21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpl1071 on replicon NC_006369
Organism: Legionella pneumophila str. Lens



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006369  lpl1071  hypothetical protein  100 
 
 
657 aa  1328    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2936  hypothetical protein  22.99 
 
 
677 aa  137  4e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.771094 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0987  hypothetical protein  20.62 
 
 
704 aa  127  5e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2232  hypothetical protein  26.89 
 
 
261 aa  77.8  0.0000000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3304  hypothetical protein  24.19 
 
 
685 aa  72.4  0.00000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.132178  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4618  hypothetical protein  19.62 
 
 
730 aa  71.6  0.00000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.128897  hitchhiker  0.000000815627 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003239  hypothetical protein  25 
 
 
706 aa  59.7  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4588  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  19.13 
 
 
667 aa  59.7  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0285  hypothetical protein  21.62 
 
 
739 aa  57  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0996  hypothetical protein  22.17 
 
 
869 aa  55.1  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1362  hypothetical protein  23.38 
 
 
706 aa  52.8  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2247  hypothetical protein  22.78 
 
 
1705 aa  52.8  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0953  hypothetical protein  19.38 
 
 
688 aa  52.4  0.00003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  unclonable  0.0000473513 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3785  hypothetical protein  19.87 
 
 
696 aa  51.6  0.00005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.546108 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4901  hypothetical protein  23.08 
 
 
257 aa  50.8  0.00007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.310671  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4267  hypothetical protein  19.6 
 
 
816 aa  47.4  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.234746  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5395  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  22.43 
 
 
558 aa  47  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.517537 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0549  hypothetical protein  22.67 
 
 
767 aa  45.8  0.002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3594  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  24.68 
 
 
646 aa  46.2  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1852  chromosome segregation ATPase-like protein  20.45 
 
 
380 aa  45.8  0.003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.518823  normal  0.814209 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2214  Protein of unknown function DUF1626  21.92 
 
 
324 aa  43.9  0.01  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.346071  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>