63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_3392 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_3392  hypothetical protein  100 
 
 		 96 aa  200  5e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6277  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  50 
 
 		 97 aa  87  8e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000255974  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4706  antibiotic biosynthesis monooxygenase  42.47 
 
 		 100 aa  68.2  0.00000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00216246 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1741  hypothetical protein  38.64 
 
 		 100 aa  67.8  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3619  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  42.67 
 
 		 103 aa  66.6  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4705  antibiotic biosynthesis monooxygenase  50 
 
 		 97 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.190187  normal  0.040711 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1703  antibiotic biosynthesis monooxygenase  43.06 
 
 		 100 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.12592 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6899  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  39.78 
 
 		 109 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20250  hypothetical protein  37.5 
 
 		 100 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.25525  normal  0.833496 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0727  antibiotic biosynthesis monooxygenase  39.73 
 
 		 100 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.235106  normal  0.0173261 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4571  antibiotic biosynthesis monooxygenase  39.73 
 
 		 100 aa  64.3  0.0000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.683113  normal  0.464576 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0564  antibiotic biosynthesis monooxygenase  40.24 
 
 		 110 aa  63.5  0.0000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0547682  normal  0.294784 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0535  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  37.04 
 
 		 101 aa  63.5  0.0000000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.494763  normal  0.309514 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0842  antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.59 
 
 		 105 aa  58.5  0.00000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1575  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.73 
 
 		 106 aa  54.3  0.0000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0204  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.47 
 
 		 99 aa  51.6  0.000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0841  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.63 
 
 		 137 aa  52  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0327839 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0491  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.53 
 
 		 110 aa  50.1  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1816  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  37.5 
 
 		 104 aa  47.8  0.00006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.148462  normal  1 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_38325  predicted protein  44.26 
 
 		 117 aa  47.4  0.00007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.910141  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0437  hypothetical protein  34.18 
 
 		 98 aa  46.6  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0873  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.76 
 
 		 107 aa  46.2  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3152  antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.78 
 
 		 102 aa  46.2  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.756738  normal  0.106564 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3507  hypothetical protein  33.78 
 
 		 102 aa  46.2  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4617  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.21 
 
 		 104 aa  45.4  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0418  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  27.03 
 
 		 104 aa  44.7  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.324945  hitchhiker  0.00133248 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1527  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.23 
 
 		 111 aa  44.3  0.0006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3087  antibiotic biosynthesis monooxygenase  26.67 
 
 		 128 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.804464  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5778  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  35 
 
 		 110 aa  44.3  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2501  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.67 
 
 		 96 aa  44.3  0.0006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.180823  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3744  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.29 
 
 		 95 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4074  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.43 
 
 		 94 aa  43.5  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.296978 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2430  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.08 
 
 		 150 aa  43.1  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.343798 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2802  antibiotic biosynthesis monooxygenase  27.96 
 
 		 99 aa  43.1  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.200278 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3933  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.43 
 
 		 94 aa  43.5  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0875  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.76 
 
 		 106 aa  42.7  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.524457 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0640  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.42 
 
 		 96 aa  42  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.83774  hitchhiker  0.00200112 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0056  autoinducer-2 (AI-2) modifying protein LsrG  31.51 
 
 		 100 aa  42.7  0.002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.140027  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2453  antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.24 
 
 		 96 aa  42.4  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.237842  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0666  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.42 
 
 		 96 aa  42.7  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2292  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  27.96 
 
 		 99 aa  42.4  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.613637  n/a   
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_8324  predicted protein  31.88 
 
 		 68 aa  42.7  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.817984  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3881  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.79 
 
 		 94 aa  42  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000774997 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55140  hypothetical protein  35.38 
 
 		 98 aa  42  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000327578 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3875  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  24.75 
 
 		 101 aa  41.6  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.988198 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03061  hypothetical protein  32.58 
 
 		 94 aa  42  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3958  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.79 
 
 		 94 aa  42  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3531  autoinducer-2 (AI-2) modifying protein LsrG  33.33 
 
 		 97 aa  41.6  0.004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.291132 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0311  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.65 
 
 		 99 aa  41.2  0.005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1875  antibiotic biosynthesis monooxygenase  25 
 
 		 252 aa  40.8  0.006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2795  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.91 
 
 		 100 aa  40.8  0.006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4371  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.34 
 
 		 103 aa  40.8  0.006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1842  antibiotic biosynthesis monooxygenase  26.67 
 
 		 96 aa  40.8  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0851122  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0824  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.77 
 
 		 97 aa  40.8  0.007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.841443  normal  0.172785 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3437  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.15 
 
 		 94 aa  40.8  0.007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4478  autoinducer-2 (AI-2) modifying protein LsrG  33.33 
 
 		 109 aa  40.8  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.519027  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0997  antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.92 
 
 		 103 aa  40.8  0.007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0138004  normal  0.714993 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4295  autoinducer-2 (AI-2) modifying protein LsrG  33.33 
 
 		 109 aa  40.4  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4410  autoinducer-2 (AI-2) modifying protein LsrG  33.33 
 
 		 109 aa  40.4  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.266111  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2954  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.73 
 
 		 112 aa  40.4  0.009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5952  antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.33 
 
 		 99 aa  40  0.009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.49186  normal  0.673339 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4408  autoinducer-2 (AI-2) modifying protein LsrG  33.33 
 
 		 97 aa  40  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.884642  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4325  autoinducer-2 (AI-2) modifying protein LsrG  33.33 
 
 		 97 aa  40  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>