40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_0773 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013216  Dtox_0773  regulatory protein, FmdB family  100 
 
 		 84 aa  168  2e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1172  FmdB family regulatory protein  47.14 
 
 		 71 aa  68.6  0.00000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3290  hypothetical protein  48.08 
 
 		 66 aa  52.8  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0493619  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2673  regulatory protein, FmdB family  35.14 
 
 		 66 aa  52.8  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0890211  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2577  regulatory protein, FmdB family  35.14 
 
 		 66 aa  52.8  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.923683  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0594  FmdB family regulatory protein  41.67 
 
 		 91 aa  51.2  0.000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.997362 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0086  regulatory protein, FmdB family  38.6 
 
 		 81 aa  49.7  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.576483  hitchhiker  0.00282506 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2088  regulatory protein, FmdB family  44.19 
 
 		 79 aa  49.3  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1775  FmdB family regulatory protein  46.51 
 
 		 69 aa  48.5  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1596  hypothetical protein  34.25 
 
 		 81 aa  47.8  0.00005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000473565  normal  0.661888 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4083  FmdB family regulatory protein  35.19 
 
 		 75 aa  45.1  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.382844 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3203  hypothetical protein  36.84 
 
 		 77 aa  45.4  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2195  FmdB family regulatory protein  30.3 
 
 		 80 aa  45.1  0.0004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2482  FmdB family regulatory protein  35.56 
 
 		 65 aa  44.7  0.0004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.416517  normal  0.0908176 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1891  FmdB family regulatory protein  38 
 
 		 76 aa  44.3  0.0006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00708289  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0880  FmdB family regulatory protein  38.3 
 
 		 78 aa  43.9  0.0007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0842902 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1009  hypothetical protein  36.59 
 
 		 73 aa  43.9  0.0007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0112421  normal  0.0977193 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0524  regulatory protein, FmdB family  36.25 
 
 		 80 aa  43.5  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1512  hypothetical protein  43.48 
 
 		 94 aa  43.5  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000051814  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0746  hypothetical protein  42.31 
 
 		 70 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2352  FmdB family regulatory protein  48.84 
 
 		 83 aa  42.4  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1304  FmdB family regulatory protein  32.39 
 
 		 68 aa  42.7  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00793383  normal  0.147825 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1459  hypothetical protein  37.5 
 
 		 78 aa  42  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00501931 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0363  regulatory protein, FmdB family  31.76 
 
 		 71 aa  42.4  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.232661  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2431  FmdB family regulatory protein  47.06 
 
 		 82 aa  42  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000696876  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0829  hypothetical protein  41.86 
 
 		 81 aa  41.6  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000000274329  normal  0.31982 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2281  regulatory protein, FmdB family  37.21 
 
 		 118 aa  41.6  0.004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2620  hypothetical protein  39.62 
 
 		 75 aa  41.6  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3109  glutamine amidotransferase, class-II  30.95 
 
 		 117 aa  41.6  0.004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1286  regulatory protein, FmdB family  44.19 
 
 		 76 aa  41.6  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.497457  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2275  regulatory protein, FmdB family  33.33 
 
 		 66 aa  40.8  0.006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3139  regulatory protein, FmdB family  38.3 
 
 		 115 aa  40.8  0.006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1074  regulatory protein, FmdB family  38.64 
 
 		 73 aa  40.8  0.006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3061  FmdB family regulatory protein  39.53 
 
 		 76 aa  40.8  0.007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000726453  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0427  FmdB family regulatory protein  30 
 
 		 99 aa  40.8  0.007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.953461  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2457  FmdB family regulatory protein  38.64 
 
 		 77 aa  40.4  0.008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.165864 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2391  regulatory protein, FmdB family  44.19 
 
 		 109 aa  40.4  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.873408  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2303  regulatory protein, FmdB family  44.19 
 
 		 109 aa  40.4  0.008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0327558  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1776  glutamine amidotransferase, class-II  40.43 
 
 		 124 aa  40  0.01  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0212304  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1544  regulatory protein, FmdB family  38.64 
 
 		 72 aa  40  0.01  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00857595  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>