43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_3605 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_3605  C_GCAxxG_C_C family protein  100 
 
 
148 aa  307  4e-83  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2420  C_GCAxxG_C_C family protein  73.1 
 
 
149 aa  237  5e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3781  C_GCAxxG_C_C family protein  64.79 
 
 
146 aa  176  8e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.018786  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2887  C_GCAxxG_C_C family protein  59.59 
 
 
150 aa  161  3e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1476  C_GCAxxG_C_C family protein  35.53 
 
 
157 aa  95.1  3e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.342381  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0865  C_GCAxxG_C_C family protein  36.92 
 
 
182 aa  87.8  4e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.578552  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3529  C_GCAxxG_C_C family protein  35.04 
 
 
146 aa  86.7  9e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1199  C_GCAxxG_C_C family protein  30.83 
 
 
160 aa  79.7  0.00000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0395  hypothetical protein  32.62 
 
 
142 aa  77.8  0.00000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.289107  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1171  C_GCAxxG_C_C family protein  33.77 
 
 
257 aa  77.4  0.00000000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.592413 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0831  C_GCAxxG_C_C family protein  34.53 
 
 
154 aa  76.3  0.0000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000034756 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1302  C_GCAxxG_C_C family protein  27.07 
 
 
153 aa  73.9  0.0000000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0554  C_GCAxxG_C_C family protein  33.09 
 
 
183 aa  73.6  0.0000000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.231006  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0510  C_GCAxxG_C_C family protein  32.37 
 
 
164 aa  69.3  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00782418 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0479  C_GCAxxG_C_C family protein  28.47 
 
 
153 aa  66.6  0.0000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0224  C_GCAxxG_C_C family protein  28.91 
 
 
161 aa  63.2  0.000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3850  C_GCAxxG_C_C family protein  24.82 
 
 
142 aa  62.8  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1447  hypothetical protein  31.75 
 
 
121 aa  62  0.000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.281245  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0045  redox family protein  33.93 
 
 
148 aa  62  0.000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000553397  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2556  C_GCAxxG_C_C family protein  31.62 
 
 
146 aa  61.2  0.000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1937  C_GCAxxG_C_C family protein  29.93 
 
 
148 aa  61.6  0.000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0041  C_GCAxxG_C_C family protein  35.24 
 
 
148 aa  61.6  0.000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.00000000104538  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_44  redox protein  31.25 
 
 
148 aa  60.5  0.000000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000630666  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1719  hypothetical protein  30.95 
 
 
121 aa  60.5  0.000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.408454  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0233  C_GCAxxG_C_C family protein  27.08 
 
 
156 aa  59.7  0.00000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00763518  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0747  C_GCAxxG_C_C family protein  32.69 
 
 
327 aa  59.3  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2781  C_GCAxxG_C_C family protein  37.5 
 
 
148 aa  58.9  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1399  C_GCAxxG_C_C family protein  26.76 
 
 
172 aa  57.4  0.00000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0718926  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2280  hypothetical protein  27.86 
 
 
134 aa  53.9  0.0000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3274  C_GCAxxG_C_C family protein  27.17 
 
 
136 aa  53.5  0.000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2578  hypothetical protein  27.86 
 
 
134 aa  53.5  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3934  C_GCAxxG_C_C family protein  30.15 
 
 
142 aa  52.8  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0137469 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2054  hypothetical protein  28.71 
 
 
171 aa  48.5  0.00003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0460  hypothetical protein  31.07 
 
 
152 aa  46.6  0.0001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3143  C_GCAxxG_C_C family protein  24.73 
 
 
149 aa  45.8  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2625  C_GCAxxG_C_C family protein  31.76 
 
 
179 aa  45.8  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1313  hypothetical protein  24.43 
 
 
148 aa  44.7  0.0004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.100435  hitchhiker  0.000167692 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0477  C_GCAxxG_C_C family protein  38.6 
 
 
156 aa  42.4  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.664237  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1002  hypothetical protein  23.85 
 
 
147 aa  42.7  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4227  C_GCAxxG_C_C family protein  29.29 
 
 
125 aa  40.8  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00303103  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0465  C_GCAxxG_C_C family protein  24.73 
 
 
146 aa  40.8  0.007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  hitchhiker  0.00655553 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1769  hypothetical protein  25.78 
 
 
291 aa  40.8  0.007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.06784  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3126  hypothetical protein  27.34 
 
 
142 aa  40.4  0.008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>