23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_1007 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_1007  hypothetical protein  100 
 
 		 666 aa  1356    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0953  hypothetical protein  29.66 
 
 		 688 aa  309  1.0000000000000001e-82  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000473513 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4588  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.65 
 
 		 667 aa  309  1.0000000000000001e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4618  hypothetical protein  28.35 
 
 		 730 aa  290  6e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.128897  hitchhiker  0.000000815627 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0285  hypothetical protein  29.08 
 
 		 739 aa  289  1e-76  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4267  hypothetical protein  32.26 
 
 		 816 aa  240  6.999999999999999e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.234746  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0996  chromosome segregation ATPases-like protein  40 
 
 		 1787 aa  120  7.999999999999999e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.75117  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003239  hypothetical protein  23.92 
 
 		 706 aa  88.6  3e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1362  hypothetical protein  26.2 
 
 		 706 aa  86.3  0.000000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2936  hypothetical protein  21.7 
 
 		 677 aa  85.5  0.000000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.771094 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3785  hypothetical protein  23.16 
 
 		 696 aa  75.5  0.000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.546108 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6042  methyl-accepting chemotaxis protein  20.49 
 
 		 708 aa  68.9  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3304  hypothetical protein  22.83 
 
 		 685 aa  64.3  0.000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.132178  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3879  hypothetical protein  23.26 
 
 		 456 aa  63.2  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0008  hypothetical protein  27.27 
 
 		 520 aa  50.4  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.556224  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1071  hypothetical protein  19.35 
 
 		 657 aa  48.5  0.0003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0451  hypothetical protein  32.86 
 
 		 589 aa  48.9  0.0003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.163567  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0987  hypothetical protein  19.72 
 
 		 704 aa  48.5  0.0004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0150  Apolipoprotein A1/A4/E  21.54 
 
 		 7659 aa  47.8  0.0006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4824  hypothetical protein  20.35 
 
 		 550 aa  45.1  0.005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0320  hypothetical protein  22.82 
 
 		 488 aa  45.1  0.005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3414  hypothetical protein  18.41 
 
 		 454 aa  44.3  0.008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.951584 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3888  hypothetical protein  18.98 
 
 		 550 aa  43.9  0.01  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>