More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_3740 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_3740  response regulator receiver protein  100 
 
 		 166 aa  331  3e-90  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2317  response regulator receiver protein  39.19 
 
 		 149 aa  112  3e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3183  response regulator receiver protein  47.2 
 
 		 147 aa  107  7.000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3545  response regulator for Gln (sensor glnL) (nitrogen regulator I, NRI)  37.67 
 
 		 148 aa  107  7.000000000000001e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000295304  normal  0.0892706 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1900  response regulator  38.57 
 
 		 148 aa  99  2e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.176755  normal  0.0491434 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3767  response regulator receiver protein  39.58 
 
 		 149 aa  97.8  7e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3567  response regulator receiver protein  41.27 
 
 		 148 aa  97.1  1e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01274  putative two-component response regulator  37.31 
 
 		 150 aa  96.3  2e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2718  response regulator receiver protein  37.4 
 
 		 153 aa  94.4  6e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.50209 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2409  response regulator receiver protein  41.32 
 
 		 151 aa  93.6  1e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4153  response regulator receiver protein  37.67 
 
 		 152 aa  92.8  2e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2513  response regulator receiver protein  34.78 
 
 		 149 aa  92.4  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.321661  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1357  response regulator receiver protein  35.77 
 
 		 148 aa  91.7  4e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.463554  normal  0.0634619 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3248  response regulator receiver  39.84 
 
 		 148 aa  90.1  1e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.264895  normal  0.0679711 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4841  response regulator receiver protein  34.48 
 
 		 149 aa  90.5  1e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5359  response regulator receiver protein  34.59 
 
 		 148 aa  89.7  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2328  response regulator receiver protein  36.64 
 
 		 157 aa  89.4  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0092  response regulator receiver protein  34.53 
 
 		 156 aa  89.4  2e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4344  response regulator receiver domain-containing protein  35.97 
 
 		 146 aa  87.4  7e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.676678  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1869  response regulator receiver protein  37.4 
 
 		 146 aa  87.4  8e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.124922  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3201  response regulator receiver protein  40 
 
 		 150 aa  87  9e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0782  response regulator receiver protein  35.07 
 
 		 160 aa  87  9e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00636968  normal  0.0949177 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1356  response regulator receiver domain-containing protein  38.21 
 
 		 151 aa  86.7  1e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3212  response regulator receiver protein  33.09 
 
 		 150 aa  86.3  2e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0163  response regulator receiver domain-containing protein  38.33 
 
 		 137 aa  85.5  3e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4012  response regulator receiver protein  34.09 
 
 		 134 aa  85.5  3e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.786329  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2540  response regulator receiver protein  36.51 
 
 		 150 aa  84.7  5e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2147  response regulator receiver protein  36 
 
 		 153 aa  84.7  5e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2385  response regulator receiver domain-containing protein  36.67 
 
 		 137 aa  84  0.000000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.849023  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3486  response regulator receiver protein  37.5 
 
 		 149 aa  83.2  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8462  response regulator receiver protein  34.13 
 
 		 149 aa  82.8  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1538  response regulator receiver protein  38.1 
 
 		 161 aa  83.2  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0424  response regulator receiver protein  40.54 
 
 		 150 aa  82.8  0.000000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0444  response regulator receiver protein  33.59 
 
 		 144 aa  82.8  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.247834 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2342  response regulator receiver  32.81 
 
 		 143 aa  82  0.000000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00382381  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1288  response regulator receiver domain-containing protein  35 
 
 		 137 aa  82  0.000000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2436  response regulator receiver protein  34.71 
 
 		 144 aa  81.6  0.000000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.287992  normal  0.438631 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0934  response regulator receiver protein  32.31 
 
 		 160 aa  81.6  0.000000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.152024  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4644  response regulator receiver protein  34.92 
 
 		 145 aa  81.6  0.000000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0382992  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2131  response regulator receiver protein  34.97 
 
 		 148 aa  80.9  0.000000000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.159262  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0974  response regulator receiver protein  35.34 
 
 		 162 aa  80.9  0.000000000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1124  response regulator receiver protein  34.92 
 
 		 165 aa  80.5  0.000000000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2528  response regulator receiver protein  35.25 
 
 		 145 aa  80.1  0.00000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0263  response regulator receiver domain-containing protein  37.4 
 
 		 152 aa  79.3  0.00000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.132061 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7209  response regulator receiver protein  35.88 
 
 		 149 aa  79.3  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.768943  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1813  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 156 aa  79.3  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2652  response regulator receiver protein  40.54 
 
 		 242 aa  79.7  0.00000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0315  response regulator receiver protein  34.65 
 
 		 141 aa  78.6  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22950  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  31.75 
 
