37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_4084 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_4084  hypothetical protein  100 
 
 
472 aa  973    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.200765  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2735  hypothetical protein  48.78 
 
 
459 aa  467  9.999999999999999e-131  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.338908  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2778  hypothetical protein  48.37 
 
 
464 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2740  Acetyl xylan esterase  44.44 
 
 
382 aa  271  2e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.559874 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5622  Acetyl xylan esterase  41.5 
 
 
407 aa  270  5e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.951758  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2433  hypothetical protein  26 
 
 
345 aa  71.6  0.00000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1726  hypothetical protein  26.02 
 
 
710 aa  67  0.0000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1693  putative signal peptide protein  26.06 
 
 
305 aa  58.5  0.0000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0635  putative signal peptide protein  33.07 
 
 
360 aa  58.2  0.0000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0599  hypothetical protein  25.25 
 
 
651 aa  56.2  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3608  putative signal peptide protein  32.28 
 
 
360 aa  56.2  0.000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3747  dienelactone hydrolase  21.54 
 
 
392 aa  55.1  0.000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0677  dienelactone hydrolase  22.57 
 
 
394 aa  55.1  0.000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0637  dienelactone hydrolase  21.14 
 
 
392 aa  54.7  0.000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3562  dienelactone hydrolase  23.41 
 
 
392 aa  53.1  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0783  conserved hypothetical signal peptide protein  26.71 
 
 
356 aa  52.4  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3924  hypothetical protein  24.34 
 
 
385 aa  51.2  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0127899  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3950  hypothetical protein  24.08 
 
 
328 aa  50.8  0.00006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.992848 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2468  hypothetical protein  25.95 
 
 
425 aa  50.4  0.00007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.425781  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0206  putative signal peptide protein  29.13 
 
 
342 aa  50.4  0.00007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.990614 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3838  hypothetical protein  24.34 
 
 
360 aa  50.1  0.00009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00401866  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2708  putative signal peptide protein  29.77 
 
 
355 aa  50.1  0.00009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.849399  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1580  hypothetical protein  30 
 
 
342 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.19158  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3497  hypothetical protein  29.01 
 
 
351 aa  49.7  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3021  peptidase S15  27.05 
 
 
292 aa  49.7  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1086  alpha/beta family hydrolase  28.91 
 
 
354 aa  49.3  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0342  Dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase  24.3 
 
 
381 aa  48.5  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6854  hypothetical protein  29.13 
 
 
336 aa  49.3  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0039  conserved hypothetical signal peptide protein  34.83 
 
 
355 aa  47.4  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3047  putative signal peptide protein  29.77 
 
 
355 aa  47.4  0.0005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5514  ABC transporter related  34.4 
 
 
968 aa  47.4  0.0006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2014  conserved hypothetical signal peptide protein  33.71 
 
 
345 aa  46.6  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.354348  normal  0.746698 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2980  dienelactone hydrolase  25.34 
 
 
342 aa  45.4  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.273684  normal  0.444829 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2600  dienelactone hydrolase  26.03 
 
 
321 aa  44.7  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.379294 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3799  hypothetical protein  29.66 
 
 
342 aa  44.7  0.004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.851496  hitchhiker  0.000320227 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14490  putative hydrolase  30.77 
 
 
307 aa  43.5  0.008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3166  peptidase S15  27.34 
 
 
348 aa  43.1  0.01  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>