16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_3304 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_3304  hypothetical protein  100 
 
 		 685 aa  1323    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.132178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0987  hypothetical protein  25.6 
 
 		 704 aa  106  2e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2936  hypothetical protein  22.34 
 
 		 677 aa  103  1e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.771094 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1071  hypothetical protein  22.2 
 
 		 657 aa  82.4  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4618  hypothetical protein  25.81 
 
 		 730 aa  64.7  0.000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.128897  hitchhiker  0.000000815627 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0285  hypothetical protein  25.81 
 
 		 739 aa  61.6  0.00000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0953  hypothetical protein  30.72 
 
 		 688 aa  57.8  0.0000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000473513 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6042  methyl-accepting chemotaxis protein  21.5 
 
 		 708 aa  57  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3785  hypothetical protein  20.73 
 
 		 696 aa  55.5  0.000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.546108 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4267  hypothetical protein  23.94 
 
 		 816 aa  55.1  0.000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.234746  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1007  hypothetical protein  22.27 
 
 		 666 aa  51.6  0.00005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003239  hypothetical protein  24.51 
 
 		 706 aa  50.1  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2247  hypothetical protein  30.2 
 
 		 1705 aa  48.1  0.0005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0996  chromosome segregation ATPases-like protein  27.91 
 
 		 1787 aa  48.1  0.0006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.75117  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2232  hypothetical protein  28.06 
 
 		 261 aa  47.8  0.0006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1362  hypothetical protein  26.01 
 
 		 706 aa  46.2  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>