65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcHS_A3922 on replicon NC_009800
Organism: Escherichia coli HS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001637  EcDH1_4259  tryptophanase  99.79 
 
 		 471 aa  980    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1117  tryptophanase  84.89 
 
 		 472 aa  848    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3922  tryptophanase  100 
 
 		 471 aa  982    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4217  tryptophanase  99.79 
 
 		 471 aa  980    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.770521  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03592  tryptophanase/L-cysteine desulfhydrase, PLP-dependent  99.79 
 
 		 471 aa  980    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0801  tryptophanase  88.11 
 
 		 471 aa  874    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.000525745  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4286  tryptophanase  99.79 
 
 		 471 aa  980    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4075  tryptophanase  99.58 
 
 		 471 aa  978    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.420944  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4214  tryptophanase  99.58 
 
 		 471 aa  977    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5139  tryptophanase  99.58 
 
 		 471 aa  978    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.685998  normal  0.24086 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03536  hypothetical protein  99.79 
 
 		 471 aa  980    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0626  tryptophanase  58 
 
 		 466 aa  543  1e-153  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.287834  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0587  tryptophanase  57.36 
 
 		 466 aa  540  9.999999999999999e-153  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000805  tryptophanase  56.93 
 
 		 466 aa  536  1e-151  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0147193  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06709  tryptophanase  56.5 
 
 		 477 aa  535  1e-151  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3916  tryptophanase  55.01 
 
 		 465 aa  529  1e-149  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20900  tryptophanase  54.41 
 
 		 462 aa  512  1e-144  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1032  tryptophanase  54.58 
 
 		 462 aa  511  1e-143  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2460  tryptophanase  53.23 
 
 		 473 aa  489  1e-137  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000212523  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0309  tryptophanase  52.26 
 
 		 461 aa  489  1e-137  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2018  tryptophanase  54.09 
 
 		 462 aa  491  1e-137  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1324  tryptophanase  48.62 
 
 		 462 aa  451  1e-125  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0251  tryptophanase  48.5 
 
 		 459 aa  443  1e-123  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.0000036462  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1802  tyrosine phenol-lyase  46.98 
 
 		 458 aa  431  1e-119  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.106432  hitchhiker  0.00367591 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1723  tyrosine phenol-lyase  47.2 
 
 		 457 aa  429  1e-119  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2022  tryptophanase  47.2 
 
 		 462 aa  427  1e-118  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4875  tryptophanase  43.75 
 
 		 469 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.914376 
 
 
-
 
NC_002950  PG1401  tryptophanase  45.92 
 
 		 459 aa  415  9.999999999999999e-116  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.331984 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1118  tyrosine phenol-lyase  44.59 
 
 		 459 aa  406  1.0000000000000001e-112  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0866  tyrosine phenol-lyase  45.3 
 
 		 471 aa  403  1e-111  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000757235 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3931  tryptophanase  45.12 
 
 		 458 aa  404  1e-111  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0694288  normal  0.220005 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1948  Tryptophanase  45.47 
 
 		 455 aa  397  1e-109  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0320  tyrosine phenol-lyase  44.44 
 
 		 471 aa  392  1e-108  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.666084  normal  0.0468502 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3438  tyrosine phenol-lyase  45.26 
 
 		 474 aa  392  1e-108  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00561885  normal  0.374113 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0829  Tryptophanase  41.15 
 
 		 464 aa  384  1e-105  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.486815  normal  0.682269 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2475  tryptophanase  42.09 
 
 		 456 aa  379  1e-104  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_49505  predicted protein  42 
 
 		 456 aa  380  1e-104  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0369192  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0642  Tryptophanase  44.35 
 
 		 464 aa  376  1e-103  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1760  tryptophanase  40.91 
 
 		 456 aa  369  1e-101  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.637839  normal  0.596777 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1624  tryptophanase  41.03 
 
 		 462 aa  358  8e-98  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0018  Tryptophanase  40.69 
 
 		 450 aa  354  2e-96  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1937  Tryptophanase  40.95 
 
 		 450 aa  353  2.9999999999999997e-96  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.771016  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37510  tryptophanase  38.33 
 
 		 460 aa  333  5e-90  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.17665  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0932  tryptophanase  36.54 
 
 		 479 aa  303  4.0000000000000003e-81  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000308736  hitchhiker  0.000000000350683 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4083  tryptophanase  36.64 
 
 		 482 aa  291  2e-77  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.450224  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0376  tryptophanase  34.49 
 
 		 489 aa  290  3e-77  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.220464 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3423  tryptophanase  36.64 
 
 		 482 aa  286  4e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.592416  normal  0.470298 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1995  tryptophanase  34.54 
 
 		 487 aa  285  9e-76  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.383478  normal  0.337663 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1966  tryptophanase  35.56 
 
 		 482 aa  285  2.0000000000000002e-75  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.258492  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3640  tryptophanase  33.41 
 
 		 481 aa  280  6e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2787  tryptophanase  34.91 
 
 		 482 aa  270  4e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.163221  normal  0.437741 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1789  tryptophanase  33.62 
 
 		 482 aa  258  1e-67  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1130  putative polyketide synthase PksL  26.18 
 
 		 2726 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0170  polyketide synthase  26.18 
 
 		 2653 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2618  OnnB  25.91 
 
 		 4539 aa  77  0.0000000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1478  polyketide synthase, type I  25.91 
 
 		 4614 aa  76.6  0.0000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1393  polyketide synthase, type I  25.91 
 
 		 4555 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0002  putative polyketide synthase  23.06 
 
 		 1557 aa  70.9  0.00000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1481  polyketide synthase  23.58 
 
 		 1558 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.457199  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2598  KR domain protein  27.75 
 
 		 7149 aa  68.6  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1396  polyketide synthase, type I  23.58 
 
 		 1563 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0206  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  23.32 
 
 		 345 aa  52.4  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0449  Threonine aldolase  23.33 
 
 		 343 aa  48.5  0.0002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000078963  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1039  threonine aldolase  23.3 
 
 		 343 aa  43.9  0.006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1081  threonine aldolase  23.3 
 
 		 343 aa  43.9  0.006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>