282 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_2710 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_2710  hypothetical protein  100 
 
 		 401 aa  816    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1860  HI0933-like protein  66.4 
 
 		 381 aa  509  1e-143  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.479593  normal  0.0118098 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0680  HI0933-like protein  64.18 
 
 		 394 aa  483  1e-135  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.192167 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1798  hypothetical protein  60.05 
 
 		 392 aa  473  1e-132  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1349  hypothetical protein  58.78 
 
 		 393 aa  455  1e-127  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1392  hypothetical protein  58.27 
 
 		 393 aa  449  1e-125  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.574952  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2183  hypothetical protein  58.65 
 
 		 396 aa  451  1e-125  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.286863 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2623  hypothetical protein  58.02 
 
 		 393 aa  444  1e-123  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0303  hypothetical protein  57.54 
 
 		 394 aa  434  1e-120  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.918662  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0398  HI0933 family protein  59.25 
 
 		 406 aa  430  1e-119  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00801709 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0801  hypothetical protein  60.48 
 
 		 395 aa  426  1e-118  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3274  hypothetical protein  55.14 
 
 		 396 aa  422  1e-117  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.142928  normal  0.877884 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0366  HI0933 family protein  57.64 
 
 		 406 aa  422  1e-117  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.128737 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1707  HI0933-like protein  57.04 
 
 		 399 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.105129 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3791  hypothetical protein  51.6 
 
 		 398 aa  408  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00166  predicted flavoprotein  52.67 
 
 		 393 aa  410  1e-113  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3901  hypothetical protein  51.6 
 
 		 398 aa  408  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.150346  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3858  hypothetical protein  51.6 
 
 		 398 aa  409  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00469108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1513  hypothetical protein  55.44 
 
 		 392 aa  408  1.0000000000000001e-112  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.86402  normal  0.0796345 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2680  hypothetical protein  51.02 
 
 		 393 aa  406  1.0000000000000001e-112  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2832  flavoprotein  55.7 
 
 		 392 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.838235  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3962  hypothetical protein  51.35 
 
 		 398 aa  407  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.327369  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3781  hypothetical protein  51.6 
 
 		 398 aa  407  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2552  hypothetical protein  50.25 
 
 		 393 aa  404  1e-111  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4118  HI0933 family protein  51.87 
 
 		 394 aa  403  1e-111  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4204  HI0933 family protein  51.98 
 
 		 399 aa  404  1e-111  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1463  hypothetical protein  55.7 
 
 		 392 aa  404  1e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.261664  normal  0.428497 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4487  HI0933 family protein  51.73 
 
 		 399 aa  400  9.999999999999999e-111  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0662  hypothetical protein  51.79 
 
 		 392 aa  396  1e-109  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0741866  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4094  hypothetical protein  49.88 
 
 		 460 aa  395  1e-109  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0123  hypothetical protein  49.88 
 
 		 460 aa  397  1e-109  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.291133  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4032  hypothetical protein  49.88 
 
 		 398 aa  397  1e-109  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0375  HI0933-like protein  51.15 
 
 		 393 aa  395  1e-109  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0512  hypothetical protein  52.06 
 
 		 410 aa  396  1e-109  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.246775  normal  0.372207 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4688  hypothetical protein  52.55 
 
 		 413 aa  395  1e-109  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07280  hypothetical protein  51.79 
 
 		 392 aa  396  1e-109  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2364  hypothetical protein  52.36 
 
 		 406 aa  394  1e-108  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.709721  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0476  hypothetical protein  52.79 
 
 		 394 aa  394  1e-108  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.900431  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2547  hypothetical protein  52.66 
 
 		 394 aa  392  1e-108  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.374165  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1831  HI0933-like protein  54.59 
 
 		 402 aa  394  1e-108  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  decreased coverage  0.000611752  normal  0.363311 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28030  HI0933-like protein  51.14 
 
 		 411 aa  391  1e-107  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5002  hypothetical protein  52.09 
 
 		 393 aa  388  1e-107  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.32275  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1400  hypothetical protein  52.81 
 
 		 415 aa  391  1e-107  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.615162  normal  0.401096 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3802  hypothetical protein  51.78 
 
 		 394 aa  390  1e-107  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5249  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like  49.49 
 
 		 392 aa  388  1e-107  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1238  hypothetical protein  56.28 
 
 		 414 aa  391  1e-107  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2824  HI0933-like protein  54.73 
 
 		 405 aa  389  1e-107  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3945  hypothetical protein  52.45 
 
 		 405 aa  388  1e-107  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0599  HI0933 family protein  52.03 
 
 		 392 aa  391  1e-107  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.623073 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4953  hypothetical protein  51.31 
 
