  72.4  0.00000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0948  oxidoreductase domain protein  25.5 
 
 
382 aa  72  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.191297  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5258  oxidoreductase domain protein  24.79 
 
 
397 aa  72  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3112  oxidoreductase  36.07 
 
 
353 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4617  oxidoreductase domain protein  24.32 
 
 
397 aa  72  0.00000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1300  WblB protein  22.07 
 
 
363 aa  72.4  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.984195  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0297  oxidoreductase domain protein  30.52 
 
 
459 aa  72  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.628697  normal  0.651102 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1682  oxidoreductase-like protein  25.53 
 
 
409 aa  72.4  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3437  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  35.48 
 
 
353 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3257  oxidoreductase domain protein  22.1 
 
 
337 aa  72.4  0.00000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4002  oxidoreductase domain protein  30 
 
 
485 aa  72  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.725153  unclonable  0.000000000000020909 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1655  oxidoreductase domain-containing protein  25.53 
 
 
409 aa  72.4  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0349  oxidoreductase domain protein  21.81 
 
 
350 aa  72  0.00000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1039  oxidoreductase domain-containing protein  27.92 
 
 
346 aa  71.2  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0630  oxidoreductase domain protein  31.98 
 
 
374 aa  71.6  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0605312  normal  0.23471 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1699  oxidoreductase domain-containing protein  20.58 
 
 
334 aa  71.6  0.00000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1725  oxidoreductase-like protein  26.86 
 
 
387 aa  71.6  0.00000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3338  inositol 2-dehydrogenase  21.86 
 
 
330 aa  72  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.886837 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5612  oxidoreductase domain-containing protein  25 
 
 
409 aa  71.6  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1711  oxidoreductase domain-containing protein  25 
 
 
409 aa  71.6  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.745683 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0541  oxidoreductase domain-containing protein  25 
 
 
409 aa  71.6  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.895563  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3206  oxidoreductase domain-containing protein  26.06 
 
 
369 aa  71.6  0.00000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0599  oxidoreductase domain-containing protein  22.82 
 
 
383 aa  71.6  0.00000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0542  oxidoreductase domain-containing protein  25 
 
 
409 aa  71.6  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0624  oxidoreductase domain-containing protein  25 
 
 
409 aa  71.6  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1084  oxidoreductase domain-containing protein  27.61 
 
 
382 aa  71.6  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.413196 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1461  oxidoreductase-like  24.54 
 
 
386 aa  70.9  0.00000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.885347  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0551  oxidoreductase domain protein  25.13 
 
 
338 aa  70.9  0.00000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.274192  normal  0.0300917 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4484  oxidoreductase-like  24.44 
 
 
343 aa  71.2  0.00000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.418021  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0268  dehydrogenase related protein  29.7 
 
 
339 aa  70.9  0.00000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2424  oxidoreductase domain-containing protein  22.89 
 
 
342 aa  70.9  0.00000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.865581  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2441  oxidoreductase domain-containing protein  27.04 
 
 
361 aa  71.2  0.00000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.142653 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2849  oxidoreductase domain-containing protein  30.16 
 
 
349 aa  71.2  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1137  oxidoreductase domain protein  25.59 
 
 
371 aa  70.5  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.985714 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>