 		 146 aa  78.6  0.00000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.213656 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0407  response regulator receiver protein  33.59 
 
 		 142 aa  78.6  0.00000000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.177022  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0807  response regulator receiver protein  31.11 
 
 		 158 aa  77.4  0.00000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3434  response regulator receiver protein  35.29 
 
 		 146 aa  77.8  0.00000000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0662678 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3788  response regulator receiver protein  34.31 
 
 		 152 aa  77.4  0.00000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0540  response regulator receiver protein  31.06 
 
 		 153 aa  77.4  0.00000000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.526175  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0753  response regulator receiver protein  33.61 
 
 		 146 aa  77.4  0.00000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.621173  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3286  response regulator receiver protein  33.83 
 
 		 162 aa  77  0.00000000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2404  response regulator receiver  28.57 
 
 		 154 aa  77  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0437246 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1795  response regulator receiver protein  35 
 
 		 153 aa  77  0.0000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.225692 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1954  response regulator receiver protein  34.78 
 
 		 146 aa  75.9  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4791  response regulator receiver protein  30.3 
 
 		 147 aa  76.3  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.612255  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2912  response regulator receiver protein  34.75 
 
 		 141 aa  76.3  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2262  response regulator receiver protein  32.86 
 
 		 146 aa  76.3  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5035  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 145 aa  76.3  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1861  response regulator receiver protein  33.87 
 
 		 131 aa  76.3  0.0000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.123392  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1008  response regulator  35.29 
 
 		 150 aa  75.5  0.0000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0284  response regulator receiver protein  33.86 
 
 		 141 aa  75.9  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0663  response regulator receiver domain-containing protein  37.93 
 
 		 144 aa  75.5  0.0000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00863835 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2630  response regulator receiver domain-containing protein  36.07 
 
 		 153 aa  75.5  0.0000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0587673  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0554  response regulator receiver protein  32.14 
 
 		 156 aa  75.5  0.0000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1265  response regulator receiver protein  33.85 
 
 		 149 aa  75.5  0.0000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1144  response regulator receiver protein  29.79 
 
 		 150 aa  75.5  0.0000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.497845  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1578  response regulator receiver protein  30.16 
 
 		 145 aa  75.9  0.0000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.649884  normal  0.339688 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2355  response regulator receiver protein  35 
 
 		 153 aa  75.5  0.0000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.484722 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3340  response regulator receiver protein  35 
 
 		 153 aa  75.5  0.0000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04305  two-component system regulatory protein  34.45 
 
 		 146 aa  75.1  0.0000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2877  response regulator receiver domain-containing protein  32.23 
 
 		 154 aa  75.1  0.0000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2268  response regulator receiver protein  37.5 
 
 		 145 aa  75.1  0.0000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1283  response regulator receiver protein  34.17 
 
 		 153 aa  74.7  0.0000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0282174 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1704  response regulator receiver  33.33 
 
 		 139 aa  75.1  0.0000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.635187  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0148  response regulator, CheY-like  34.29 
 
 		 145 aa  74.7  0.0000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1248  response regulator receiver protein  34.03 
 
 		 157 aa  74.7  0.0000000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.234845  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2720  response regulator receiver protein  32.81 
 
 		 147 aa  74.3  0.0000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.227152  normal  0.416438 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3878  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 146 aa  74.3  0.0000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.205471 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2690  response regulator receiver protein  32.81 
 
 		 147 aa  74.3  0.0000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0483585  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2734  response regulator receiver protein  32.81 
 
 		 147 aa  74.3  0.0000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.192545  normal  0.228442 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0290  response regulator receiver protein  31.58 
 
 		 151 aa  74.3  0.0000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000140993  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0473  response regulator  34.45 
 
 		 150 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0909  response regulator  34.45 
 
 		 150 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1433  response regulator  34.45 
 
 		 150 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.826903  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0381  response regulator  34.45 
 
 		 150 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1843  response regulator  34.45 
 
 		 150 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.682299  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1955  response regulator receiver protein  34.17 
 
 		 153 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.205931  normal  0.0730175 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1654  response regulator receiver domain-containing protein  33.06 
 
 		 139 aa  73.9  0.000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00207304  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5179  response regulator receiver protein  32.59 
 
 		 292 aa  73.9  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.172349 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4452  response regulator receiver domain-containing protein  27.78 
 
 		 155 aa  73.6  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0708  response regulator receiver protein  33.61 
 
 		 154 aa  73.6  0.000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1933  response regulator  34.45 
 
 		 150 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1899  response regulator receiver protein  38.26 
 
 		 139 aa  73.9  0.000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.727216  normal  0.206125 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0175  response regulator  34.45 
 
 		 150 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2731  response regulator receiver protein  36.22 
 
 		 173 aa  73.6  0.000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.360678  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>