269 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ent638_0539 on replicon NC_009436
Organism: Enterobacter sp. 638



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009436  Ent638_0539  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 286 aa  592  1e-168  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.536382  normal  0.0504206 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4977  radical SAM domain-containing protein  72.13 
 
 		 287 aa  427  1e-119  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.258865  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4923  radical SAM domain protein  71.43 
 
 		 287 aa  427  1e-118  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04255  predicted pyruvate formate lyase activating enzyme  71.43 
 
 		 287 aa  427  1e-118  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.542782  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3619  Radical SAM domain protein  71.43 
 
 		 287 aa  427  1e-118  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04221  hypothetical protein  71.43 
 
 		 287 aa  427  1e-118  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.606707  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4614  radical SAM domain-containing protein  70.73 
 
 		 287 aa  423  1e-117  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3677  radical SAM domain-containing protein  71.08 
 
 		 287 aa  422  1e-117  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.005025 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5892  radical SAM domain protein  70.73 
 
 		 287 aa  421  1e-117  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4927  radical SAM domain-containing protein  71.08 
 
 		 287 aa  422  1e-117  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4980  pyruvate formate lyase activating enzyme  70.38 
 
 		 287 aa  421  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.902486  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4921  pyruvate formate lyase activating enzyme  70.38 
 
 		 287 aa  419  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4886  pyruvate formate lyase activating enzyme  70.38 
 
 		 287 aa  420  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0614153  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4973  pyruvate formate lyase activating enzyme  70.03 
 
 		 287 aa  419  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.577557  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4819  pyruvate formate lyase activating enzyme  69.69 
 
 		 287 aa  416  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.387597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2401  radical SAM domain-containing protein  52.07 
 
 		 298 aa  308  6.999999999999999e-83  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.312992  unclonable  0.00000836266 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2061  Radical SAM domain protein  51.03 
 
 		 298 aa  307  1.0000000000000001e-82  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000000288905 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2284  radical SAM domain-containing protein  50.69 
 
 		 298 aa  308  1.0000000000000001e-82  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00260507  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2408  radical activating enzyme  51.05 
 
 		 286 aa  306  3e-82  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0267  putative pyruvate formate lyase activating enzyme  51.03 
 
 		 298 aa  306  3e-82  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0149457 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2065  radical SAM domain-containing protein  50 
 
 		 300 aa  301  9e-81  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1084  putative 4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  47.22 
 
 		 303 aa  291  9e-78  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3944  radical SAM domain-containing protein  46.9 
 
 		 292 aa  290  2e-77  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0270  radical SAM domain-containing protein  46.39 
 
 		 292 aa  289  4e-77  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000473608 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003579  radical activating enzyme  48 
 
 		 293 aa  278  8e-74  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1984  radical SAM domain-containing protein  43.26 
 
 		 320 aa  278  9e-74  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.450438  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02539  hypothetical protein  43.4 
 
 		 236 aa  191  1e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0135  (Formate-C-acetyltransferase)-activating enzyme  37.05 
 
 		 294 aa  185  7e-46  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.957254 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1777  (Formate-C-acetyltransferase)-activating enzyme  36.26 
 
 		 279 aa  185  9e-46  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000493175  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1578  radical SAM family protein  39.83 
 
 		 280 aa  176  4e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0641  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  35.82 
 
 		 273 aa  176  5e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0637  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  39.23 
 
 		 273 aa  174  1.9999999999999998e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.581706  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1874  radical SAM domain-containing protein  37.12 
 
 		 241 aa  155  1e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3258  glycyl-radical enzyme activating protein family  27.38 
 
 		 303 aa  124  2e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.807185  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2477  glycyl-radical enzyme activating protein family  29.88 
 
 		 310 aa  121  9.999999999999999e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.731109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2365  glycyl-radical enzyme activating protein family  29.69 
 
 		 306 aa  110  4.0000000000000004e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000514278  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0980  glycyl-radical activating family protein  31.8 
 
 		 297 aa  105  6e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.131362 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2192  glycyl-radical activating family protein  28.68 
 
 		 307 aa  103  3e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0513  pyruvate formate-lyase-activating enzyme  29.5 
 
 		 243 aa  103  3e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0482  pyruvate formate-lyase-activating enzyme  29.93 
 
 		 243 aa  103  4e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0510  pyruvate formate-lyase-activating enzyme  29.93 
 
 		 243 aa  103  4e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0491  pyruvate formate-lyase-activating enzyme  29.93 
 
 		 243 aa  103  4e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2966  glycyl-radical activating family protein  29.34 
 
 		 297 aa  102  6e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2752  glycyl-radical activating family protein  27.06 
 
 		 310 aa  102  8e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0425  formate acetyltransferase activating enzyme (pyruvate formate-lyase activating enzyme)  29.93 
 
 		 243 aa  101  1e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0421  formate acetyltransferase activating enzyme (pyruvate formate-lyase activating enzyme)  29.93 
 
 		 243 aa  101  1e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3391  pyruvate formate-lyase activating enzyme  29.59 
 
 		 249 aa  101  1e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4810  pyruvate formate-lyase-activating enzyme  29.78 
 
