22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_3980 on replicon NC_009957
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009957  Dshi_3980  VirB8 family protein  100 
 
 		 217 aa  434  1e-121  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.505603  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3815  VirB8  96.31 
 
 		 217 aa  390  1e-108  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.626186  normal  0.202746 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3645  VirB8 family protein  97.24 
 
 		 218 aa  391  1e-108  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0668357 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0682  VirB8 family protein  29.57 
 
 		 223 aa  69.3  0.00000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.765146  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6400  VirB8 family protein  28.16 
 
 		 231 aa  67.4  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4558  VirB8 family protein  29.94 
 
 		 231 aa  63.2  0.000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.837968  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9815  Type IV secretory pathway component VirB8  27.4 
 
 		 230 aa  59.3  0.00000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5081  VirB8 family protein  28.21 
 
 		 223 aa  58.2  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.477403 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4440  VirB8  25.93 
 
 		 238 aa  56.2  0.0000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4173  VirB8  27.44 
 
 		 231 aa  56.2  0.0000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.717202  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4341  VirB8  26.58 
 
 		 223 aa  55.8  0.0000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0342732  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0251  Type IV secretory pathway AvhB8 protein  26.28 
 
 		 223 aa  52.4  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6155  type IV secretion system protein VirB8  28.04 
 
 		 237 aa  51.2  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.141854  normal  1 
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4372  VirB8 family protein  25 
 
 		 228 aa  51.2  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.929771 
 
 
-
 
NC_008770  CJJ81176_pVir0001  VirB8  24.38 
 
 		 225 aa  50.8  0.00002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5004  VirB8 family protein  24.17 
 
 		 229 aa  48.9  0.00005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.04145  normal  0.518843 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6211  VirB8 family protein  26.48 
 
 		 244 aa  47  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0724347 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0176  cmgB8  28.37 
 
 		 225 aa  45.1  0.001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.579945  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2448  VirB8 family protein  28.1 
 
 		 351 aa  42  0.006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0057  type IV secretion system protein VirB8  26 
 
 		 239 aa  41.6  0.008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0062  type IV secretion system protein VirB8  26 
 
 		 239 aa  42  0.008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.622511  n/a   
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a016  conjugal transfer protein TraJ/VirB8  26.06 
 
 		 202 aa  41.6  0.008  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>