67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_3119 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_1835  hypothetical protein  60.47 
 
 		 585 aa  679    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.444431  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3119  protein of unknown function DUF181  100 
 
 		 590 aa  1194    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0048478 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2408  hypothetical protein  54.43 
 
 		 573 aa  575  1.0000000000000001e-163  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.115662  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1064  protein of unknown function DUF181  49.84 
 
 		 604 aa  520  1e-146  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000107969  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0244  protein of unknown function DUF181  42.88 
 
 		 555 aa  396  1e-109  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1373  hypothetical protein  40.56 
 
 		 635 aa  373  1e-102  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000799529  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1333  hypothetical protein  25.95 
 
 		 404 aa  70.9  0.00000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.157946  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3472  hypothetical protein  30.94 
 
 		 389 aa  70.9  0.00000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1978  hypothetical protein  25.73 
 
 		 403 aa  67  0.0000000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.154455  normal  0.549107 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2211  hypothetical protein  26.67 
 
 		 404 aa  66.2  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.471647  normal  0.108179 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1211  methanogenesis marker protein 1  30.87 
 
 		 403 aa  62.8  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.882639 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0821  hypothetical protein  25.07 
 
 		 424 aa  62.4  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6310  protein of unknown function DUF181  25.86 
 
 		 443 aa  62  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1401  hypothetical protein  25.37 
 
 		 403 aa  61.6  0.00000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3967  hypothetical protein  26.16 
 
 		 752 aa  61.2  0.00000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.154728 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4676  protein of unknown function DUF181  25.87 
 
 		 752 aa  60.5  0.00000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0591  NADPH-dependent FMN reductase  22.87 
 
 		 403 aa  58.9  0.0000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0069008  hitchhiker  0.000778526 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0527  hypothetical protein  24.86 
 
 		 406 aa  57.8  0.0000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.518429 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0413  hypothetical protein  23.01 
 
 		 584 aa  57.8  0.0000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4368  hypothetical protein  29.34 
 
 		 727 aa  57  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.150776 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2590  hypothetical protein  29.5 
 
 		 630 aa  56.2  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.188065  normal  0.130609 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4504  hypothetical protein  25.84 
 
 		 745 aa  55.1  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0379  hypothetical protein  24.57 
 
 		 403 aa  55.1  0.000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1788  hypothetical protein  23.27 
 
 		 746 aa  54.3  0.000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3205  protein of unknown function DUF181  29.63 
 
 		 391 aa  54.3  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.687838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0310  hypothetical protein  27.47 
 
 		 400 aa  54.3  0.000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0519  protein of unknown function DUF181  24.29 
 
 		 762 aa  54.3  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5737  protein of unknown function DUF181  23.86 
 
 		 750 aa  53.5  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1241  hypothetical protein  21.18 
 
 		 575 aa  53.1  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0044833  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2957  protein of unknown function DUF181  26.06 
 
 		 410 aa  53.1  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.894577 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1602  methanogenesis marker protein 1  26.29 
 
 		 400 aa  52.8  0.00002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.192531  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0555  hypothetical protein  27.62 
 
 		 657 aa  52.8  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3690  protein of unknown function DUF181  28.21 
 
 		 669 aa  52.8  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4234  hypothetical protein  30 
 
 		 466 aa  52.4  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5136  hypothetical protein  26.11 
 
 		 745 aa  52.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00343987  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5723  hypothetical protein  26.11 
 
 		 745 aa  52.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.250134  normal  0.533402 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0842  hypothetical protein  23.74 
 
 		 404 aa  52  0.00003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0167577  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2348  hypothetical protein  24.14 
 
 		 582 aa  52  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.119117  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2493  hypothetical protein  25.07 
 
 		 763 aa  51.6  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2214  hypothetical protein  25.07 
 
 		 763 aa  51.6  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2355  hypothetical protein  24.06 
 
 		 769 aa  51.6  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.247728  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0537  hypothetical protein  30.17 
 
 		 400 aa  50.8  0.00006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0125337  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0023  hypothetical protein  25.07 
 
 		 716 aa  51.2  0.00006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4207  protein of unknown function DUF181  28.21 
 
 		 628 aa  50.8  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2069  hypothetical protein  23.26 
 
 		 426 aa  50.8  0.00006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2869  hypothetical protein  25.07 
 
 		 763 aa  50.8  0.00006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2237  hypothetical protein  31.01 
 
 		 397 aa  50.8  0.00007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3135  hypothetical protein  26.24 
 
 		 745 aa  50.1  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.535305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0622  hypothetical protein  24.48 
 
 		 769 aa  50.1  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.940579  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0637  YcaO-like fatty acid binding domain-containing protein  24.78 
 
 		 766 aa  49.7  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2435  hypothetical protein  30.13 
 
 		 630 aa  50.1  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0806076  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4992  hypothetical protein  27.35 
 
 		 745 aa  49.3  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.934351  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1415  hypothetical protein  26.61 
 
 		 649 aa  49.7  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0802  AknN  24.78 
 
 		 844 aa  49.3  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.919252  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3864  protein of unknown function DUF181  31.01 
 
 		 566 aa  48.5  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  unclonable  0.000000134117  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2767  protein of unknown function DUF181  25.75 
 
 		 757 aa  48.1  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0128011  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6108  hypothetical protein  28.38 
 
 		 396 aa  48.1  0.0005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.886348  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2261  hypothetical protein  26.88 
 
 		 396 aa  48.1  0.0005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00608727  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0517  hypothetical protein  26.1 
 
 		 756 aa  47.8  0.0006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.11147  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1149  hypothetical protein  25.73 
 
 		 649 aa  47  0.0009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0880  hypothetical protein  25.45 
 
 		 749 aa  46.6  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.541139 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0917  hypothetical protein  26.79 
 
 		 437 aa  45.4  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2583  hypothetical protein  25.85 
 
 		 607 aa  45.4  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.11419 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3696  protein of unknown function DUF181  26.45 
 
 		 644 aa  45.1  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.758721  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1337  hypothetical protein  25.75 
 
 		 649 aa  45.1  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.85919e-19 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1174  hypothetical protein  24.89 
 
 		 649 aa  44.3  0.006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1267  hypothetical protein  24.89 
 
 		 649 aa  44.3  0.006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>