31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_2426 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_2426  polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 		 489 aa  964    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08851  hypothetical protein  43.39 
 
 		 484 aa  404  1e-111  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.227884  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1920  polysaccharide biosynthesis protein  42.2 
 
 		 484 aa  390  1e-107  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0707623  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2768  membrane export protein  31.09 
 
 		 508 aa  224  2e-57  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0133  hypothetical protein  26.19 
 
 		 501 aa  149  1.0000000000000001e-34  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0569803 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4792  hypothetical protein  26.96 
 
 		 472 aa  148  2.0000000000000003e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0246434 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4270  hypothetical protein  23.2 
 
 		 499 aa  135  1.9999999999999998e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.796058 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4704  polysaccharide biosynthesis protein  24.95 
 
 		 498 aa  132  2.0000000000000002e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.318996  normal  0.409753 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4091  polysaccharide biosynthesis protein  24.26 
 
 		 430 aa  87  7e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1240  polysaccharide biosynthesis protein  23.96 
 
 		 493 aa  67.4  0.0000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.554345  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22850  polysaccharide biosynthesis protein  25.23 
 
 		 499 aa  64.3  0.000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2028  polysaccharide biosynthesis protein  22.07 
 
 		 423 aa  59.3  0.0000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.134656  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1123  transporter  22.57 
 
 		 488 aa  55.5  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2567  heteropolysaccharide repeat-containing protein  21.36 
 
 		 517 aa  55.5  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.09409  normal  0.0273385 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1796  polysaccharide biosynthesis protein  21.65 
 
 		 453 aa  49.3  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1424  polysaccharide biosynthesis protein  25.64 
 
 		 444 aa  48.9  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0621  polysaccharide biosynthesis protein  27.36 
 
 		 475 aa  47.8  0.0004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.914686  normal  0.0318754 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8594  polysaccharide biosynthesis protein  17.43 
 
 		 434 aa  48.1  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2006  polysaccharide biosynthesis protein  22.06 
 
 		 529 aa  47.4  0.0006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.300214  normal  0.433718 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1062  multi anti extrusion protein MatE  23.61 
 
 		 464 aa  47.4  0.0006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0177  polysaccharide biosynthesis protein  26.46 
 
 		 446 aa  47  0.0008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.89066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0582  polysaccharide biosynthesis protein  22.92 
 
 		 479 aa  46.2  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1211  polysaccharide biosynthesis protein  17.89 
 
 		 489 aa  45.4  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.401485 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2664  hypothetical protein  26.6 
 
 		 485 aa  45.8  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0040  polysaccharide biosynthesis protein  20.19 
 
 		 435 aa  45.8  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000125854  normal  0.0319641 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0945  multi antimicrobial extrusion protein MatE  24.3 
 
 		 495 aa  44.7  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.903745  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1069  polysaccharide biosynthesis protein  20.56 
 
 		 512 aa  44.7  0.004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.544527 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2073  polysaccharide biosynthesis protein  21.5 
 
 		 492 aa  44.3  0.005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1772  polysaccharide biosynthesis protein  23.91 
 
 		 496 aa  43.5  0.008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2188  polysaccharide biosynthesis protein  24.83 
 
 		 495 aa  43.5  0.008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1836  polysaccharide biosynthesis protein  21.03 
 
 		 446 aa  43.5  0.009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>