128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_1615 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_1615  glycosyl transferase family protein  100 
 
 		 411 aa  821    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.395155  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0299  glycosyl transferase family 9  61.43 
 
 		 463 aa  523  1e-147  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.155014 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2022  heptosyltransferase family protein  54.48 
 
 		 432 aa  438  9.999999999999999e-123  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.259554  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0962  heptosyltransferase family protein  48.95 
 
 		 429 aa  362  8e-99  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.858852  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1747  glycosyl transferase family 9  46.13 
 
 		 420 aa  305  1.0000000000000001e-81  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0690  glycosyl transferase family 9  30.81 
 
 		 511 aa  99.4  1e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.379313  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3025  heptosyltransferase family protein  27.07 
 
 		 517 aa  79.3  0.0000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2523  glycosyl transferase family protein  40.16 
 
 		 549 aa  73.2  0.000000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.0027494  normal  0.0392835 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0312  glycosyl transferase family 9  28.23 
 
 		 574 aa  70.1  0.00000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0565  heptosyltransferase family protein  27.01 
 
 		 543 aa  66.6  0.0000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.432833  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0145  glycosyl transferase family 9  31.65 
 
 		 334 aa  62  0.00000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0787699  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0100  glycosyl transferase family 9  27.81 
 
 		 462 aa  61.6  0.00000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1411  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  32.69 
 
 		 299 aa  61.2  0.00000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0320  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  36.75 
 
 		 356 aa  60.8  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.614919  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1547  glycosyl transferase family 9  42.17 
 
 		 585 aa  60.5  0.00000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.796165 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3215  glycosyl transferase family protein  42.99 
 
 		 347 aa  59.7  0.00000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1714  heptosyltransferase family protein  33.09 
 
 		 473 aa  58.5  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1258  glycosyl transferase family 9  26.13 
 
 		 471 aa  57  0.0000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4678  heptosyl transferase glycosyltransferase family 9 protein  29.17 
 
 		 347 aa  55.1  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2792  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  32.84 
 
 		 362 aa  55.1  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0445733  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44860  lipopolysaccharide heptosyltransferase II- LPS biosynthesis, waaF  30.94 
 
 		 349 aa  55.1  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.57864  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2616  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  28.91 
 
 		 346 aa  55.1  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0106  glycosyl transferase family 9  22.31 
 
 		 332 aa  55.5  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00331411  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1633  glycosyl transferase family protein  28.45 
 
 		 467 aa  54.7  0.000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0062  glycosyl transferase family protein  27.71 
 
 		 354 aa  54.7  0.000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.982764  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1805  glycosyl transferase family 9  28.07 
 
 		 308 aa  54.7  0.000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3897  glycosyl transferase family protein  30.22 
 
 		 347 aa  54.3  0.000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1796  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  31.75 
 
 		 314 aa  53.9  0.000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0153252 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1226  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  25.66 
 
 		 304 aa  53.5  0.000006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  1.56987e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0357  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  36.13 
 
 		 324 aa  53.5  0.000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0363758  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4281  glycosyl transferase family 9  30.22 
 
 		 347 aa  53.1  0.000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000734262 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0341  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  31.11 
 
 		 349 aa  53.1  0.000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.455159  normal  0.818708 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0520  glycosyl transferase family protein  32.14 
 
 		 344 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0112  heptosyltransferase  27.27 
 
 		 335 aa  52.8  0.00001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4862  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  30.37 
 
 		 349 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.470567 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0772  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  32.2 
 
 		 359 aa  52.8  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1571  glycosyl transferase family 9  31.03 
 
 		 338 aa  52  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0153093 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2514  glycosyl transferase family protein  26.11 
 
 		 333 aa  52.4  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.566705  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4336  glycosyl transferase family protein  29.5 
 
 		 347 aa  52  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0369  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  31.11 
 
 		 349 aa  52.4  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.489126 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5003  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  30.23 
 
 		 344 aa  51.6  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4735  glycosyl transferase family protein  31.06 
 
 		 404 aa  51.6  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.96684 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00680  ADP-heptose-LPS heptosyltransferase II  26.19 
 
 		 352 aa  51.2  0.00003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1197  glycosyl transferase family protein  26.27 
 
 		 323 aa  51.6  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1237  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  28.21 
 
 		 314 aa  50.8  0.00004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0479  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  30.84 
 
 		 317 aa  50.8  0.00004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4476  glycosyl transferase family protein  27.54 
 
 		 347 aa  50.8  0.00004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.647779 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1263  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  28.48 
 