 		 393 aa  388  1e-106  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.683781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4826  hypothetical protein  51.57 
 
 		 393 aa  388  1e-106  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.270305  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3931  HI0933 family protein  51.13 
 
 		 397 aa  387  1e-106  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03341  predicted oxidoreductase with FAD/NAD(P)-binding domain  50.39 
 
 		 400 aa  383  1e-105  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.542782  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0223  HI0933 family protein  50.39 
 
 		 400 aa  383  1e-105  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2530  FAD-dependent oxidoreductase  55.64 
 
 		 407 aa  382  1e-105  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00536  oxidoreductase  50.5 
 
 		 397 aa  383  1e-105  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0156  hypothetical protein  51.65 
 
 		 392 aa  384  1e-105  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2030  HI0933 family protein  54.35 
 
 		 407 aa  381  1e-105  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3781  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  50.64 
 
 		 400 aa  383  1e-105  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2884  HI0933-like protein  53.51 
 
 		 414 aa  382  1e-105  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3830  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  50.64 
 
 		 400 aa  383  1e-105  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4838  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  50.64 
 
 		 400 aa  383  1e-105  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4466  hypothetical protein  50.76 
 
 		 394 aa  384  1e-105  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.119173 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0044  hypothetical protein  50.76 
 
 		 394 aa  382  1e-105  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03294  hypothetical protein  50.39 
 
 		 400 aa  383  1e-105  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.555868  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0224  hypothetical protein  50.39 
 
 		 400 aa  381  1e-104  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0335  hypothetical protein  55.67 
 
 		 407 aa  380  1e-104  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2388  FAD-dependent oxidoreductase  55.67 
 
 		 407 aa  380  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.396449  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1516  hypothetical protein  55.67 
 
 		 407 aa  380  1e-104  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.631373  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0837  hypothetical protein  55.67 
 
 		 407 aa  380  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2208  hypothetical protein  53.06 
 
 		 406 aa  381  1e-104  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3779  hypothetical protein  53.72 
 
 		 405 aa  379  1e-104  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.28946  normal  0.0295291 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0368  FAD-dependent oxidoreductase  55.67 
 
 		 407 aa  380  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1709  hypothetical protein  55.67 
 
 		 407 aa  380  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2423  HI0933 family protein  53.7 
 
 		 407 aa  379  1e-104  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3974  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  50.39 
 
 		 400 aa  381  1e-104  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3691  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  50.39 
 
 		 400 aa  381  1e-104  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0047  hypothetical protein  50.25 
 
 		 394 aa  378  1e-104  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00322221 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001943  NAD(FAD)-utilizing dehydrogenase  50.25 
 
 		 397 aa  379  1e-104  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3253  hypothetical protein  53.72 
 
 		 405 aa  380  1e-104  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0198176 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0055  hypothetical protein  49.75 
 
 		 394 aa  379  1e-104  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000153695 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2434  hypothetical protein  50 
 
 		 398 aa  375  1e-103  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0145  hypothetical protein  48.98 
 
 		 394 aa  376  1e-103  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0047  hypothetical protein  48.98 
 
 		 394 aa  375  1e-103  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0054  hypothetical protein  49.75 
 
 		 396 aa  377  1e-103  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4873  hypothetical protein  50 
 
 		 394 aa  377  1e-103  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3645  hypothetical protein  53.85 
 
 		 406 aa  376  1e-103  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0617  hypothetical protein  56.05 
 
 		 407 aa  375  1e-103  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4483  HI0933-like protein  53.85 
 
 		 406 aa  376  1e-103  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2097  hypothetical protein  51.57 
 
 		 419 aa  375  1e-103  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.234168  normal  0.897923 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0049  hypothetical protein  50.25 
 
 		 394 aa  377  1e-103  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000378391 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3882  hypothetical protein  53.85 
 
 		 406 aa  376  1e-103  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.151985 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0051  hypothetical protein  48.98 
 
 		 394 aa  373  1e-102  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000135975 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4328  hypothetical protein  48.98 
 
 		 394 aa  374  1e-102  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1635  hypothetical protein  45.81 
 
 		 405 aa  374  1e-102  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6778  HI0933 family protein  54.21 
 
 		 390 aa  373  1e-102  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00763254 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1725  hypothetical protein  51.89 
 
 		 397 aa  373  1e-102  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.685186 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4017  hypothetical protein  49.74 
 
 		 393 aa  374  1e-102  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2439  hypothetical protein  51.4 
 
 		 397 aa  373  1e-102  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0064  hypothetical protein  49.37 
 
 		 397 aa  372  1e-102  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>