 		 243 aa  102  1e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0564  pyruvate formate-lyase-activating enzyme  29.93 
 
 		 243 aa  101  2e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0566  pyruvate formate-lyase-activating enzyme  29.93 
 
 		 243 aa  101  2e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2102  pyruvate formate-lyase-activating enzyme, putative  29.71 
 
 		 298 aa  99.8  4e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.510382  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0168  glycyl-radical enzyme activating protein family  27 
 
 		 303 aa  99.4  5e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.465492  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1605  pyruvate-formate lyase activating enzyme  29.17 
 
 		 266 aa  99.8  5e-20  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0427  pyruvate formate-lyase activating enzyme  30.26 
 
 		 243 aa  99.4  6e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0432  pyruvate formate-lyase activating enzyme  29.17 
 
 		 243 aa  98.2  2e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1247  glycyl-radical enzyme activating protein family  25.29 
 
 		 299 aa  94  2e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3054  radical-activating enzyme  28 
 
 		 302 aa  94  3e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.969131  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2500  glycyl-radical enzyme activating protein family  29.52 
 
 		 294 aa  92.8  6e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1999  pyruvate-formate lyase activating enzyme  28.9 
 
 		 263 aa  92.4  7e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.637211  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3704  glycyl-radical enzyme activating protein family  24.91 
 
 		 304 aa  91.3  1e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4091  glycyl-radical enzyme activating protein family  28.17 
 
 		 305 aa  92  1e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0207  glycyl-radical activating family protein  28.79 
 
 		 306 aa  91.3  1e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1073  glycyl-radical enzyme activating protein family  22.58 
 
 		 298 aa  91.7  1e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.949815  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3715  glycyl-radical enzyme activating protein family  27.91 
 
 		 316 aa  90.5  3e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1438  glycyl-radical enzyme activating protein family  28.46 
 
 		 301 aa  90.5  3e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17450  glycyl-radical enzyme activator family protein  25.51 
 
 		 311 aa  90.1  4e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.478583  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1396  glycerol dehydratase activating enzyme  27.89 
 
 		 322 aa  89.4  6e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.214688  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0506  pyruvate formate-lyase activating enzyme  25.28 
 
 		 238 aa  88.6  1e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0339577  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1542  pyruvate formate-lyase activating enzyme  30.08 
 
 		 259 aa  87.8  2e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00863407  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2820  pyruvate formate-lyase activating enzyme  28.4 
 
 		 250 aa  87  3e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000272816  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3544  glycyl-radical enzyme activating protein family  27.95 
 
 		 316 aa  87  3e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23160  pyruvate formate-lyase activating enzyme  23.9 
 
 		 247 aa  85.5  0.000000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1176  glycyl-radical activating protein  26.95 
 
 		 306 aa  84.3  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0367  glycyl-radical enzyme activating protein family  23.71 
 
 		 310 aa  84.3  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3308  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  25.97 
 
 		 246 aa  83.6  0.000000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.760643  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2581  pyruvate formate-lyase activating enzyme  27.49 
 
 		 240 aa  83.6  0.000000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2474  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  26.97 
 
 		 245 aa  83.2  0.000000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1418  glycyl-radical activating family protein  27.24 
 
 		 315 aa  82  0.000000000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1272  radical-activating enzyme  27.2 
 
 		 309 aa  82.4  0.000000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2391  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  27.97 
 
 		 246 aa  82.4  0.000000000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.227753  normal  0.208715 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0038  pyruvate formate-lyase activating enzyme  25.83 
 
 		 229 aa  82  0.000000000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1049  pyruvate formate lyase activating enzyme  26.14 
 
 		 246 aa  80.1  0.00000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1435  glycyl-radical enzyme activating protein family  29 
 
 		 312 aa  79.3  0.00000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1707  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  26.05 
 
 		 246 aa  79  0.00000000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0231805 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1493  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  26.22 
 
 		 246 aa  78.6  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0621061  normal  0.601453 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1497  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  25.52 
 
 		 246 aa  78.6  0.0000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2426  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  26.45 
 
 		 255 aa  78.6  0.0000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0764987  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2913  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  25.71 
 
 		 246 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1560  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  25.84 
 
 		 246 aa  77.8  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0861855  normal  0.127939 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2379  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  24.48 
 
 		 246 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0648375  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2365  pyruvate formate-lyase-activating enzyme  26.89 
 
 		 251 aa  77.4  0.0000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3281  radical-activating enzyme  25.7 
 
 		 320 aa  77  0.0000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1554  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  25.47 
 
 		 246 aa  77  0.0000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.202343 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00906  pyruvate formate lyase activating enzyme 1  26.54 
 
 		 246 aa  76.6  0.0000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.84876  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1063  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  26.54 
 
 		 246 aa  76.6  0.0000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00913  hypothetical protein  26.54 
 
 		 246 aa  76.6  0.0000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.880778  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1671  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  25.84 
 
 		 246 aa  76.6  0.0000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0803873  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0980  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  26.54 
 
 		 265 aa  76.6  0.0000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.777271  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2219  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  26.54 
 
 		 246 aa  76.6  0.0000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.542279 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2694  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  26.54 
 
 		 246 aa  76.6  0.0000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.489101 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>