29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_2936 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_2936  hypothetical protein  100 
 
 		 677 aa  1397    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.771094 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0987  hypothetical protein  25.9 
 
 		 704 aa  153  8.999999999999999e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1071  hypothetical protein  22.95 
 
 		 657 aa  139  1e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2232  hypothetical protein  34.13 
 
 		 261 aa  130  6e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4618  hypothetical protein  23.13 
 
 		 730 aa  116  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.128897  hitchhiker  0.000000815627 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0285  hypothetical protein  22.76 
 
 		 739 aa  110  7.000000000000001e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6042  methyl-accepting chemotaxis protein  23.96 
 
 		 708 aa  105  4e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003239  hypothetical protein  20.39 
 
 		 706 aa  99.8  2e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3785  hypothetical protein  23.63 
 
 		 696 aa  98.6  3e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.546108 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1362  hypothetical protein  19.64 
 
 		 706 aa  90.5  8e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3304  hypothetical protein  26.62 
 
 		 685 aa  90.5  1e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.132178  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0953  hypothetical protein  21.5 
 
 		 688 aa  84.7  0.000000000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000473513 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4267  hypothetical protein  23.53 
 
 		 816 aa  84.3  0.000000000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.234746  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4824  hypothetical protein  22.29 
 
 		 550 aa  72  0.00000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5803  hypothetical protein  22.29 
 
 		 550 aa  72  0.00000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.485501  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3888  hypothetical protein  22.08 
 
 		 550 aa  70.5  0.0000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1007  hypothetical protein  20.68 
 
 		 666 aa  57.8  0.0000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0504  hypothetical protein  35.82 
 
 		 723 aa  50.4  0.00009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3879  hypothetical protein  48.44 
 
 		 456 aa  50.8  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3414  hypothetical protein  22.17 
 
 		 454 aa  50.1  0.0001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.951584 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0451  hypothetical protein  39.71 
 
 		 589 aa  50.1  0.0001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.163567  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1501  hypothetical protein  27.78 
 
 		 367 aa  49.3  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1706  hypothetical protein  20.82 
 
 		 563 aa  49.3  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0996  chromosome segregation ATPases-like protein  27.5 
 
 		 1787 aa  48.5  0.0004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.75117  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4901  hypothetical protein  25 
 
 		 257 aa  47.8  0.0006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.310671  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4588  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  19.52 
 
 		 667 aa  47.8  0.0007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4289  hypothetical protein  35.62 
 
 		 549 aa  47  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.910751  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1849  hypothetical protein  27.97 
 
 		 524 aa  47  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.677137  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6067  hypothetical protein  31.07 
 
 		 3296 aa  43.9  0.01  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>