More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_0225 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_0225  ABC transporter related  100 
 
 		 349 aa  711    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.676299  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0655  ABC transporter related  84.2 
 
 		 350 aa  585  1e-166  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.22105 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2660  ABC transporter related  56.2 
 
 		 346 aa  364  1e-99  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0625705  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3307  ABC transporter related  56.2 
 
 		 346 aa  363  2e-99  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5307  ABC transporter related  56.41 
 
 		 355 aa  357  1.9999999999999998e-97  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.853728 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3217  ABC transporter related  50.44 
 
 		 356 aa  330  2e-89  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.257824  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0854  ABC transporter related  47.01 
 
 		 340 aa  322  6e-87  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.627153 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1098  ABC transporter related  47.84 
 
 		 352 aa  320  1.9999999999999998e-86  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0603  putative glycerol-3-phosphate ABC transporter, ATP-binding protein  47.43 
 
 		 365 aa  319  3.9999999999999996e-86  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1537  ABC transporter related  45.76 
 
 		 355 aa  319  5e-86  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0442847  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0477  glycerol-3-phosphate ABC transporter ATP-binding protein  47.43 
 
 		 376 aa  318  6e-86  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0622  putative glycerol-3-phosphate ABC transporter, ATP-binding protein  47.14 
 
 		 365 aa  318  6e-86  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3878  ABC transporter related protein  44.2 
 
 		 382 aa  318  7e-86  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0535  glycerol-3-phosphate ABC transporter ATP-binding protein  47.14 
 
 		 376 aa  318  1e-85  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0566  glycerol-3-phosphate ABC transporter ATP-binding protein  47.14 
 
 		 376 aa  318  1e-85  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0142  ABC transporter related  44.88 
 
 		 363 aa  318  1e-85  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1586  ABC transporter related  45.2 
 
 		 355 aa  317  1e-85  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0480  ABC transporter related  47.43 
 
 		 365 aa  317  2e-85  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4137  ABC transporter related  47.29 
 
 		 335 aa  316  4e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4736  putative glycerol-3-phosphate ABC transporter, ATP-binding protein  47.14 
 
 		 365 aa  316  5e-85  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.925673  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0479  glycerol-3-phosphate ABC transporter ATP-binding protein  47.14 
 
 		 376 aa  315  7e-85  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1262  ABC transporter related  48.56 
 
 		 357 aa  315  8e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0697  putative glycerol-3-phosphate ABC transporter, ATP-binding protein  46.86 
 
 		 365 aa  315  9e-85  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1165  ABC transporter related  47.08 
 
 		 363 aa  315  9e-85  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.191612  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1641  ABC transporter related  49.28 
 
 		 353 aa  315  9.999999999999999e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0717047  normal  0.0310282 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3943  ABC transporter related  47.25 
 
 		 403 aa  314  9.999999999999999e-85  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.39994  normal  0.0172807 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3287  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  46.42 
 
 		 349 aa  313  1.9999999999999998e-84  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.241244  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0859  ABC transporter related  47.58 
 
 		 335 aa  313  1.9999999999999998e-84  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.928128 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3282  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  46.13 
 
 		 349 aa  313  2.9999999999999996e-84  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.434692  normal  0.636051 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4034  ABC sugar transporter, ATPase subunit  48.28 
 
 		 352 aa  312  3.9999999999999997e-84  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0788  ABC transporter related  47.58 
 
 		 335 aa  312  3.9999999999999997e-84  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0629  glycerol-3-phosphate ABC transporter, ATP-binding protein, putative  46.48 
 
 		 376 aa  312  4.999999999999999e-84  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2417  ABC transporter related  47.75 
 
 		 350 aa  312  5.999999999999999e-84  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.830263  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2462  ABC transporter related  47.75 
 
 		 350 aa  312  5.999999999999999e-84  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2456  ABC transporter related  47.75 
 
 		 350 aa  312  5.999999999999999e-84  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.913422  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0916  ABC transporter related  47.47 
 
 		 358 aa  311  1e-83  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0452434 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0894  ABC transporter related  45.48 
 
 		 370 aa  310  2e-83  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0973  ABC transporter related protein  46.65 
 
 		 364 aa  310  2.9999999999999997e-83  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1389  ABC transporter related  49.05 
 
 		 368 aa  310  2.9999999999999997e-83  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06399  hypothetical protein  46.31 
 
 		 385 aa  310  2.9999999999999997e-83  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4019  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  45.85 
 
 		 349 aa  310  2.9999999999999997e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0658  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  47.71 
 
 		 351 aa  310  4e-83  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.143884  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2199  ABC transporter related protein  45.6 
 
 		 380 aa  309  5e-83  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1692  ABC transporter-related protein  45.48 
 
 		 355 aa  309  5.9999999999999995e-83  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.291181 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3707  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  48.29 
 
 		 349 aa  308  8e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.151489  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3753  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  46.99 
 
 		 351 aa  308  1.0000000000000001e-82  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1188  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  44.72 
 
 		 365 aa  308  1.0000000000000001e-82  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.27267  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2096  ABC transporter ATP-binding protein  44.97 
 
 		 373 aa  308  1.0000000000000001e-82  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.425612 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2893  ABC transporter related  46.59 
 
