43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_0465 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_0465  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 138 aa  281  3.0000000000000004e-75  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2157  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  63.77 
 
 		 136 aa  186  7e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2335  XRE family transcriptional regulator  65.94 
 
 		 135 aa  178  2e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1155  XRE family transcriptional regulator  63.77 
 
 		 129 aa  177  4.999999999999999e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0632  XRE family transcriptional regulator  65.94 
 
 		 131 aa  176  7e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2571  XRE family transcriptional regulator  63.04 
 
 		 131 aa  174  3e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.255582  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3677  XRE family transcriptional regulator  60 
 
 		 138 aa  172  9.999999999999999e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.356584  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3648  XRE family transcriptional regulator  60 
 
 		 138 aa  172  9.999999999999999e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2048  XRE family transcriptional regulator  64.29 
 
 		 136 aa  171  1.9999999999999998e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.36941  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3720  XRE family transcriptional regulator  62.41 
 
 		 138 aa  171  2.9999999999999996e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0580307  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3628  XRE family transcriptional regulator  60.14 
 
 		 135 aa  165  2e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0172593  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2606  XRE family transcriptional regulator  64.57 
 
 		 129 aa  161  3e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.327119  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0686  XRE family transcriptional regulator  56.52 
 
 		 137 aa  160  4.0000000000000004e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0453336  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1284  XRE family transcriptional regulator  59.42 
 
 		 127 aa  159  1e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4739  XRE family transcriptional regulator  61.15 
 
 		 132 aa  154  6e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.391466  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4874  XRE family transcriptional regulator  60.58 
 
 		 133 aa  150  5e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0264852  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0967  helix-turn-helix domain protein  50 
 
 		 144 aa  137  3e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.131013  decreased coverage  0.000141679 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4478  helix-turn-helix domain protein  44.2 
 
 		 140 aa  114  3e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.320696 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0054  hypothetical protein  38.64 
 
 		 134 aa  98.6  2e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4999  hypothetical protein  37.98 
 
 		 133 aa  96.3  1e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1125  hypothetical protein  39.2 
 
 		 139 aa  95.5  2e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0817  hypothetical protein  41.3 
 
 		 138 aa  95.5  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0308517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2854  hypothetical protein  41.67 
 
 		 131 aa  94.7  4e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0927  hypothetical protein  40.58 
 
 		 139 aa  94.4  5e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.121235  normal  0.0771461 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4221  hypothetical protein  41.3 
 
 		 141 aa  94  6e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.664733  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1876  hypothetical protein  38.81 
 
 		 137 aa  92.4  2e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3145  hypothetical protein  35.61 
 
 		 137 aa  89  2e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.271734  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2816  hypothetical protein  37.31 
 
 		 135 aa  89.4  2e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.630225  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0656  hypothetical protein  36.51 
 
 		 134 aa  86.3  1e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.000000102711  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0813  hypothetical protein  36.52 
 
 		 110 aa  69.3  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0228663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4208  XRE family transcriptional regulator  34.96 
 
 		 129 aa  50.4  0.000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.629555  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4243  XRE family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 229 aa  43.9  0.0008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07960  transcriptional regulator PrtR  38.1 
 
 		 256 aa  43.5  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0101148  hitchhiker  0.000834984 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0172  XRE family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 75 aa  43.1  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.134297  normal  0.353283 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0755  transcriptional regulator PrtR  38.1 
 
 		 256 aa  43.5  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.011984  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2561  XRE family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 86 aa  42  0.003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.333504  normal  0.0163697 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4907  helix-turn-helix domain protein  36 
 
 		 85 aa  41.6  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0998227 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0772  transcriptional regulator, XRE family  32.79 
 
 		 123 aa  41.2  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2300  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 		 135 aa  40.8  0.007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0137231  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5722  putative transcriptional regulator  33.33 
 
 		 141 aa  40.4  0.008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3308  transcriptional regulator  38.6 
 
 		 187 aa  40.4  0.008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.38656  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3469  DNA-binding protein  38.6 
 
 		 189 aa  40.4  0.008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.162788  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3250  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  38.6 
 
 		 189 aa  40  0.01  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.653673  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>