19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_2232 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008639  Cpha266_2232  hypothetical protein  100 
 
 
261 aa  531  1e-150  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2936  hypothetical protein  35.4 
 
 
677 aa  132  6.999999999999999e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.771094 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1071  hypothetical protein  26.89 
 
 
657 aa  83.2  0.000000000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0987  hypothetical protein  25.87 
 
 
704 aa  70.1  0.00000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1362  hypothetical protein  28.24 
 
 
706 aa  67.8  0.0000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003239  hypothetical protein  26.14 
 
 
706 aa  67.4  0.0000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6042  methyl-accepting chemotaxis protein  29.37 
 
 
708 aa  57  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3304  hypothetical protein  28.06 
 
 
685 aa  56.6  0.0000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.132178  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3785  hypothetical protein  28.18 
 
 
696 aa  54.7  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.546108 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0953  hypothetical protein  30.33 
 
 
688 aa  53.5  0.000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  unclonable  0.0000473513 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0996  chromosome segregation ATPases-like protein  34.02 
 
 
1787 aa  50.8  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.75117  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4618  hypothetical protein  28.99 
 
 
730 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.128897  hitchhiker  0.000000815627 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3414  hypothetical protein  37.5 
 
 
454 aa  47.8  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.951584 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3879  hypothetical protein  30.14 
 
 
456 aa  46.2  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2247  hypothetical protein  22.36 
 
 
1705 aa  46.2  0.0005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0285  hypothetical protein  30.26 
 
 
739 aa  44.3  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4588  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.72 
 
 
667 aa  44.3  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1501  hypothetical protein  42.65 
 
 
367 aa  43.1  0.004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4289  hypothetical protein  26 
 
 
549 aa  42.4  0.009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.910751  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>