217 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_0926 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_0926  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  100 
 
 
372 aa  741    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.690765 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0773  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  63.87 
 
 
330 aa  422  1e-117  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.437878  normal  0.305357 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2600  lipid-A-disaccharide synthase  50 
 
 
356 aa  332  5e-90  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0347536  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2135  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  47.37 
 
 
353 aa  275  1.0000000000000001e-72  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000208743  normal  0.172594 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3161  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  42.36 
 
 
363 aa  258  8e-68  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3228  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  37.39 
 
 
360 aa  155  1e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2180  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  37.05 
 
 
332 aa  145  9e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25510  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  36.16 
 
 
332 aa  144  3e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.30645  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1900  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  37.74 
 
 
334 aa  138  2e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000723906 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3814  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  37.25 
 
 
333 aa  138  2e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0872881  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1476  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  36.27 
 
 
333 aa  136  7.000000000000001e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.114547  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3845  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  35.62 
 
 
331 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1511  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  36.77 
 
 
336 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1468  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  32.34 
 
 
336 aa  133  5e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1614  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  36.89 
 
 
333 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.188244 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1261  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  34.04 
 
 
357 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0645  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  29.72 
 
 
355 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000349199  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1635  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  35.41 
 
 
331 aa  130  3e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0159123  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1740  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  35.29 
 
 
353 aa  130  3e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1394  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  32.81 
 
 
375 aa  128  1.0000000000000001e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000899686 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4175  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  36.57 
 
 
336 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0829517  normal  0.555265 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1655  tetraacyldisaccharide-1-P 4'-kinase  32.7 
 
 
355 aa  127  3e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.703326  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1587  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  35.85 
 
 
330 aa  127  3e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0463  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  31.66 
 
 
350 aa  127  3e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4719  lipid-A-disaccharide synthase  31.68 
 
 
322 aa  125  8.000000000000001e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01857  tetraacyldisaccharide 4-kinase  31.66 
 
 
349 aa  125  8.000000000000001e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.223866  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0848  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  35.78 
 
 
348 aa  125  9e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0638  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  31.87 
 
 
357 aa  125  1e-27  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.320872 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0169  tetraacyldisaccharide-1-P 4'-kinase  31.11 
 
 
371 aa  125  1e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3028  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  33.43 
 
 
361 aa  125  1e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1315  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  30.88 
 
 
385 aa  124  2e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2613  lipid-A-disaccharide synthase  37.3 
 
 
378 aa  124  2e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.311438  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0019  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  26.39 
 
 
325 aa  125  2e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1050  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  35.08 
 
 
325 aa  124  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.212598 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0485  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  29.23 
 
 
359 aa  124  3e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0991  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  35.08 
 
 
325 aa  123  4e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1433  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  32.23 
 
 
792 aa  124  4e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01536  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  32.67 
 
 
335 aa  123  5e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1018  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  35.08 
 
 
325 aa  123  6e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.799043 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1083  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  35.08 
 
 
325 aa  123  6e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.252002  normal  0.125044 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0901  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  30.84 
 
 
320 aa  122  9.999999999999999e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0453092  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1099  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  34.75 
 
 
325 aa  121  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1063  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  29.91 
 
 
372 aa  120  3e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003986  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  31.33 
 
 
335 aa  120  3.9999999999999996e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2409  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  33.65 
 
 
328 aa  119  7.999999999999999e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.47014  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3412  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  33.62 
 
 
375 aa  119  7.999999999999999e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1013  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  33.65 
 
 
328 aa  119  9e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00336563  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00919  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  33.65 
 
 
328 aa  119  9.999999999999999e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.226306  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2728  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  33.65 
 
 
328 aa  119  9.999999999999999e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1076  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  33.65 
 
 
328 aa  119  9.999999999999999e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0122696  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00926  hypothetical protein  33.65 
 
 
328 aa  119  9.999999999999999e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.241519  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2205  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  33.65 
 
 
328 aa  119  9.999999999999999e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0766314  normal  0.274166 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2681  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  33.65 
 
 
328 aa  119  9.999999999999999e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.429333 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1022  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  33.65 
 
 
328 aa  119  9.999999999999999e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0136979  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07846  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  30.19 
 
 
334 aa  119  9.999999999999999e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0734  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  29.52 
 
 
335 aa  119  9.999999999999999e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0530  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  33.12 
 
 
346 aa  118  1.9999999999999998e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1804  lipid-A-disaccharide synthase  32.41 
 
 
351 aa  118  1.9999999999999998e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00956685  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0926  lipid-A-disaccharide synthase  35.18 
 
 
324 aa  118  1.9999999999999998e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2258  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  33.65 
 
 
353 aa  117  3e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2347  lipid-A-disaccharide synthase  34.39 
 
 
355 aa  117  3e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0649  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  35.44 
 
 
332 aa  117  3e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0489  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  35.44 
 
 
332 aa  117  3e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1706  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  29.81 
 
 
339 aa  117  5e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.944594  normal  0.56744 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0771  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  31.63 
 
 
360 aa  116  5e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1669  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  29.53 
 
 
339 aa  116  5e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1770  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  32.36 
 
 
333 aa  116  6.9999999999999995e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2794  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  36.63 
 
 
379 aa  116  7.999999999999999e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2207  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  34.64 
 
 
331 aa  115  8.999999999999998e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1713  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  31.67 
 
 
326 aa  115  1.0000000000000001e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2371  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  30.86 
 
 
346 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2699  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  36.7 
 
 
378 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0722081  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1684  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  29.53 
 
 
339 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0526  lipid-A-disaccharide synthase  29.78 
 
 
355 aa  113  5e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2576  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  31.99 
 
 
328 aa  113  7.000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1960  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  31.99 
 
 
328 aa  113  7.000000000000001e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.618751  normal  0.512774 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2664  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  31.99 
 
 
328 aa  113  7.000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2152  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  30.13 
 
 
345 aa  112  1.0000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.101356  normal  0.391691 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2673  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  28.97 
 
 
335 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.112968  normal  0.034202 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1434  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  35.92 
 
 
331 aa  111  2.0000000000000002e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.463776  normal  0.49685 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0346  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  36.24 
 
 
381 aa  110  3e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.328833  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0633  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  33.43 
 
 
336 aa  110  5e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.368441  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2042  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  31.37 
 
 
333 aa  110  5e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1781  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  31.07 
 
 
305 aa  109  6e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.168745  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2801  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  29.84 
 
 
335 aa  109  7.000000000000001e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0230  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  27.53 
 
 
340 aa  109  7.000000000000001e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.137387  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1373  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  31.45 
 
 
331 aa  108  2e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.324921  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2059  lipid-A-disaccharide synthase  32.38 
 
 
361 aa  108  2e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.46452 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2583  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  29.97 
 
 
335 aa  108  2e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.154264 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1434  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  32.89 
 
 
325 aa  108  2e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.436451  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1284  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  33.23 
 
 
771 aa  107  3e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.155348  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0575  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  32.47 
 
 
401 aa  107  4e-22  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0656  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  27.76 
 
 
331 aa  107  4e-22  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.137335  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18940  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  29.43 
 
 
384 aa  107  4e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2676  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  30.35 
 
 
338 aa  106  7e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.270569  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1245  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  34.11 
 
 
327 aa  106  7e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0439  lipid-A-disaccharide synthase  32.26 
 
 
343 aa  105  9e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.422513  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1508  lipid-A-disaccharide synthase  33.14 
 
 
329 aa  104  2e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.1102  normal  0.298775 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2308  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  31.72 
 
 
337 aa  104  3e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.949257  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2421  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  29.02 
 
 
335 aa  103  5e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>