 		 353 aa  306  3e-82  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.401174  normal  0.250176 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3427  ABC transporter related  48.09 
 
 		 349 aa  306  3e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3398  ABC transporter related  47.16 
 
 		 357 aa  306  3e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.129757 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1095  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  44.44 
 
 		 365 aa  306  4.0000000000000004e-82  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.107412  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1821  ABC transporter related  44.93 
 
 		 382 aa  306  4.0000000000000004e-82  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3653  ABC transporter-related protein  46.61 
 
 		 338 aa  306  4.0000000000000004e-82  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0855337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4327  ABC transporter related  45.45 
 
 		 355 aa  305  5.0000000000000004e-82  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0513882 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2340  ABC transporter  43.6 
 
 		 369 aa  306  5.0000000000000004e-82  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1878  ABC transporter related  47.21 
 
 		 371 aa  305  5.0000000000000004e-82  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.229415  normal  0.103205 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1424  ABC transporter related protein  45.38 
 
 		 370 aa  305  7e-82  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2621  ABC transporter-related protein  47.04 
 
 		 353 aa  305  7e-82  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.295311  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2049  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  44.81 
 
 		 369 aa  305  8.000000000000001e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4290  ABC transporter related  44.29 
 
 		 360 aa  305  8.000000000000001e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.439892  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4119  ABC transporter related  47.23 
 
 		 338 aa  305  8.000000000000001e-82  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.430229  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1769  ABC transporter related  43.8 
 
 		 366 aa  304  1.0000000000000001e-81  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7210  ABC transporter related  43.85 
 
 		 360 aa  304  1.0000000000000001e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2654  putative maltose/maltodextrin ABC transporter, ATP-binding protein  43.05 
 
 		 369 aa  305  1.0000000000000001e-81  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2845  ABC transporter related  45.45 
 
 		 379 aa  304  1.0000000000000001e-81  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.649643  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1267  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  45.28 
 
 		 365 aa  304  2.0000000000000002e-81  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4268  ABC transporter-related protein  44.6 
 
 		 360 aa  303  2.0000000000000002e-81  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0620  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  47.43 
 
 		 351 aa  303  2.0000000000000002e-81  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2066  ABC transporter related  46.26 
 
 		 349 aa  303  3.0000000000000004e-81  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.626309  normal  0.0289677 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0422  ABC sugar transporter, ATPase subunit  44.13 
 
 		 360 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0546  ABC-type sugar / sn-glycerol-3-phosphate import ATP-binding protein ugpC  47.25 
 
 		 338 aa  303  3.0000000000000004e-81  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3768  ABC transporter related  46.44 
 
 		 351 aa  303  3.0000000000000004e-81  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0254  ABC transporter related  46.05 
 
 		 353 aa  303  4.0000000000000003e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1358  ABC transporter related  46.18 
 
 		 365 aa  303  4.0000000000000003e-81  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.181944 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4055  ABC transporter related  43.7 
 
 		 354 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2583  ABC transporter related  44.99 
 
 		 353 aa  302  5.000000000000001e-81  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0115601  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0274  ABC transporter related  46.01 
 
 		 368 aa  302  5.000000000000001e-81  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.533134 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1284  ABC transporter related  44.35 
 
 		 345 aa  302  6.000000000000001e-81  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0662  ABC transporter related  43.94 
 
 		 366 aa  302  7.000000000000001e-81  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4505  ABC transporter  44.6 
 
 		 368 aa  301  8.000000000000001e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.615344 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4067  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  43.17 
 
 		 366 aa  301  1e-80  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.041099  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4035  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  43.17 
 
 		 366 aa  301  1e-80  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3925  sugar ABC transporter ATP-binding protein  43.17 
 
 		 366 aa  301  1e-80  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0573898  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3757  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  43.17 
 
 		 366 aa  301  1e-80  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.305831  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3773  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  43.17 
 
 		 366 aa  301  1e-80  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0367372  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4232  sugar ABC transporter ATP-binding protein  43.17 
 
 		 366 aa  301  1e-80  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.253901  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0283  ABC transporter related  45.2 
 
 		 353 aa  301  1e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.157903  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5338  ABC transporter related  45.17 
 
 		 355 aa  301  1e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.708738  normal  0.0411085 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6393  ABC transporter related  44.41 
 
 		 355 aa  300  2e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2717  ABC transporter-related protein  42.31 
 
 		 366 aa  300  2e-80  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00458164  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4137  ABC transporter, ATPase subunit  44.63 
 
 		 362 aa  300  2e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2119  ABC transporter related  45.56 
 
 		 355 aa  301  2e-80  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.445034 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5207  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  48.01 
 
 		 348 aa  300  2e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.575313 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4498  ABC transporter related protein  45.73 
 
 		 381 aa  300  2e-80  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0512744  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3126  ABC transporter related  46.59 
 
 		 359 aa  300  2e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12730  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  46.8 
 
 		 361 aa  300  2e-80  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.306152  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3647  ABC transporter related  45.89 
 
 		 355 aa  300  3e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.265226 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0852  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  45.25 
 
 		 351 aa  300  3e-80  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.520251  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4842  ABC transporter related  47.08 
 
 		 332 aa  300  3e-80  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>