30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_1829 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_1829  hypothetical protein  100 
 
 
118 aa  236  6.999999999999999e-62  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.470131  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0585  hypothetical protein  68.38 
 
 
138 aa  167  4e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.600246  normal  0.811412 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3824  hypothetical protein  60.53 
 
 
143 aa  146  8e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.161652  normal  0.397741 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3838  hypothetical protein  59.65 
 
 
162 aa  144  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0996285  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3912  hypothetical protein  59.65 
 
 
143 aa  144  6e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.326133  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01390  predicted membrane protein  56.64 
 
 
148 aa  135  2e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.723159  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0961  hypothetical protein  57.8 
 
 
124 aa  132  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.383849  normal  0.472599 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17130  predicted membrane protein  54.13 
 
 
129 aa  128  2.0000000000000002e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0315505  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2375  DoxX family protein  51.38 
 
 
141 aa  124  4.0000000000000003e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.182096 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2364  hypothetical protein  53.21 
 
 
127 aa  116  9.999999999999999e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.773644  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5367  hypothetical protein  53.57 
 
 
129 aa  115  1.9999999999999998e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.352789  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15890  hypothetical protein  53.06 
 
 
141 aa  113  1.0000000000000001e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.294177  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1282  hypothetical protein  52.21 
 
 
149 aa  111  4.0000000000000004e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0600315  hitchhiker  0.00114943 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3627  hypothetical protein  55.36 
 
 
145 aa  103  9e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0225962  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3912  membrane protein-like protein  37.89 
 
 
140 aa  53.5  0.0000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0622055 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4384  membrane protein-like protein  37.5 
 
 
140 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.764117  normal  0.999315 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1635  DoxX family protein  32.63 
 
 
168 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.364562 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2333  membrane protein-like protein  33.04 
 
 
131 aa  47.4  0.00007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.296457 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2311  hypothetical protein  32 
 
 
135 aa  46.6  0.0001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1832  hypothetical protein  33.33 
 
 
134 aa  46.6  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0334928  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1934  hypothetical protein  29.41 
 
 
144 aa  45.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1649  hypothetical protein  32.63 
 
 
174 aa  44.3  0.0006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.37839  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1742  hypothetical protein  37.14 
 
 
116 aa  43.9  0.0007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3270  hypothetical protein  29.63 
 
 
121 aa  43.1  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.218398  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2608  hypothetical protein  37.5 
 
 
175 aa  43.5  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.253615 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0138  hypothetical protein  34.65 
 
 
117 aa  43.5  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.620738  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3443  hypothetical protein  27.45 
 
 
158 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.1066  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3783  membrane protein-like protein  34.72 
 
 
137 aa  42  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00217188  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1790  membrane protein  29.13 
 
 
150 aa  40.8  0.006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0469935  hitchhiker  0.000576942 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5051  hypothetical protein  30.69 
 
 
115 aa  40.4  0.008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.780189 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>