 		 343 aa  50.1  0.00007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0508  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  29.85 
 
 		 317 aa  50.1  0.00007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.104736  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001794  ADP-heptose--lipooligosaccharide heptosyltransferase II  27.35 
 
 		 352 aa  49.7  0.00009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.578647  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0860  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  36.54 
 
 		 339 aa  49.7  0.00009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0851  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  33.7 
 
 		 346 aa  49.7  0.00009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0684  putative ADP-heptose--LPS heptosyltransferaseii  29.2 
 
 		 341 aa  48.9  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.182742 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3611  glycosyl transferase family protein  40 
 
 		 348 aa  49.3  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0375  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  31.45 
 
 		 362 aa  49.3  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.66681 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0149  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  28.47 
 
 		 341 aa  49.3  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0715  glycosyl transferase family protein  32.14 
 
 		 344 aa  48.5  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0294212  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0366  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  30.37 
 
 		 349 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0111  glycosyl transferase family protein  33.63 
 
 		 359 aa  48.5  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0552  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  30 
 
 		 516 aa  48.9  0.0002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0579  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  29.2 
 
 		 347 aa  48.1  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0417722 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2606  lipopolysaccharide biosynthesis protein  29.53 
 
 		 357 aa  48.1  0.0003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.21938  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0454  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  26.74 
 
 		 341 aa  47.8  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.788826  normal  0.709845 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3282  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  28.47 
 
 		 341 aa  47.8  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0545  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  27 
 
 		 340 aa  47.4  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.0086605  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0156  glycosyl transferase family 9  26.42 
 
 		 334 aa  47.4  0.0005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0639777  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0507  glycosyl transferase family protein  29.32 
 
 		 406 aa  46.6  0.0007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0070  glycosyl transferase family protein  29.37 
 
 		 347 aa  46.6  0.0007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00130455 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5747  heptosyltransferase II  29.2 
 
 		 345 aa  46.6  0.0008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0582  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  22.79 
 
 		 325 aa  45.8  0.001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.000000000638797  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0009  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  31.3 
 
 		 349 aa  46.2  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3896  glycosyl transferase family protein  28.57 
 
 		 340 aa  46.6  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0377  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  29.63 
 
 		 352 aa  45.8  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.644029 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4100  glycosyl transferase family protein  28.57 
 
 		 340 aa  45.8  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.240394 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0102  glycosyl transferase family protein  32.74 
 
 		 350 aa  46.2  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000136303 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0828  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  28.36 
 
 		 346 aa  46.2  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0249  glycosyl transferase family 9  32.5 
 
 		 521 aa  45.1  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0328352 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5964  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  28.36 
 
 		 329 aa  45.4  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.262349 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0205  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  31.75 
 
 		 331 aa  45.1  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1612  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  32 
 
 		 346 aa  45.1  0.002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3988  glycosyl transferase family protein  28.57 
 
 		 340 aa  45.8  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0634164 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66250  heptosyltransferase II  29.2 
 
 		 345 aa  45.8  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2239  glycosyl transferase family protein  26.6 
 
 		 431 aa  45.1  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0334  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  27.12 
 
 		 343 aa  45.4  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3149  glycosyl transferase family protein  30.59 
 
 		 366 aa  45.4  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4830  glycosyl transferase family protein  29.7 
 
 		 363 aa  45.4  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.244067  hitchhiker  0.0000484932 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0148  glycosyl transferase family 9  28.11 
 
 		 348 aa  45.1  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0486  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  24.86 
 
 		 341 aa  45.4  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.109958  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0800  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  28.57 
 
 		 353 aa  45.1  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00062  putative ADP-heptose:LPS heptosyltransferase  28.87 
 
 		 334 aa  45.1  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0161  ADP-heptose-LPS heptosyltransferase II  26.72 
 
 		 356 aa  44.7  0.003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0262  ADP-heptose-LPS heptosyltransferase II  26.72 
 
 		 356 aa  44.7  0.003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1629  heptosyltransferase family protein  32.58 
 
 		 341 aa  44.7  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2642  family 9 glycosyl transferase  33.33 
 
 		 343 aa  44.7  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0491  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  25.41 
 
 		 354 aa  44.7  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.287096 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2022  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  28.36 
 
 		 345 aa  44.7  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2680  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  28.36 
 
 		 329 aa  44.7  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.196159  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2633  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  28.36 
 
 		 345 aa  44.7  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.609317  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1695  glycosyl transferase family protein  32.53 
 
 		 336 aa  44.7  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2662  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  28.36 
 
 		 329 aa  44.7  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.879845  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>